تآثروم

التآثروم (بالإنجليزية: Interactome)‏ في علم الأحياء الجزيئي هو جميع التآثرات في خلية معينة، ويشير المصطلح بشكل خاص إلى التآثرات الفيزيائية بين الجزيئات (مثل التآثرات بين البروتينات والتي تعرف بتآثرات البروتين-بروتين، أو بين جزيئات صغيرة والبروتينات[2]) لكن يمكن أن يشمل كذلك مجموعة التآثرات غير المباشرة بين الجينات (التآثرات الجينية). التآثرومات المبنية على تآثرات البروتين بروتين يجب أن تُلحَق ببروتيوم الأجناس ذات الصلة بها وذلك في سبيل توفير منظر عام ("أوميكس") لجميع التآثرات الجزيئية الممكنة التي يمكن للبروتين القيام بها.[3]

جزء من تآثروم الجين DISC1 (100 من 528 جين)، أسماء الجينات تحيط بها إطارات والتآثرات ممثلة بخطوط بين الجينات. من هانا وبورتيوس 2009.[1]

تمت صياغة المصطلح «إنتراكتوم» سنة 1999 بواسطة مجموعة من العلماء الفرنسيين يقودهم برنارد جاك. [4] رياضيا، يمكن تمثيل التآثرومات برسوم بيانية، ورغم إمكانية وصف التآثرومات بأنها شبكات بيولوجية، إلا أنه لا يجب خلطها مع شبكات أخرى مثل الشبكات العصبية أو الشبكات الغذائية.

مراجع

Hennah W, Porteous D (2009)، Reif A (المحرر)، "The DISC1 pathway modulates expression of neurodevelopmental, synaptogenic and sensory perception genes"، PLoS ONE، 4 (3): e4906، Bibcode:2009PLoSO...4.4906H، doi:10.1371/journal.pone.0004906، PMC 2654149، PMID 19300510.
Wang L, Eftekhari P, Schachner D, Ignatova ID, Palme V, Schilcher N, Ladurner A, Heiss EH, Stangl H, Dirsch VM, Atanasov AG. Novel interactomics approach identifies ABCA1 as direct target of evodiamine, which increases macrophage cholesterol efflux. Sci Rep. 2018 Jul 23;8(1):11061. doi: 10.1038/s41598-018-29281-1. نسخة محفوظة 19 ديسمبر 2018 على موقع واي باك مشين.
Alonso-López D, Gutiérrez MA, Lopes KP, Prieto C, Santamaria R, De Las Rivas J (2016)، "APID interactomes: providing proteome-based interactomes with controlled quality for multiple species and derived networks"، Nucleic Acids Res.، 44 (W529–35): W529–35، doi:10.1093/nar/gkw363، PMC 4987915، PMID 27131791.
Sanchez C؛ Lachaize C؛ Janody F؛ وآخرون (يناير 1999)، "Grasping at molecular interactions and genetic networks in Drosophila melanogaster using FlyNets, an Internet database"، Nucleic Acids Res.، 27 (1): 89–94، doi:10.1093/nar/27.1.89، PMC 148104، PMID 9847149.

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid19300510-1] Hennah W, Porteous D (2009)، Reif A (المحرر)، "The DISC1 pathway modulates expression of neurodevelopmental, synaptogenic and sensory perception genes"، PLoS ONE، 4 (3): e4906، Bibcode:2009PLoSO...4.4906H، doi:10.1371/journal.pone.0004906، PMC 2654149، PMID 19300510.

[2] Wang L, Eftekhari P, Schachner D, Ignatova ID, Palme V, Schilcher N, Ladurner A, Heiss EH, Stangl H, Dirsch VM, Atanasov AG. Novel interactomics approach identifies ABCA1 as direct target of evodiamine, which increases macrophage cholesterol efflux. Sci Rep. 2018 Jul 23;8(1):11061. doi: 10.1038/s41598-018-29281-1. نسخة محفوظة 19 ديسمبر 2018 على موقع واي باك مشين.

[3] Alonso-López D, Gutiérrez MA, Lopes KP, Prieto C, Santamaria R, De Las Rivas J (2016)، "APID interactomes: providing proteome-based interactomes with controlled quality for multiple species and derived networks"، Nucleic Acids Res.، 44 (W529–35): W529–35، doi:10.1093/nar/gkw363، PMC 4987915، PMID 27131791.

[pmid9847149-4] Sanchez C؛ Lachaize C؛ Janody F؛ وآخرون (يناير 1999)، "Grasping at molecular interactions and genetic networks in Drosophila melanogaster using FlyNets, an Internet database"، Nucleic Acids Res.، 27 (1): 89–94، doi:10.1093/nar/27.1.89، PMC 148104، PMID 9847149.