Bacteroidetes

Bacteroidetes o Bacteroidota son un filo grande de bacterias gramnegativas con amplia distribución en el medio ambiente, incluyendo el suelo, sedimentos, lagos, agua de mar y el tracto digestivo de los animales.

Bacteroidetes

Taxonomía
Dominio: Bacteria
Superfilo: Grupo FCB
Filo: Bacteroidetes
Clases[1][2]

El grupo incluye seis clases. La clase Bacteroidia es con diferencia la más estudiada e incluye el género Bacteroides, un organismo abundante en las heces de animales de sangre caliente incluyendo los seres humanos, y Porphyromonas, un grupo de organismos que habita en la cavidad bucal humana. Los miembros del género Bacteroides son patógenos oportunistas. Las otras clases de Bacteroidetes raramente son patógenas para los seres humanos. Especies representativas de los órdenes Flavobacteriales, Sphingobacteriales y Cytophagales, son Flavobacterium mizutaii, Sphingobacterium antarcticum y Cytophaga columnaris respectivamente.

El investigador Jeffrey Gordon et al. descubrieron que los seres humanos y los ratones obesos tienen una flora intestinal con un porcentaje más bajo de bacterias Bacteroidetes y más alto de Firmicutes. Sin embargo, se desconoce si Bacteroidetes previene la obesidad o que simplemente esta flora intestinal es seleccionada por las condiciones intestinales de los no obesos.[3][4][5]

Filogenia

Varias proteínas son comunes de flavobacteriales y bacteroidales, indicando que estos órdenes comparten un común ancestro excluyendo otros bacteroidetes.[6] El ancestro común de Bacteroidetes parece haber sido un termófilo dada la posición basal de los cuatro grupos termófilos. Chlorobia que antiguamente se consideraba un filo independiente, adquirió la fotosíntesis de un antepasado compartido con los bacteroidetes tradicionales (no termófilos).

Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:[7][8]

Bacteroidetes
 
 

Kapabacteria

 
 
 

Kryptonia

 
 

Ignavibacteria

 
 
 
 
 

Chlorobia

 
 
 

Rhodothermia

 
Bacteroidia
 

 Cytophagales

 
 
 

 Chitinophagales

 
 
 

 Sphingobacteriales

 
 
 

 Bacteroidales

 
 

 Flavobacteriales

 
 
 
 
 
 
 
 

Referencias
  1. Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz (2018). A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Biorxiv.
  2. Genome database. Bacteroidota.
  3. Ley R, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone C, Knight R, Gordon J (2005). «Obesity alters gut microbial ecology». Proc Natl Acad Sci U S A 102 (31): 11070-5. PMID 16033867.
  4. Ley R, Turnbaugh P, Klein S, Gordon J (2006). «Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity». Nature 444 (7122): 1022-3. PMID 17183309.
  5. Turnbaugh P, Ley R, Mahowald M, Magrini V, Mardis E, Gordon J (2006). «An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest». Nature 444 (7122): 1027-31. PMID 17183312.
  6. Gupta, R. S. and Lorenzini, E. (2007). Phylogeny and molecular signatures (conserved proteins and indels) that are specific for the Bacteroidetes and Chlorobi species. BMC Evolutionary Biology. 7:71. doi:10.1186/1471-2148-7-71.
  7. Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246.
  8. «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.

Enlaces externos
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