Copa Intertoto de la UEFA 1998

A diferencia de todas las ediciones anteriores, en ésta no se iba a jugar la fase de grupos por primera vez en la historia del torneo, ya que se jugó bajo un sistema de eliminación directa a partidos de ida y vuelta, en la que los ganadores avanzaron de ronda.

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Equipo 1	Agr.	Equipo 2	Ida	Vuelta
Altay	5–4	Shamrock Rovers	3–1	2–3
Ethnikos Achna	2–5	Örgryte	2–1	0–4
Dnepr-Transmash Mogilev	2–10	Debrecen	2–4	0–6
Leiftur	0–6	Vorskla Poltava	0–3	0–3
Ebbw Vale	1–9	Kongsvinger	1–6	0–3
Naţional Bucureşti	5–2	Hapoel Haifa	3–1	2–1
Austria Viena	2–3	Ruch Chorzów	0–1	2–2
Baltika Kaliningrad	5–1	Spartak Varna	4–0	1–1
Stabæk	3–5	Vojvodina	1–2	2–3
Hrvatski Dragovoljac	2–4	Lyngby	1–4	1–0
Rimavská Sobota	3–2	Omagh Town	1–0	2–2
Hobscheid	1–2	Hradec Králové	0–0	1–2
Diósgyőri	5–2	Sliema Wanderers	2–0	3–2
TPS	3–3 (v.)	Sion	0–1	3–2
Vágs Bóltfelag	1–6	Brno	0–3	1–3
St. Gallen	9–3	Viljandi Tulevik II	3–2	6–1
Dinaburg	2–5	Dukla Trencin	1–1	1–4
Inkaras Kaunas	1–1 (5-4 p.)	Baki Fahlasi	1–0	0–1
Torpedo Kutaisi	7–1	Erebuni-Homenmen Yerevan	6–0	1–1
Makedonija GjP	5–3	Olimpija Ljubljana	4–2	1–1

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