Cromodominio

Cromodominio
	; Estructura de un cromodominio de la proteína Polycomb HP1 en Drosophila.[1]
Identificadores
Símbolo	Cromodominio
Pfam	PF00385
InterPro	IPR000953
SMART	SM00298
PROSITE	PDOC00517
SCOP	1ap0
	Estructuras PDB disponibles: PDB 1q3l

Un cromodominio es un dominio proteico de unos 40-50 aminoácidos que es encontrado muy frecuentemente en proteínas relacionadas con el reordenamiento y la manipulación de la cromatina.

Este dominio se encuentra altamente conservado tanto en plantas como en animales, y es representado por un gran número de diferentes proteínas en multitud de genomas, como el del ratón. Algunos genes que contienen cromodominios transcriben diversas isoformas por splicing alternativo que omiten totalmente dichos cromodominios.[2] En mamíferos, las proteínas que contienen cromodominios están implicadas en la regulación de la expresión génica relacionada con el reordenamiento de la cromatina y la formación de regiones de heterocromatina.[3] Las proteínas que contienen cromodominios también unen histonas metiladas[4][5] y aparecen en los complejos de silenciamiento transcripcional mediado por ARN.[6]

Véase también

Bromodominio

Referencias

Min, J.; Zhang, Xu; RM (Agosto de 2003). «Structural basis for specific binding of Polycomb chromodomain to histone H3 methylated at Lys 27». Genes Dev. 17 (15): 1823-8. PMC 196225. PMID 12897052. doi:10.1101/gad.269603.
Tajul-Arifin K, Teasdale R, Ravasi T, Humel DA, RIKEN GER Group, GSL Members, Mattick JS. (2003). Identification and Analysis of Chromodomain-Containing Proteins Encoded in the Mouse Transcriptome. Genome Res 13:1416-1429. PMID 12819141
Jones DO, Cowell IG, Singh PB. (2000). Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression. Bioessays 22(2):124-37. PMID 10655032
Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED. (2002). Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9. Nature 416(6876):103-7. PMID 11882902
Jacobs SA, Khorasanizadeh S. (2002). Structure of HP1 chromodomain bound to a lysine 9-methylated histone H3 tail. Science 295(5562):2080-3. PMID 11859155
Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal S, Moazed D (2004). "RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex". Science 303 (5658): 672-6. PMID 14704433.

Enlaces externos

Datos: Q24740158

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[1] Min, J.; Zhang, Xu; RM (Agosto de 2003). «Structural basis for specific binding of Polycomb chromodomain to histone H3 methylated at Lys 27». Genes Dev. 17 (15): 1823-8. PMC 196225. PMID 12897052. doi:10.1101/gad.269603.

[Tajul-2] Tajul-Arifin K, Teasdale R, Ravasi T, Humel DA, RIKEN GER Group, GSL Members, Mattick JS. (2003). Identification and Analysis of Chromodomain-Containing Proteins Encoded in the Mouse Transcriptome. Genome Res 13:1416-1429. PMID 12819141

[Jones-3] Jones DO, Cowell IG, Singh PB. (2000). Mammalian chromodomain proteins: their role in genome organisation and expression. Bioessays 22(2):124-37. PMID 10655032

[Nielsen-4] Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED. (2002). Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9. Nature 416(6876):103-7. PMID 11882902

[Jacobs-5] Jacobs SA, Khorasanizadeh S. (2002). Structure of HP1 chromodomain bound to a lysine 9-methylated histone H3 tail. Science 295(5562):2080-3. PMID 11859155

[Verdel-6] Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal S, Moazed D (2004). "RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex". Science 303 (5658): 672-6. PMID 14704433.