Dependentiae

Dependentiae es un grupo candidato de bacterias recientemente propuesto, previamente conocido como TM6. Mediante el estudio de muestras ambientales de ARNm se ha encontrado que los miembros de este grupo se encuentran ampliamente distribuidos por el medio ambiente. Estas secuencias fueron identificadas primeramente en turberas y, posteriormente, en diversos hábitats tales como alfombras microbianas hipersalinas, manantiales sulfurosos, sedimentos ricos en arsénico y también en las biopelículas presentes en las redes de abastecimiento de agua, sumideros, etc. Los estudios genéticos revelan que el genoma de estos organismos es muy limitado, careciendo de la capacidad de sintetizar componentes esenciales tales como ácidos, lípidos y nucleótidos, por lo que probablemente sean dependientes de huéspedes protistas. El nombre dado al grupo refleja esta dependencia.[2]

Dependentiae
Taxonomía
Dominio: Bacteria
(sin rango) Gracilicutes
Filo: Proteobacteria[1]
Clase: Dependentiae
Yeoh et al. 2016
Familias
  • Babeliaceae
  • Chromulinavoraceae
  • Vermiphiliaceae

Probablemente es un clado relacionado con el supergrupo Patescibacteria, pero los análisis filogenéticos encontraron que forma parte de las proteobacterias estando cercano a las epsilonproteobacterias.[3][4] La única especie que se ha cultivado es el endopárasito de amebas Babela massiliensis. El análisis filogenético de los genes translocasa ATP/ADP sugiere que el linaje ancestral de Dependentiae también era parásito.

Referencias
  1. Thomas Cavalier-Smith & Ema E-Yung Chao (2020). Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (eukaryotes, archaebacteria). Linkspringer.
  2. Yeoh, Y. K., Sekiguchi, Y., Parks, D. H., & Hugenholtz, P. (2016). Comparative genomics of candidate phylum TM6 suggests that parasitism is widespread and ancestral in this lineage. Molecular biology and evolution, 33(4), 915-927.
  3. Zhu, Q., Mai, U., Pfeiffer, W. et al. (2019) «Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea». Nature Communications, 10: 5477
  4. Isabelle Pagnier et al. 2015, Babela massiliensis, a representative of a widespread bacterial phylum with unusual adaptations to parasitism in amoebae. Biol Direct. 2015; 10: 13. Mar 31. doi: 10.1186/s13062-015-0043-z PMCID: PMC4378268
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