NAMD

NAMD (Not (just) Another Molecular Dynamics program)[1] es un software para dinámica molecular en paralelo diseñado para simulaciones de alto desempeño de sistemas biomoleculares. Se hizo acreedor de un premio Gordon Bell en 2002.[2] Está basado en objetos paralelos Charm++ y es escalable a cientos de procesadores en plataformas de punta y decenas de procesadores en cómodos clusters usando ethernet gigabit. NAMD usa el popular programa de presentación gráfica molecular VMD para configurar la simulación y analizar las trayectorias, siendo también parcialmente compatible con AMBER, CHARMM y X-PLOR.

NAMD
Información general
Tipo de programa Dinámica molecular
Desarrollador Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) y The Parallel Programming Laboratory (PPL)
Licencia University of Illinois license
Estado actual Con soporte
Idiomas 1
Información técnica
Programado en C++
Plataformas admitidas «x86», «x86-64»
Versiones
Última versión estable 2.9 (info) ( 30 de abril de 2012 (11 años, 3 meses y 27 días))
Enlaces

Véase también

Referencias
  1. «Flexibility and Interoperability in a Parallel Molecular Dynamics Code» (postscript).
  2. «SC2002 Conference Concludes by Smashing Attendance Records, Rewarding Successes in High Performance Computing and Networking» (pdf). Archivado desde el original el 16 de julio de 2011. Consultado el 15 de marzo de 2013.
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