Nelson Bonilla

El futbolista fue convocado por el entrenador Miguel soriano para el compromiso de la jornada 15 del Torneo Apertura 2009. El juego se desarrolló el 11 de noviembre donde su equipo enfrentó al Alacranes del Norte en el Estadio Cuscatlán. Bonilla tuvo su debut como profesional, después de ingresar de cambio al minuto 65 , además debutó con un gol en la jornada 2 del apertura 2012 al minuto 51'. El marcador terminó en victoria con cifras de 2-0. Posteriormente sería tomado en cuenta en las alineaciones del entrenador.

El delantero sumó su primer equipo internacional tras fichar, en julio de 2014 con el FC Viitorul Constanța, de la Liga I de Rumania, llegando a un acuerdo de una temporada. El 1 de agosto de 2014, Bonilla debutó oficialmente con el club en la jornada dos del campeonato rumano entrando de sustitución a los 85' minutos en la derrota de su equipo ante el Rapid Bucarest. Él consiguió su primer gol para el club en la jornada 10, anotando el único gol de su equipo en la victoria contra el FC Astra 1-0. Bonilla consiguió su primer doblete en el fútbol europeo en el próximo encuentro ante el Suporter Club Oțelul Galați. Durante toda de la temporada fue un referente importante para el club, y siendo titular en casi todos los partidos. A mediados de 2015 es puesto transferible por el técnico Gheorghe Hagi, esto por aspectos extra deportivos con el jugador, llegando a un acuerdo con el club de residir su contrato de un año que había renovado a finales de mayo. Terminando la temporada como el mejor goleador del equipo con un monto de 7 goles y 24 partidos disputados. A mediados de 2015 el Petrolul Ploiesti, indicó su interés por bonilla para sumarlo a sus filas para la temporada 2015-2016 pero no llegaron a un acuerdo.

El 31 de agosto de 2015 se confirmó que Bonilla, como agente libre, firmó un contrato de dos años con el club de fútbol de Azerbaiyán Zira FK de la Liga Premier de Azerbaiyán. Recibió la camiseta con el número 9. Su encuentro de debut se llevó a cabo el 13 de septiembre, contra el Sumqayit FK en la jornada cuatro del campeonato. En esa ocasión, Nelson entró de titular y siendo sustituido por Rihairo Meulens al minuto 68', y el marcador culminó en igualdad de 0-0. El 3 de octubre, consiguió su primer gol en el club ante el Neftchi Baku PFK, el resultado fue de victoria 2-0. Bonilla acumuló 2,404 minutos en una temporada con el zira. En total tuvo 29 apariciones y anotó 14 goles, siendo el goleador del club y el segundo máximo goleador de la liga, marcando 8 dobletes y un hat trick este ante el Rəvan el 10 de abril de 2016, mientras que su conjunto terminó segundo en el campeonato con 62 puntos a 22 del líder y campeón Qarabağ con 82 puntos.

El 20 de mayo de 2016 se hace oficial su fichaje por el Clube Desportivo Nacional de Portugal, con un contrato de 3 temporadas por € 100 mil de euros. Debutó oficialmente con el club de madeira el 21 de agosto, en el Estádio Municipal de Arouca contra el F.C. Arouca. En esa ocasión, Bonilla entró de cambio por el venezolano Jhonder Cádiz al minuto 31', y el marcador culminó en derrota por 2-0. Anotó su primer gol con el nacional en la jornada cuatro el 10 de septiembre, contra el Os Belenenses a los 7' minutos en la derrota de su equipo por 2-1.

Nelson Bonilla ha anotado en su carrera un total de ocho dobletes y un hat-tricks o tripletes en partidos oficiales. Los cuatro dobletes han sido con el Zira FK, uno con FC Viitorul, dos con Alianza FC y uno con la Selección de El Salvador. Además, en una ocasión ha sido capaz de anotar tres goles con el Zira FK. En total, sus dobletes y tripletes le han otorgado cuarenta y tres goles.

Datos actualizados al último partido jugado el 23 de abril de 2016.

Dobletes y tripletes
	Fecha	Lugar	Equipo	Rival	Goles	Resultado	Competición
2	10/09/2011	Estadio Juan Francisco Barraza, San Miguel	Alianza Futbol Club	Club Deportivo Águila		2 - 1	Torneo Apertura 2011
2	22/07/2012	Estadio Cuscatlán, San Salvador	Alianza Fútbol Club	Santa Tecla Fútbol Club		7 - 1	Torneo Clausura 2012
2	18/01/2014	Estadio Stadionul Farul, Constanța, Rumania	FC Viitorul Constanța	Suporter Club Oțelul Galați		3 - 0	Liga I 2014/15
2	18/01/2014	Estadio Cuscatlan, San Salvador, El Salvador	Selección de El Salvador	San Cristóbal y Nieves		4 - 1	Eliminatorias Rusia 2018
2	28/10/2015	Zira Olympic Sport Complex Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Käpäz Ganja		2 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	02/12/2015	Estadio AZAL, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	AZAL PFC		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	15/02/2016	Bayil Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Ravan Baku FK		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	13/03/2016	Estadio Municipal de Qabala, Qabala, Azerbaiyán	Zira FK	Gabala FC		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
3	10/04/2016	Bayil Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Ravan Baku FK		0 - 4	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	10/02/2018	Thupatemee Stadium, Bangkok, Tailandia	Air Force Central	Sukhothai F.C.		1 - 2	Liga de Tailandia 2018
2	24/02/2018	Chon Buri Stadium, Chonburi, Tailandia	Chonburi F.C.	Sukhothai F.C.		1 - 2	Liga de Tailandia 2018
2	28/03/2018	Sattahip Stadium, Sattahip, Tailandia	Navy F.C.	Sukhothai F.C.		3 - 2	Liga de Tailandia 2018