Proteoarchaeota

Proteoarchaeota o Filarchaeota es un reino propuesto de arqueas antes llamado TACK, este último un acrónimo de Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota y Korarchaeota, los primeros grupos descubiertos. Taxonómicamente se ha sugerido que puede tener el rango de superfilo,[1] reino[2] o filo.[3] Se encuentran en diferentes ambientes comprendiendo desde termófilos acidófilos hasta mesófilos y psicrófilos y con diferentes tipos de metabolismo. Comprende a las arqueas con características más parecidas a los eucariotas.

Proteoarchaeota

Arquea Sulfolobus infectada con virus STSV-1.
Taxonomía
Dominio: Archaea
Reino: Proteoarchaeota
Petitjean et al. 2014
Filos

Este grupo está relacionado con el origen del primer ser eucariota, el análisis comparativo genómico ha revelado que hay varias proteínas homólogas relacionadas por ejemplo con la actina y la tubulina, proteínas de la división de celular arqueana relacionadas con el endosoma eucariota necesarios para el transporte y varias proteínas implicadas en la transcripción y la traducción.[4]

Clasificación

Se ha establecido que Proteoarchaeota se divide en dos clados que a su vez constituyen dos supergrupos.

  • Thermoproteota o TACK. Son las arqueas más abundantes en el ecosistema marino, especialmente en las profundidades y en sedimentos, incluso con escasez de nutrientes. Comprende organismos que van desde hábitat fríos (psicrófilos) a los más calientes (hipertermófilos) de los ambientes geotermales, tanto terrestres como marinos. Mayoritariamente son anaerobios, quimiosintéticos e importantes en el ciclo del carbono y del nitrógeno.
  • Asgardarchaeota o Asgard. Pequeño grupo probablemente psicrófilo encontrado en sedimentos que presenta las características arqueanas compartidas con los eucariontes que previamente se conocían distribuidas entre diferentes grupos de arqueas.[5]

Filogenia

La unidad filogenética de este grupo está consensuada, así como su relación con los eucariontes (hipótesis del eocito). Actualmente se considera que Proteoarchaeota es un clado que incluye a las arqueas Asgard.[6] Por otra parte, Cavalier-Smith nombra a este grupo como Filarchaeota.[7] Sus relaciones son aproximadamente las siguientes:[8][9][10]

Proteoarchaeota
Thermoproteota
 

Korarchaeia

 
 
 
 

Bathyarchaeia

 
Nitrososphaeria
 

Caldarchaeales

 
 
 

Geothermarchaeales

 
 
 

Conexivisphaerales

 
 

Nitrososphaerales

 
 
 
 
 
 
Methanomethylicia
 

Nezhaarchaeales

 
 

Methanomethyliales

 
 
Thermoproteia
 
 

Thermofilales

 
 

Thermoproteales

 
 
 
 

Gearchaeales

 
 
 

Marsarchaeales

 
 

Sulfolobales

 
 
 
 
 
 
 
 Asgardarchaeota 
 
Sifarchaeia
 

Borrarchaeales

 
 

Sifarchaeales

 
 
 
 
 

Jordarchaeia

 
 

Odinarchaeia

 
 
 
 
 

Baldrarchaeia

 
 

Thorarchaeia

 
 
 
 

Hermodarchaeia

 
Lokiarchaeia
 

Helarchaeales

 
 

Lokiarchaeales

 
 
 
 
 
 
 
 + α─proteobacteria 

Eukaryota

 
 
 

Wukongarchaeia

 
Heimdallarchaeia
 

Hodarchaeales

 
 
 

Gerdarchaeales

 
 
 

Kariarchaeales

 
 

Heimdallarchaeales

 
 
 
 
 
 
 
 

Referencias
  1. Castelle, C. J., Wrighton, K. C., Thomas, B. C., Hug, L. A., Brown, C. T., Wilkins, M. J., ... & Taylor, R. C. (2015). Genomic expansion of domain archaea highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling. Current Biology, 25(6), 690-701.
  2. Céline Petitjean et al 2014. Rooting the Domain Archaea by Phylogenomic Analysis Supports the Foundation of the New Kingdom Proteoarchaeota Genome Biol Evol (2014) doi: 10.1093/gbe/evu274
  3. Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, et al. (2015) A Higher Level Classification of All Living Organisms. PLoS ONE 10(6): e0130114. doi: 10.1371/journal.pone.0130114
  4. Anja Spang et al. 2015. Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature 521, 173–179 (14 May 2015) doi:10.1038/nature14447
  5. Dey, G., Thattai, M., & Baum, B. (2016). On the Archaeal Origins of Eukaryotes and the Challenges of Inferring Phenotype from Genotype. Trends in Cell Biology, 26(7), 476-485.
  6. Eugene V. Koonin 2015, Archaeal ancestors of eukaryotes: not so elusive any more. BMC Biol. 2015; 13: 84. doi: 10.1186/s12915-015-0194-5 PMCID: PMC4594999
  7. Thomas Cavalier-Smith & Ema E-Yung Chao (2020). Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (eukaryotes, archaebacteria). Linkspringer.
  8. Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246.
  9. «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.
  10. Jiarui Sun, Paul N. Evans, Emma J. Gagen, Ben J. Woodcroft, Brian P. Hedlund, Tanja Woyke, Philip Hugenholtz (2021). Recoding of stop codons expands the metabolic potential of two novel Asgardarchaeota lineages. Nature.
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