7-Aminoactinomycine D
La 7-aminoactinomycine D (7-AAD) est un composé chimique fluorescent dérivé de l'actinomycine D, avec laquelle elle partage une forte affinité pour l'ADN. La 7-AAD est utilisée comme marqueur fluorescent pour la microscopie à fluorescence et la cytométrie en flux (CMF). Elle s'intercale dans les ADN bicaténaires avec une forte affinité pour les régions riches en paires de bases G–C[3], ce qui en fait un outil intéressant dans les cadres des études de banding sur les chromosomes[4].
7-Aminoactinomycine D | |||
Structure de la 7-aminoactinomycine D | |||
Identification | |||
---|---|---|---|
Synonymes |
7-amino-AMD, |
||
No CAS | |||
No ECHA | 100.163.188 | ||
No RTECS | AU1579000 | ||
PubChem | 65180 | ||
ChEBI | 52304 | ||
SMILES | |||
InChI | |||
Propriétés chimiques | |||
Formule | C62H87N13O16 [Isomères] |
||
Masse molaire[1] | 1 270,431 7 ± 0,063 1 g/mol C 58,62 %, H 6,9 %, N 14,33 %, O 20,15 %, |
||
Précautions | |||
SGH[2] | |||
Danger |
|||
Transport[2] | |||
|
|||
Unités du SI et CNTP, sauf indication contraire. | |||
Avec un pic d'absorption à 546 nm, la 7-AAD est excitée efficacement par un laser hélium-néon à 543 nm ; elle peut également être excitée, un peu moins efficacement, à l'aide des raies à 488 nm et 514 nm d'un laser à argon. Ses émissions ont un très fort déplacement de Stokes avec un maximum dans le rouge profond, à 647 nm. La 7-AAD est par conséquent compatible avec la plupart des fluorophores bleus et verts — voire rouges — dans des applications multicolores.
La 7-AAD ne franchit pas aisément la membrane plasmique intacte, de sorte que la membrane des cellules à colorer doit être perméabilisée ou rompue. Cette méthode peut être utilisée avec la fixation des échantillons au formaldéhyde.
La 7-AAD permet par conséquent de repérer les cellules ayant une membrane plasmique endommagée, car le matériel génétique des cellules dont la membrane est intacte ne sera pas coloré par la 7-AAD, qui ne pourra pas pénétrer dans la cellule.
Notes et références
- Masse molaire calculée d’après « Atomic weights of the elements 2007 », sur www.chem.qmul.ac.uk.
- (en) Xiucai Liu, Huifen Chen et Dinshaw J. Patel, « Solution structure of actinomycin-DNA complexes: Drug intercalation at isolated G-C sites », Journal of Biomolecular NMR, vol. 1, no 4, , p. 323-347 (PMID 1841703, DOI 10.1007/BF02192858, lire en ligne)
- (en) Samuel A. Latt, « Fluorescent probes of chromosome structure and replication », Canadian Journal of Genetics and Cytology, vol. 19, no 4, , p. 603-623 (PMID 76502, DOI 10.1139/g77-065, lire en ligne)
- Portail de la chimie
- Portail de la biochimie