ARNI

L'ARNI ou ARN I (à ne pas confondre avec l'ARN interférent, ARNi) est un ARN non codant qui est un répresseur antisens de la réplication de certains plasmides d'Escherichia coli, dont ColEl. La réplication du plasmide est généralement initiée par ARN II[1], qui agit comme une amorce en se liant à sa matrice d'ADN. L'ARNI complémentaire se lie à l'ARN II lui interdisant son rôle d'initiation. La vitesse de dégradation de l'ARNI est donc un facteur majeur dans le contrôle de la réplication plasmidique. Ce taux de dégradation est facilité par le pcnB (numéro de copie de plasmide B) du produit du gène[2], qui « polyadényle » l'extrémité 3' de l'ARNI en le ciblant pour la dégradation par la PNPase[3].

Références

(en) H Masukata et J Tomizawa, « Control of primer formation for ColE1 plasmid replication: conformational change of the primer transcript », Cell, vol. 44, n^o 1,‎ janvier 1986, p. 125–136 (PMID 2416472, DOI 10.1016/0092-8674(86)90491-5).
(en) L He 1, F Söderbom, E G Wagner, U Binnie, N Binns et M Masters, « PcnB is required for the rapid degradation of RNAI, the antisense RNA that controls the copy number of ColE1-related plasmids », Molecular Microbiology, vol. 9, n^o 6,‎ septembre 1993, p. 1131–1142 (PMID 7523833, DOI 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01243.x).
(en) Fengfeng Xu, Sue Lin-Chao et Stanley N. Cohen, « The Escherichia coli pcnB gene promotes adenylylation of antisense RNAI of ColE1-type plasmids in vivo and degradation of RNAI decay intermediates », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 90, n^o 14,‎ juillet 1993, p. 6756–6760 (PMID 7688127, PMCID 47011, DOI 10.1073/pnas.90.14.6756).

Lectures complémentaires

(en) Stanley Norman Cohen, « Surprises at the 3' end of prokaryotic RNA », Cell, vol. 80, n^o 6,‎ mars 1995, p. 829–832 (PMID 7535193, DOI 10.1016/0092-8674(95)90284-8, S2CID 9077296)

Lien externe

« Rfam: Family: RNAI (RF00106) », sur rfam.org (consulté le 2 septembre 2021)

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[1] (en) H Masukata et J Tomizawa, « Control of primer formation for ColE1 plasmid replication: conformational change of the primer transcript », Cell, vol. 44, n^o 1,‎ janvier 1986, p. 125–136 (PMID 2416472, DOI 10.1016/0092-8674(86)90491-5).

[2] (en) L He 1, F Söderbom, E G Wagner, U Binnie, N Binns et M Masters, « PcnB is required for the rapid degradation of RNAI, the antisense RNA that controls the copy number of ColE1-related plasmids », Molecular Microbiology, vol. 9, n^o 6,‎ septembre 1993, p. 1131–1142 (PMID 7523833, DOI 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01243.x).

[3] (en) Fengfeng Xu, Sue Lin-Chao et Stanley N. Cohen, « The Escherichia coli pcnB gene promotes adenylylation of antisense RNAI of ColE1-type plasmids in vivo and degradation of RNAI decay intermediates », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 90, n^o 14,‎ juillet 1993, p. 6756–6760 (PMID 7688127, PMCID 47011, DOI 10.1073/pnas.90.14.6756).