ARN sous-génomique

Un ARN sous-génomique, ou ARNm sous-génomique, est un ARN messager issu de la transcription d'une fraction plus ou moins grande d'un brin d'ADN ou d'ARN antisens. Ce type d'ARN messager est produit essentiellement par des virus, notamment des virus à ARN de polarité positive[1] (groupe IV de la classification Baltimore). Ainsi, chez les nidovirus, La transcription commence à l'extrémité 3’ du génome, se poursuit avec un plus ou moins grand nombre de nucléotides, puis « saute » vers l'extrémité 5’ pour terminer la transcription[2]. Ce mécanisme produit des ARN messagers ayant une extrémité 5’ plus ou moins constante, selon la longueur du segment transcrit avant de poursuivre la transcription de l'extrémité 3’[3]. Ces ARN sous-génomiques forment des ensembles ayant des séquences imbriquées, ce qui constitue un moyen de coder plusieurs protéines sur le même génome[4].

Notes et références
  1. (en) W. Allen Miller et Gennadiy Koev, « Synthesis of Subgenomic RNAs by Positive-Strand RNA Viruses », Virology, vol. 273, no 1,‎ , p. 1-8 (PMID 10891401, DOI 10.1006/viro.2000.0421, lire en ligne)
  2. (en) Alexander O. Pasternak, Erwin van den Born, Willy J.M. Spaan et Eric J. Snijder, « Sequence requirements for RNA strand transfer during nidovirus discontinuous subgenomic RNA synthesis », The EMBO Journal, vol. 20, no 24,‎ , p. 7220-7228 (PMID 11742998, PMCID 125340, DOI 10.1093/emboj/20.24.7220, lire en ligne)
  3. (en) Baodong Wu et K Andrew White, « Uncoupling RNA virus replication from transcription via the polymerase: functional and evolutionary insights », The EMBO Journal, vol. 26, no 24,‎ , p. 5120-5130 (PMID 18034156, PMCID 2140117, DOI 10.1038/sj.emboj.7601931, lire en ligne)
  4. (en) Tra M. Le, Hui H. Wong, Felicia P. L. Tay, Shouguo Fang, Choong‐Tat Keng, Yee J. Tan et Ding X. Liu, « Expression, post‐translational modification and biochemical characterization of proteins encoded by subgenomic mRNA8 of the severe acute respiratory syndrome coronavirus », The FEBS Journal, vol. 274, no 16,‎ , p. 4211-4222 (PMID 17645546, DOI 10.1111/j.1742-4658.2007.05947.x, lire en ligne)
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