Acidiferrobacter

Les Acidiferrobacter forment un genre de bactéries gram négatives, acidophiles, thermotolérantes et anaérobies facultatives. Elles font partie de la famille Acidiferrobacteraceae dans l'ordre Acidiferrobacterales, de l'embranchement des Pseudomonadota.

Acidiferrobacter
Classification selon LPSN
Règne Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Acidiferrobacterales
Famille Acidiferrobacteraceae

Genre

Acidiferrobacter
Hallberg[1] 2011

Espèces de rang inférieur

  • Acidiferrobacter thiooxydans
  • unclassified Acidiferrobacter sp

Taxonomie

Étymologie

La famille Acidiferrobacteraceae a été nommée ainsi d'après le genre type qui lui a été assigné, Acidiferrobacter[2]. L'étymologie du genre Acidiferrobacter est la suivante : A.ci.di.fer.ro.bac’ter L. neut. adj. acidum, un acide; du L. masc. adj. acidus, acide; L. neut. n. ferrum, fer; N.L. masc. n. bacter, bâtonnet; N.L. masc. n. Acidiferrobacter, un bâtonnet oxydant les ions ferreux et aimant l'acidité[1],[3].

Historique

Le genre Acidiferrobacter a été décrit à partir d'une souche bactérienne dénommée «m-1» et identifiée comme une souche de Thiobacillus ferrooxidans mais dont la phylogénie sur la base de l'ARN ribosomal 16S la positionnait proche des Ectothiorhodospira et seulement de manière distante des bactéries du genre Acidithiobacillus capable d'oxyder le fer[1]. Ce genre a donc été tout d'abord classé parmi la famille Ectothiorhodospiraceae[1],[4]. De nouvelles études phylogénétiques permettent la création de l'ordre Acidiferrobacterales et de la famille Acidiferrobacteraceae dans lesquels ont été déplacé en les genres Acidiferrobacter et Sulfurifustis[2].

Liste des espèces

Selon la LPSN (31 août 2022)[5], il n'y a actuellement qu'une seule espèce officiellement nommée, mais il y a aussi des souches qui ne peuvent être classées dans l'espèce type[6] :

  • Acidiferrobacter thiooxydans, espèce type du genre
  • unclassified Acidiferrobacter sp

Description

Lors de sa description de , le genre Acidiferrobacter comprend des bactéries gram négatives, acidophiles, thermotolérantes et anaérobies facultatives[1].

Notes et références
  1. (en) Kevin B. Hallberg, Sabrina Hedrich et D. Barrie Johnson, « Acidiferrobacter thiooxydans, gen. nov. sp. nov.; an acidophilic, thermo-tolerant, facultatively anaerobic iron- and sulfur-oxidizer of the family Ectothiorhodospiraceae », Extremophiles, vol. 15,‎ , p. 271–279 (DOI 10.1007/s00792-011-0359-2)
  2. (en) Hisaya Kojima, Arisa Shinohara et Manabu Fukui, « Sulfurifustis variabilis gen. nov., sp. nov., a sulfur oxidizer isolated from a lake, and proposal of Acidiferrobacteraceae fam. nov. and Acidiferrobacterales ord. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 65, no 10,‎ (DOI 10.1099/ijsem.0.000479)
  3. (en) « Genus Acidiferrobacter », sur LPSN,
  4. (en) Pelin Yilmaz, Laura Wegener Parfrey, Pablo Yarza, Jan Gerken, Elmar Pruesse, Christian Quast, Timmy Schweer, Jörg Peplies, Wolfgang Ludwig et Frank Oliver Glöckner, « The SILVA and “all-species living tree project (LTP)” taxonomic frameworks », Nucleic Acids Research, vol. 42, no D1,‎ , D643-D648 (DOI 10.1093/nar/gkt1209)
  5. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 31 août 2022
  6. (en) « Acidiferrobacter », sur NCBI (consulté le )

Liens externes

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