Bipolaris
Bipolaris est un genre de champignons ascomycètes de la famille des Pleosporaceae. Le stade téléomorphe est Cochliobolus.
| Règne | Fungi |
|---|---|
| Sous-règne | Dikarya |
| Division | Ascomycota |
| Sous-division | Dothideomycetes |
| Classe | Agaricomycetes |
| Ordre | Pleosporales |
| Famille | Pleosporaceae |
Ce genre comprend plus de quarante espèces étroitement apparentées. Beaucoup de ces espèces sont des agents pathogènes des céréales, généralement spécifiques d'une espèce de plante-hôte, provoquant chez ces plantes des maladies du groupe des helminthosporioses. Plusieurs espèces, en particulier Bipolaris australiensis, Bipolaris hawaiiensis et Bipolaris spicifera sont bien documentées comme agents pathogènes chez l'homme[2]. Cependant une étude de 2012 propose de reclasser ces espèces dans le genre Curvularia (téléomorphe : Pseudocochliobolus)[3].
Pathologie végétale
Les espèces les plus agressives pour les céréales sont Cochliobolus heterostrophus (Bipolaris maydis), nécrotrophe[4], et Cochliobolus carbonum (Bipolaris zeicola), tous deux agents pathogènes du maïs , Cochliobolus victoriae (Bipolaris victoriae), agent pathogène de l'avoine, Cochliobolus miyabeanus (Bipolaris oryzae), agent pathogène du riz, Bipolaris sorghicola, agent pathogène du sorgho, Bipolaris sacchari, agent pathogène de la canne à sucre, Cochliobolus sativus (Bipolaris sorokiniana), agent pathogène hémibiotrophe[5] des céréales et des graminées fourragères[6].
Ces différentes espèces appartiennent à un groupe phylogénétique resserré, suggérant qu'un ancêtre commun a donné naissance, au cours d'une période de temps relativement courte, à cette série de biotypes distincts, qui se distinguent par leur spécificité à l'égard d'un type de céréale. Comme c'est le cas d'autres taxons apparentés (par exemple, Pyrenophora tritici-repentis, Stagonospora nodorum, Alternaria alternata), les espèces du genre Cochliobolus spp. se caractérisent par leur capacité à produire des souches nouvelles, très virulentes, produisant des toxines sélectives des différents hôtes (HST)[6].
Pathologie humaine
Chez l'homme, les manifestations cliniques consistent en kératite mycosique, phaeohyphomycose sous-cutanée, sinusite, et péritonite chez les patients sous dialyse péritonéale continue ambulatoire (DPCA), et en infections cérébrales et diffuses. La phaeohyphomycose causée par les espèces du genre Bipolaris a été signalée aussi bien chez des patients normaux que chez des personnes immunodéprimées[2].
Liste d'espèces
Selon Catalogue of Life (24 juillet 2014)[7] :
- Bipolaris australis
- Bipolaris brizae
- Bipolaris buchloës
- Bipolaris cactivora
- Bipolaris chloridis
- Bipolaris clavata
- Bipolaris coffeana
- Bipolaris coicis
- Bipolaris colocasiae
- Bipolaris costina
- Bipolaris crotonis
- Bipolaris crustacea
- Bipolaris cylindrica
- Bipolaris cynodontis
- Bipolaris dactyloctenii
- Bipolaris drechsleri
- Bipolaris eleusines
- Bipolaris eragrostiellae
- Bipolaris euchlaenae
- Bipolaris flagelloidea
- Bipolaris fusca
- Bipolaris glycines
- Bipolaris gossypina
- Bipolaris hadrotrichoides
- Bipolaris halepensis
- Bipolaris heliconiae
- Bipolaris heveae
- Bipolaris imperatae
- Bipolaris incurvata
- Bipolaris indica
- Bipolaris iridis
- Bipolaris israeli
- Bipolaris leersiae
- Bipolaris maydis
- Bipolaris melinidis
- Bipolaris microlaenae
- Bipolaris micropus
- Bipolaris miyakei
- Bipolaris multiformis
- Bipolaris neergaardii
- Bipolaris nicotiae
- Bipolaris novae-zelandiae
- Bipolaris obclavata
- Bipolaris obovoidea
- Bipolaris olyrae
- Bipolaris oryzae
- Bipolaris palousensis
- Bipolaris panici-miliacei
- Bipolaris papendorfii
- Bipolaris peregianensis
- Bipolaris poae-pratensis
- Bipolaris prieskaensis
- Bipolaris sacchari
- Bipolaris sesuvii
- Bipolaris sorghicola
- Bipolaris sorokiniana
- Bipolaris subpapendorfii
- Bipolaris triticicola
- Bipolaris triticigrani
- Bipolaris triticola
- Bipolaris tropicalis
- Bipolaris urochloae
- Bipolaris victoriae
- Bipolaris xanthosomatis
- Bipolaris zeae
- Bipolaris zeicola
Liste des espèces et non-classés
Selon Index Fungorum (24 juillet 2014)[8] :
- Bipolaris australis Alcorn 1982
- Bipolaris brizae (Y. Nisik.) Shoemaker 1959
- Bipolaris buchloës (Lefebvre & Aar.G. Johnson) Shoemaker 1959
- Bipolaris cactivora (Petr.) Alcorn 1983
- Bipolaris chloridis (Alcorn) Alcorn 1983
- Bipolaris clavata Alcorn 1982
- Bipolaris coffeana Sivan. 1985
- Bipolaris coicis (Y. Nisik.) Shoemaker 1959
- Bipolaris colocasiae (M.P. Tandon & Bhargava) Alcorn 1983
- Bipolaris costina Sivan., R.S. Shukla, Kr.P. Singh & A. Husain 1985
- Bipolaris crotonis Sivan. 1985
- Bipolaris crustacea (Henn.) Alcorn 1982
- Bipolaris cylindrica Alcorn 1982
- Bipolaris cynodontis (Marignoni) Shoemaker 1959
- Bipolaris dactyloctenii Alcorn 1982
- Bipolaris drechsleri Manamgoda & Minnis 2013
- Bipolaris eleusines J.H. Peng & J.Y. Lu 1989
- Bipolaris eragrostiellae (A.P. Misra & R.A. Singh) Sivan. 1987
- Bipolaris euchlaenae (Zimm.) Shoemaker 1959
- Bipolaris flagelloidea (G.F. Atk.) Shoemaker 1959
- Bipolaris fusca Y.L. Jiang & T.Y. Zhang 2008
- Bipolaris glycines (S. Naray. & Durairaj) B.A. Khasanov 1992
- Bipolaris gossypina Sivan. 1985
- Bipolaris hadrotrichoides (Ellis & Everh.) Luttr. 1970
- Bipolaris halepensis M.Y. Chiang, K.J. Leonard & Van Dyke 1989
- Bipolaris heliconiae Alcorn 1996
- Bipolaris heveae (Petch) Arx 1987
- Bipolaris imperatae J.J. Muchovej 2012
- Bipolaris incurvata (C. Bernard) Alcorn 1983
- Bipolaris indica J.N. Rai, Wadhwani & J.P. Tewari 1970
- Bipolaris iridis (Oudem.) C.H. Dickinson 1966
- Bipolaris israeli Steiman, Guiraud, Seigle-Mur. & Sage 1996
- Bipolaris leersiae (G.F. Atk.) Shoemaker 1959
- Bipolaris maydis (Y. Nisik. & C. Miyake) Shoemaker 1959
- Bipolaris melinidis Alcorn 1982
- Bipolaris microlaenae Alcorn 1990
- Bipolaris micropus (Drechsler) Shoemaker 1959
- Bipolaris microstegii Minnis, Rossman, Kleczewki & S.L. Flory 2012
- Bipolaris miyakei (Y. Nisik.) Shoemaker 1959
- Bipolaris multiformis (Jooste) Alcorn 1983
- Bipolaris neergaardii (Danquah) Alcorn 1983
- Bipolaris nicotiae (Mouch.) Alcorn 1983
- Bipolaris novae-zelandiae Sivan. 1985
- Bipolaris obclavata Sivan. 1992
- Bipolaris obovoidea Wei Zhang & T.Y. Zhang 2012
- Bipolaris olyrae (Viégas) Shoemaker 1959
- Bipolaris oryzae (Breda de Haan) Shoemaker 1959
- Bipolaris oryzae Sawada
- Bipolaris palousensis R. Sprague 1961
- Bipolaris panici-miliacei (Y. Nisik.) Shoemaker 1959
- Bipolaris papendorfii (Aa) Alcorn 1983
- Bipolaris peregianensis Alcorn 1982
- Bipolaris poae-pratensis H. Deng & T.Y. Zhang 2002
- Bipolaris prieskaensis W.Q. Chen & W.J. Swart 2000
- Bipolaris sacchari (Breda de Haan) Subram. 1971
- Bipolaris sacchari (E.J. Butler) Shoemaker 1959
- Bipolaris salkadehensis Ahmadpour & Heidarian 2012
- Bipolaris secalis Sisterna 1989
- Bipolaris sesuvii Jing Z. Zhang 2009
- Bipolaris sorghicola (Lefebvre & Sherwin) Alcorn 1983
- Bipolaris sorokiniana (Sacc.) Shoemaker 1959
- Bipolaris stipae (Trab.) Gornostaĭ 1978
- Bipolaris subpapendorfii (Mouch.) Alcorn 1983
- Bipolaris triticalis Sisterna 1989
- Bipolaris triticicola Sivan. 1985
- Bipolaris triticigrani (A.P. Misra & R.A. Singh) Sivan. 1987
- Bipolaris triticola Sivan. 1985
- Bipolaris tropicalis Sivan. 1985
- Bipolaris urochloae (V.A. Putterill) Shoemaker 1959
- Bipolaris vassilevae Gornostaĭ 1978
- Bipolaris victoriae (F. Meehan & H.C. Murphy) Shoemaker 1959
- Bipolaris xanthosomatis B. Huguenin 1966
- Bipolaris zeae Sivan. 1985
- Bipolaris zeicola (G.L. Stout) Shoemaker 1959
Selon ITIS (24 juillet 2014)[1] :
- Drechslera halodes (Drechsler) Subramanian & Jain
- Drechslera tritici-vulgaris (Nisikado) Ito Ex Hughes
Selon NCBI (24 juillet 2014)[9] :
- Bipolaris australis
- Bipolaris bicolor
- Bipolaris cactivora
- Bipolaris chloridis
- Bipolaris coffeana
- Bipolaris cookei
- Bipolaris crustacea
- Bipolaris cynodontis
- Bipolaris drechsleri
- Bipolaris eleusines
- Bipolaris gramineum
- Bipolaris heveae
- Bipolaris homomorpha
- Bipolaris indica
- Bipolaris iridis
- Bipolaris leersiae
- Bipolaris luttrellii
- Bipolaris maydis
- non-classé Bipolaris maydis ATCC 48331
- non-classé Bipolaris maydis C5
- non-classé Bipolaris maydis Hm338
- non-classé Bipolaris maydis Hm540
- non-classé Bipolaris maydis PR1x412
- Bipolaris melinidis
- Bipolaris microlaenae
- Bipolaris micropus
- Bipolaris microstegii
- Bipolaris miyakei
- Bipolaris neergaardii
- Bipolaris oryzae
- non-classé Bipolaris oryzae ATCC 44560
- Bipolaris panici-miliacei
- Bipolaris papendorfii
- Bipolaris peregianensis
- Bipolaris portulacae
- Bipolaris prieskaensis
- Bipolaris sacchari
- Bipolaris setariae
- Bipolaris sorghicola
- Bipolaris sorokiniana
- non-classé Bipolaris sorokiniana ND90Pr
- non-classé Bipolaris sorokiniana ND93-1
- Bipolaris stenospila
- Bipolaris tetramera
- Bipolaris urochloae
- Bipolaris victoriae
- non-classé Bipolaris victoriae FI3
- Bipolaris yamadai
- Bipolaris zeae
- Bipolaris zeicola
- non-classé Bipolaris zeicola 26-R-13
Notes et références
- Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 24 juillet 2014
- (en) « Bipolaris sp. Teleomorph: Cochliobolus sp. », sur Mycology Online, Université d'Adelaïde (consulté le ).
- (en) Dimuthu S. Manamgoda & Lei Cai & Eric H. C. McKenzie & Pedro W. Crous & Hugo Madrid & Ekachai Chukeatirote & Roger G. Shivas & Yu Pei Tan & Kevin D. Hyde, « A phylogenetic and taxonomic re-evaluation of the Bipolaris - Cochliobolus - Curvularia Complex », Fungal Diversity, (DOI 10.1007/s13225-012-0189-2).
- Agent pathogène qui nécessite une source nutritive composée de tissus nécrosés.
- Agent pathogène qui présente une phase de vie biotrophe suivie d’une phase nécrotrophe.
- (en) « Cochliobolus victoriae FI3 v1.0 », sur genome Portal, Joint Genome Institute (consulté le ).
- Catalogue of Life Checklist, consulté le 24 juillet 2014
- Index Fungorum, consulté le 24 juillet 2014
- NCBI, consulté le 24 juillet 2014
Liens externes
- (en) Référence Catalogue of Life : Bipolaris (consulté le )
- (en) Référence Index Fungorum : Bipolaris Shoemaker 1959 (+ liste espèces) (+ MycoBank) (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Bipolaris Shoemaker, 1959 Non valide (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Drechslera Ito, 1959 (consulté le )
- (en) Référence MycoBank : Bipolaris Shoemaker (consulté le )
- (en) Référence NCBI : Bipolaris (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Référence uBio : Bipolaris Shoemaker, 1959 (consulté le )
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