Boîte TATA

La boîte TATA (TATA box ou Goldberg-Hogness box en anglais)[1] est une séquence d'ADN (un élément cis-régulateur) présente au niveau de la séquence promotrice d'une partie des gènes des eucaryotes [2]^,[3]^,[4]^,[5]. Cette séquence d'ADN codée TATA se situe à environ 25 nucléotides en amont du premier nucléotide transcrit (N+1). Cette séquence sert en partie de lieu de reconnaissance à l'ARN polymérase chez les eucaryotes.

Chez les procaryotes, il existe aussi un autre ensemble de séquence jouant un rôle similaire. Il est composé d'une séquence situé à 35 nucléotides en amont du premier transcrit : on l'appelle « -35 box ». Et d'une séquence située en -10 appelée « -10 box » ou boîte de Pribnow. La boîte TATAAT (-10) commence donc 10 nucléotides avant le premier transcrit.

Localisation de la boîte de Pribnow et de la « -35 box » sur un promoteur procaryote :

   <-- amont                                                aval -->
5'-XXXXXXXPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3'
           -35       -10       +1           gène d'intérêt
          TTGACA     TATAAT

Localisation de la boîte TATA chez les eucaryotes :

5'-XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPPPPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-3'
                        -30                                    gène d'intérêt
                      TATA box

Notes et références

(en) Lifton RP, Goldberg ML, Karp RW, Hogness DS. (1978) « The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications » Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 42, 1047-1051. PMID 98262
(en) Smale ST, Kadonaga JT (2003) « The RNA polymerase II core promoter » Annu Rev Biochem. 72, 449-479. PMID 12651739 PDF
(en) C Yang, E Bolotin, T Jiang, FM Sladek et E Martinez, « Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters », Gene, vol. 389, n^o 1,‎ 2007, p. 52–65 (PMID 17123746, PMCID 1955227, DOI 10.1016/j.gene.2006.09.029)
(en) Carninci P, Sandelin A, Lenhard B. et al., « Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution », Nat. Genet., vol. 38, n^o 6,‎ juin 2006, p. 626–35 (PMID 16645617, DOI 10.1038/ng1789)
(en) Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J. et al., « Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes », Genome Res., vol. 11, n^o 5,‎ mai 2001, p. 677–84 (PMID 11337467, PMCID 311086, DOI 10.1101/gr.164001)

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[1] (en) Lifton RP, Goldberg ML, Karp RW, Hogness DS. (1978) « The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications » Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 42, 1047-1051. PMID 98262

[2] (en) Smale ST, Kadonaga JT (2003) « The RNA polymerase II core promoter » Annu Rev Biochem. 72, 449-479. PMID 12651739 PDF

[3] (en) C Yang, E Bolotin, T Jiang, FM Sladek et E Martinez, « Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters », Gene, vol. 389, n^o 1,‎ 2007, p. 52–65 (PMID 17123746, PMCID 1955227, DOI 10.1016/j.gene.2006.09.029)

[4] (en) Carninci P, Sandelin A, Lenhard B. et al., « Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution », Nat. Genet., vol. 38, n^o 6,‎ juin 2006, p. 626–35 (PMID 16645617, DOI 10.1038/ng1789)

[5] (en) Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J. et al., « Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes », Genome Res., vol. 11, n^o 5,‎ mai 2001, p. 677–84 (PMID 11337467, PMCID 311086, DOI 10.1101/gr.164001)