IRES (biologie)

Les IRES, en biologie moléculaire (de l'anglais Internal ribosome entry site), sont des séquences qui, dans les cellules d'eucaryotes, permettent le démarrage de la traduction d'un ARN messager de manière interne.

Structure de l'IRES situé dans la région 5’ non traduite du génome du virus de l'hépatite C. Le codon de démarrage est surligné en bleu

Le processus conventionnel de la traduction des ARN messagers d'eucaryotes repose sur un mécanisme de balayage par le ribosome à partir de la coiffe située à l'extrémité 5’, qui scrute l'ARNm jusqu'au premier codon de démarrage. Les IRES permettent le recrutement direct du ribosome au niveau de ce codon de démarrage, indépendamment de la présence de la coiffe et du mécanisme de balayage. Les IRES sont des régions structurées de l'ARNm qui interagissent directement avec le ribosome ou avec les facteurs d'initiation de la traduction.

Les IRES sont utilisés en particulier par des virus pour détourner à leur profit la machinerie cellulaire de traduction, ou pour permettre la traduction de plusieurs cistrons à partir d'un seul ARNm[1]. La traduction de la polyprotéine du virus de l'hépatite C, ou VHC, repose en particulier sur la présence d'un IRES dans la région 5' non-traduite du génome viral.

Deux IRES ont également été identifiés dans l'ARNm pleine-longueur du virus de l'immunodéficience de type 1 (VIH-1)[2] : un dans la région 5 non traduite (5'UTR) ainsi qu'un au début de la région codant Gag.

Voir aussi

Notes et références

J. Pelletier et N. Sonenberg, « Internal initiation of translation of eukaryotic mRNA directed by a sequence derived from poliovirus RNA », Nature, vol. 334, n^o 6180,‎ 28 juillet 1988, p. 320–325 (ISSN 0028-0836, PMID 2839775, DOI 10.1038/334320a0, lire en ligne, consulté le 11 novembre 2016)
(en) Nicolas Locker, Nathalie Chamond et Bruno Sargueil, « A conserved structure within the HIV gag open reading frame that controls translation initiation directly recruits the 40S subunit and eIF3 », Nucleic Acids Research, vol. 39, n^o 6,‎ 1^er mars 2011, p. 2367–2377 (ISSN 0305-1048 et 1362-4962, PMID 21071421, PMCID 3064776, DOI 10.1093/nar/gkq1118, lire en ligne, consulté le 11 novembre 2016)

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[1] J. Pelletier et N. Sonenberg, « Internal initiation of translation of eukaryotic mRNA directed by a sequence derived from poliovirus RNA », Nature, vol. 334, n^o 6180,‎ 28 juillet 1988, p. 320–325 (ISSN 0028-0836, PMID 2839775, DOI 10.1038/334320a0, lire en ligne, consulté le 11 novembre 2016)

[2] (en) Nicolas Locker, Nathalie Chamond et Bruno Sargueil, « A conserved structure within the HIV gag open reading frame that controls translation initiation directly recruits the 40S subunit and eIF3 », Nucleic Acids Research, vol. 39, n^o 6,‎ 1^er mars 2011, p. 2367–2377 (ISSN 0305-1048 et 1362-4962, PMID 21071421, PMCID 3064776, DOI 10.1093/nar/gkq1118, lire en ligne, consulté le 11 novembre 2016)