Kluyvera sichuanensis

Kluyvera sichuanensis est une des espèces du genre bactérien Kluyvera. C'est un bacille à gram négatif de la famille des Enterobacteriaceae.

Kluyvera sichuanensis
Gelose MacConkey avec des colonies de bactéries Kluyvera ascorbata du même genre bactérien que K. sichuanensis
Classification selon LPSN
Règne Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Enterobacteriales
Famille Enterobacteriaceae
Genre Kluyvera

Espèce

Kluyvera sichuanensis
Liu et al. 2020[1]

Description

Kluyvera sichuanensis est un bacille anaérobie facultatif à Gram négatif et mobiles comme les deux premières espèces du genre Kluyvera[1],[2],[3]. L'espèce Kluyvera sichuanensis ne sporule pas et contrairement aux autres Kluyvera est catalase négative et oxydase negative[1]. La croissance sur gélose nutritive est possible entre 8 et 42°C, avec 0 à 5% NaCl (w/v), et à un pH 5.0 à 9.0[1]. Les colonies de K. sichuanensis forment des colonies blanches circulaires, convexes et lisses[1]. Elle est capable de réduire le nitrate, d'utiliser le citrate, et ses activités lysine décarboxylase et ornithine décarboxylase sont positives. Elles peuvent fermenter le D-glucose ainsi que d'autres sucres. Elle peut être différenciée des autres Kluyvera par sa capacité à utiliser le D-sorbitol mais pas la β-galactosidase[1].

Habitat

La souche type de Kluyvera sichuanensis a été isolée à partir d'un évier dans la cadre d'un programme de surveillance des contaminations bactériennes[1].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de cette espèce bactérienne est la suivante : pour le nom de genre Kluy’ver.a. N.L. fem. n. Kluyvera nommées ainsi par Asai et al. (1956) pour honorer le microbiologiste hollandais Albert J. Kluyver[4] et pour l'épithète de l'espèce 'si.chuan.en'sis. N.L. adj. sichuanensis désignant la province de Sichuan (Chine) où a été isolée la souche type[1],[5].

Historique

Kluyvera sichuanensis a d'abord été identifiée phénotypiquement comme Kluyvera ascorbata. L'analyse d'une partie de sa séquence d'ARNr 16S l'a placé dans le groupe des Kluyvera avec des homologies de 99.22% avec Kluyvera ascorbata ATCC 33433T 98.88% avec K. intermedia NCTC 12125T, 98.58% avec K. cryocrescens NBRC 102467T, et 98.30% avec K. georgiana ATCC 51603T[1]. La forte identité avec d'autres espèces de la famille des Enterobacteriaceae comme Klebsiella aerogenes (98.23%), Raoultella terrigena (98.09%), Citrobacter braakii (97.95%), et Lelliottia amnigena (97.94%) ont rendu nécessaire le séquençage complet du génome qui a permis de confirmer cette espèce comme une espèce à part entière[1]. Comme les autres Kluyvera, elle fait partie de la famille des Enterobacteriaceae[5]. La souche 090646, souche type de l'espèce K. sichuanensis a été déposée dans deux banques de cultures bactériennes, la Guangdong Microbial Culture Collection Center sous le numéro d'accession GDMCC 1.1872T et dans la Korean Collection for Type Cultures sous le numéro KCTC82166[1].

Références
  1. (en) Lina Liu, Yu Feng, Li Wei, Fu Qiao et Zhiyong Zong, « Corrigendum: Precise Species Identification and Taxonomy Update for the Genus Kluyvera With Reporting Kluyvera sichuanensis sp. nov. », Front Microbiol, vol. 11,‎ , p. 615117 (DOI 10.3389/fmicb.2020.615117)
  2. (en) JJ Farmer, GR Fanning, GP Huntley-Carter, B Holmes, FW Hickman, C Richard et DJ Brenner, « Kluyvera, a new (redefined) genus in the family Enterobacteriaceae: identification of Kluyvera ascorbata sp. nov. and Kluyvera cryocrescens sp. nov. in clinical specimens », J Clin Microbiol, vol. 13, no 5,‎ , p. 919-933 (PMID 7240403, DOI 10.1128/jcm.13.5.919-933.1981)
  3. (en) J.j. Farmer, Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, John Wiley & Sons, Ltd, , 1–18 p. (DOI 10.1002/9781118960608.gbm01151), « Kluyvera »
  4. (en) « Genus Kluyvera », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  5. (en) « Species Kluyvera sichuanensis », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )

Annexes

Bibliographie
  • Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley, George M. Garrity, David R. Boone, Paul De Vos, Michael Goodfellow, Fred A. Rainey et Karl-Heinz Schleifer, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 : Part B The Gammaproteobacteria, Boston, Springer, , 304 p. (ISBN 9780387280226).

Articles connexes

Liens externes
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