Liaison isopeptidique

Une liaison isopeptidique est une liaison peptidique qui se trouve dans la chaine principale de la protéine. Ce lien se forme entre les fonctions « acide carboxylique » et « groupe aminé » d'une chaine latérale (figure 1).

Figure 1: Emplacements de l'azote epsilon, de la liaison isopeptidique et de la liaison peptidique.

Des liaisons isopeptidiques peuvent se créer entre l'amine de la chaine latérale de la lysine et les groupes carboxyle de la chaine latérale du glutamate ou de l'aspartate[1].

La formation de la liaison peut être catalysée par voie enzymatique, comme dans le cas de la liaison formée entre la lysine et de la glutamine, qui est catalysée par des transglutaminases, ou peut se former spontanément comme observé dans la formation du capside du bactériophage HK97[2] et dans les pili des bactéries Gram positives[3].

La formation spontanée d'une liaison isopeptidique nécessite la présence d'un autre résidu, l'acide glutamique, qui catalyse la formation de liaisons induites par proximité.

Un exemple d'un petit peptide contenant une liaison isopeptidique est le glutathion, qui a un lien entre la chaine latérale d'un résidu de glutamate et le groupe amine d'un résidu cystéine.

Un exemple d'une protéine impliquée dans la liaison isopeptidique est l'ubiquitine, qui se lie à d'autres protéines par une liaison entre la glycine C-terminale de l'ubiquitine et une chaine latérale de la lysine de la protéine substrat.

Les liaisons isopeptidiques font partie des modifications post-traductionnelles courantes.