NdhF

Le gène chloroplastique ndhF (sous-unité F de la NADH déshydrogénase) se rencontre chez tous les phylums de plantes vasculaires et est hautement conservé. Son fragment d'ADN chloroplastique réside dans la petite région à une seule copie du génome du chloroplaste. On suppose que sa fonction est de coder une protéine hydrophobe contenant 664 acides aminés. Sa masse est évaluée à 72,9 kDa[1].

Application

Le fragment d'ADN ndhF s'est révélé être un outil très utile pour la reconstruction phylogénétique à différents niveaux taxinomiques[2]^,[3]^,[4]^,[5].

Notes et références

(en) Ray Neyland et Lowell E. Urbatsch, « The ndhF chloroplast gene detected in all vascular plant divisions », Planta, vol. 200, n^o 2,‎ 1996, p. 273–277 P (DOI 10.1007/bf00208318, résumé).
(en) Wenpan Dong, Jing Liu, Jing Yu, Ling Wang et Shiliang Zhou, « Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluating Plant Phylogeny at Low Taxonomic Levels and for DNA Barcoding », PLoS ONE, vol. 7, n^o 4,‎ 2012, e35071 (DOI 10.1371/journal.pone.0035071, Bibcode 2012PLoSO...735071D, lire en ligne).
(en) T. B. Patterson et T. J. Givnish, « Phylogeny, concerted convergence, and phylogenetic niche conservatism in the core Liliales: insights from rbcL and ndhF sequence data », Evolution, vol. 56, n^o 2,‎ 2002, p. 233–252 (DOI 10.1111/j.0014-3820.2002.tb01334.x, résumé).
(en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Phylogeny of the monocotyledons based on the highly informative plastid gene ndhF: evidence for widespread concerted convergence », Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany,‎ 2006, p. 28–51 (lire en ligne).
(en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Repeated evolution of net venation and fleshy fruits among monocots in shaded habitats confirms a priori predictions: evidence from an ndhF phylogeny », Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 272, n^o 1571,‎ 2005, p. 1481–1490 (DOI 10.1098/rspb.2005.3067).

Voir aussi

Portail de la biologie cellulaire et moléculaire

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[1] (en) Ray Neyland et Lowell E. Urbatsch, « The ndhF chloroplast gene detected in all vascular plant divisions », Planta, vol. 200, n^o 2,‎ 1996, p. 273–277 P (DOI 10.1007/bf00208318, résumé).

[2] (en) Wenpan Dong, Jing Liu, Jing Yu, Ling Wang et Shiliang Zhou, « Highly Variable Chloroplast Markers for Evaluating Plant Phylogeny at Low Taxonomic Levels and for DNA Barcoding », PLoS ONE, vol. 7, n^o 4,‎ 2012, e35071 (DOI 10.1371/journal.pone.0035071, Bibcode 2012PLoSO...735071D, lire en ligne).

[Patterson_2002-3] (en) T. B. Patterson et T. J. Givnish, « Phylogeny, concerted convergence, and phylogenetic niche conservatism in the core Liliales: insights from rbcL and ndhF sequence data », Evolution, vol. 56, n^o 2,‎ 2002, p. 233–252 (DOI 10.1111/j.0014-3820.2002.tb01334.x, résumé).

[Givnish_2006-4] (en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Phylogeny of the monocotyledons based on the highly informative plastid gene ndhF: evidence for widespread concerted convergence », Aliso: A Journal of Systematic and Evolutionary Botany,‎ 2006, p. 28–51 (lire en ligne).

[Givnish_2005-5] (en) T.J. Givnish, J.C. Pires, S.W. Graham, M.A. McPherson, L.M. Prince, T.B. Patterson et H.S. Rai, « Repeated evolution of net venation and fleshy fruits among monocots in shaded habitats confirms a priori predictions: evidence from an ndhF phylogeny », Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 272, n^o 1571,‎ 2005, p. 1481–1490 (DOI 10.1098/rspb.2005.3067).