Nitrosomonadales

Les Nitrosomonadales forment un ordre de bactéries à gram négatif dans la classe des Betaproteobacteria dans le phylum Pseudomonadota. Il comprend de nombreuses bactéries libres ayant une grande diversité de morphologies et capables de vivre dans différents types d'habitats. Le genre type de cet ordre est Nitrosomonas.

Nitrosomonadales
Spirillum un des genres de cet ordre
Classification selon LPSN
Règne Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Betaproteobacteria

Ordre

Nitrosomonadales
Garrity G.M., 2005[1]

Taxonomie

Lors de sa description en , l'ordre des Nitrosomonadales comprennent trois familles bactériennes, les Nitrosomonadaceae, les Gallionellaceae et les Spirillaceae[1]. Cette assignation a été réalisée après une analyse phylogénétique des séquences nucléotidiques de l'ARNr 16S[1].

En , l'ordre est redéfini suite à de nouvelles analyses phylogénétiques des séquences d'ARNr 16S, avec la création de deux nouvelles familles (Sterolibacteriaceae et Thiobacillaceae) et le transfert des Methylophilaceae. Il comprend dès lors six familles à cette date[2]. L'ordre Methylophilales qui avait été décrit pour contenir les Methylophilaceae devient dès lors un synonyme hétérotypique de cet ordre[3]. La famille type de cet ordre est Nitrosomonadaceae[2].

La famille Sulfuricellaceae, décrite en , placée originellement dans un nouvel ordre nommé Sulfuricellales avant d'être fusionnée dans les Gallionellaceae, a été à nouveau individualisée et placée dans l'ordre des Nitrosomonadales en [4].

En la description d'une nouvelle famille Usitatibacteraceae composée d'une seul et unique nouveau genre Usitatibacter ajoute une huitième famille à cet ordre[5].

Étymologie

L'étymologie du nom de l'ordre Nitrosomonadales se résume ainsi : Ni.tro.so.mo.na.da’les. N.L. fem. n. Nitrosomonas, genre type de l'ordre; L. fem. pl. n. suff. -ales, suffixe pour définir le nom d'un ordre; N.L. fem. pl. n. Nitrosomonadales, l'ordre des Nitrosomonas[1],[3].

Familles

En , cet ordre comprend les huit familles suivantes[1],[3] :

  • Gallionellaceae, dans cet ordre depuis 2005[1]
  • Methylophilaceae, dans cet ordre depuis 2017[2]
  • Nitrosomonadaceae, famille type de cet ordre depuis 2005[1]
  • Spirillaceae, dans cet ordre depuis 2005[1]
  • Sterolibacteriaceae, dans cet ordre depuis 2017[2]
  • Sulfuricellaceae, dans cet ordre depuis 2021[4]
  • Thiobacillaceae, dans cet ordre depuis 2017[2]
  • Usitatibacteraceae, dans cet ordre depuis 2021[5]

Description

Cet ordre comprend des bactéries à gram négatif de morphologies, métabolismes et d'écologies très divers. Il comprend une grande diversité de morphologie : en spirales (ex Spirillum), coques, bacilles (Nitrosomonas), pléomorphes (Nitrosolobus multiformis)[1]. Au niveau du métabolisme, il s'y trouve des bactéries chimiolithotrophes, mixotrophes, ou chimioorganotrophes. Au niveau de l'écologie, certaines espèces peuvent être marines (Nitrosomonas marina), ou retrouvées dans les sols oligotrophes (Nitrosovibrio), les eaux usées ou les eaux oligotrophes (Nitrosomonas oligotropha)[1].

Références
  1. (en) George M. Garrity, Julia A. Bell et Timothy Lilburn, « Order V. Nitrosomonadales ord. nov. », dans Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edn, vol. 2 (The Proteobacteria), New York,, Springer, , chap. part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria), p. 863
  2. (en) R Boden, LP Hutt et AW Rae, « Reclassification of Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) as Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov., transfer of Thiobacillus (Beijerinck, 1904) from the Hydrogenophilales to the Nitrosomonadales, proposal of Hydrogenophilalia class. nov. within the 'Proteobacteria', and four new families within the orders Nitrosomonadales and Rhodocyclales », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 67, no 5,‎ , p. 1191-1205 (DOI 10.1099/ijsem.0.001927)
  3. (en) « Order Nitrosomonadales », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  4. (en) Hisaya Kojima, Mamoru Kanda, Kazuhiro Umezawa et Manabu Fukui, « Sulfurimicrobium lacus gen. nov., sp. nov., a sulfur oxidizer isolated from lake water, and review of the family Sulfuricellaceae to show that it is not a later synonym of Gallionellaceae. », Archives of Microbiology, vol. 203,‎ , p. 317-323
  5. (en) Selma Vieira, Katharina J Huber, Meina Neumann-Schaal, Alicia Geppert, Manja Luckner, Gerhard Wanner et Jörg Overmann, « Usitatibacter rugosus gen. nov., sp. nov. and Usitatibacter palustris sp. nov., novel members of Usitatibacteraceae fam. nov. within the order Nitrosomonadales isolated from soil. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71,‎ , p. 4631 (DOI 10.1099/ijsem.0.004631)

Liens externes

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