Thermothérapie des agrumes

La thermothérapie des agrumes est l'application de hautes ou basses températures en vue d'inactiver des micro-organismes pathogènes. C'est, avec le micro-greffage de méristème et la culture in vitro de style/stigmate de fleur stérilisée, une technique éprouvée de régénération (plus rarement en français «assainissement») des agrumes[1],[2],[3]. Dans les publications académiques, l'anglais citrus sanitation est plus fréquent que citrus regeneration[4].

La thermothérapie se pratique en enceinte climatique sur de jeunes plantes en pot, ou sur les arbres de plein champs, ou in vitro sur les boutures, les bourgeons, les graines ou les pistils de fleurs soumis à un traitement thermique et ou chimique préalable. Les nouvelles techniques de sélection végétale (NPBT) fondées sur une approche génétique ont relancé la recherche sur des protocoles actualisés de régénération des agrumes, notamment éliminant les étapes chronophages de micro-greffe [5],[6].

Le Citrus tristeza virus.

Nécessité de la régénération des agrumes

« La production de plantes exemptes de virus est nécessaire pour lutter contre les maladies virales, importer de nouveaux cultivars d'autres pays, échanger du matériel de sélection entre pays ou régions et préserver le matériel génétique des plantes » écrivent Min-Rui Wang et Zhen-Hua Cui (2018) dans une synthèse sur les méthodes d'éradication des virus des plantes cultivées[7]. Les agrumes, la pomme de terre et la vigne sont en premier lieu porteurs de virus de quarantaine, dont le CTV pour les agrumes largement endémique hors d'Europe, des États-Unis et d'Australie[8].

La technique de régénération des agrumes à partir de la graine est notamment employée en Corée (2013): semis, culture in vitro de l'albumen à 40°C suivie d'une micro greffe)[9]. Elle n'est pas satisfaisante car elle produit des plantes avec des caractères indésirables: épineuses, régression au stade juvénile[10]. La régénération par thermothérapie et/ou greffe de méristème a été très tôt privilégiée.

Historique

En 1922, James Johnson mesure les plages de température d'inactivation du virus mosaïque de la pomme de terre[11]. La publication de G. Nyland et A. C. Goheen, Heat therapy of virus diseases of perennial plants (1969) est une synthèse fondatrice, ils écrivent que l’obtention de plantes indemnes (virus non complètement labiles) de virus s'obtient par thermothérapie combinée avec une culture de méristème. Ils donnent une table de températures pour le traitement par l'air chaud du Candidatus Liberibacter (28 j à 40 °C constants), du CTV (29 j à 39 °C constants)[12].

En 1957, Desjardins découvre que les symptômes de la tristeza disparaissent d'un limettier après passage de 3 semaines en armoire à 40 °C constants[13]. Roistacher en 1974 parvient plus rapidement au même résultat sur le même agrume en alternant 28 °C portés à 40 °C le jour et 27 °C la nuit, non seulement CTV mais aussi CPsV (Citrus psorosis virus), le viroïde Concave gum sont éliminés, suivent de nombreux autres pathogènes inactivés eux aussi[13]. En 1965, des boutures-greffons de lime, après h dans l'eau à 45 °C sont greffés et ne développent aucun symptôme d'exocortis[14]. La même année le traitement en plein champs quelques heures pendant une semaine à la vapeur à 49 °C fait disparaitre les symptômes de la maladie du dragon jaune (causée par la bactérie Candidatus Liberibacter asiaticus)[15].

Agrume en préconditionnement (31°C, 16 h diurne et 60% d'humidité) dans une enceinte climatique

En 1978, Chiou-Hsiung Huang montre que l'inactivation du CTV nécessite soit un long séjour de 15 semaines à 40 °C diurne/30 °C nocturne, soit des températures plus élevées (39 à 45 °C diurne, 29 à 33 °C nocturne pendant 10 semaines)[16]. En 2013, l'Unité de recherche sur les agrumes de Jeju soumet des agrumes infestés par le CTV et défoliées à 40 °C constants pendant une semaine. 88,5 % des Setoka sont alors négatifs au CTV. La micro greffe des pousses nouvelles en chambre à 40 °C constants pendant une semaine suivie de tests PCR et d'une cultures à 27 °C diurne/16 °C nocturne est un succès[17].

Protocoles normalisés de thermothérapie

Les protocoles disponibles prévoient une phase de préconditionnement (6 semaines) pendant laquelle les plantes infectées sont progressivement habituées aux températures élevées (31 à 35°C le jour) avec repos nocturne, elles entrent une végétation robuste. Suit la thermothérapie proprement dite (4 à 12 semaines selon les protocoles) à 40 °C pendant 16 h alternées avec un repos nocturne de h à 30 °C. Le préconditionnèrent des porte-greffes non greffés à l'effet inverse, il sensibilise les plantes [18].

USA

En 2010, dans une publication illustrée le Citrus Germplasm Introduction Program publie son Citrus quarantine, sanitary and certification programs in the USA. La quarantaine américaine a une procédure de régénération (qui n'existe pas à la quarantaine française [19]) ainsi décrite :

« Le bourgeon infecté est greffé sur citrange puis préconditionnés à 28 à 40 °C diurne et 25 °C nocture. Après préconditionnement, les plants sont placés à 40 °C le jour ( 16 h) et 30 °C la nuit 8 h pendant 3 mois. A la sortie de l'enceinte climatique le porte-greffe est élagué et les pousses issues des bourgeons greffés sont enracinée par marcottage jusqu'à croissance suffisante. Cette méthode est efficace contre la plupart des virus des agrumes, sauf les viroïdes (suit la méthode de la greffe de méristème) »

[20].

Nappo

En 2015, l'Organisation nord-américaine pour la protection des plantes (NAPPO) publie un protocole TP 01 Thermotherapy or thermaltherapy qui prévoit :

« Les plantes greffées sont préconditionnées en serre chaude à 32 à 40 °C diurne et 26 à 30 °C nocturne pendant 2 à 4 semaines ou en enceinte climatique avec augmentation progressive de la température (à partir de 30 à 32 °C et augmentation de 1 degré par semaine) pendant 4 à 6 semaines. Dans un second temps les plantes sont ensuite placées dans des enceintes climatiques avec une intensité lumineuse d'environ 2 000 lux à 1 m des lampes, une humidité relative de 50 à 60 % et maintenues à 40 °C pendant 16 h diurne et 30 °C pendant 8 h nocturne durant 8 à 12 semaines. La plupart des virus des agrumes sont alors éliminés avec succès.

Certains virus difficiles à éliminer, tels que le virus de la marbrure Dweet mottle virus et le virus des feuilles déchiquetées des agrumes (CiTLV - citrus tatter leaf virus) demandent des températures plus élevées toujours 16 h de jour et 8 h de nuit avec 8 semaines 40 °C diurne/30 °C nocturne puis 2 semaines à 42 °C diurne/30 °C nocturne et enfin 2 semaines à 44 °C/30 °C ou la micro-greffe du méristème »

[21].

bois porteur de CTV et bois sain

Pathogènes des agrumes et température

Les virus sont les principaux pathogènes de quarantaine chez les agrumes. Deux méthodes de thermothérapie sont utilisées pour la régénération des plantes infestées en concurrence avec la culture d'organes floraux.

Thermothérapie par séjour à plus de 40°C

Les températures non destructives de la plante-hôte. À mesure qu'on s'éloigne des plages de température dans lesquelles ils sont fonctionnels, les virus s'inactivent avec disparition des symptômes, puis subissent des atteintes irrémédiables de leur matériel génétique. Le niveau de température et la durée d'exposition constituent les variables de la thermothérapie aérienne classique qui est souvent complétée par une greffe de méristème[22]. Les problèmes de défoliation peuvent être limités avec des composés à base d'argent ( AgNO 3, AgNPs) [23].

Point d'inactivation thermique et durée d'exposition

En effet la montée en température a un double effet : réduire et jusqu'à éliminer les symptômes, réduire la vitesse de circulation des virus dans la plantes [24]. Une plante asymptomatique peut contenir des virus susceptibles de reprendre leur cycle infectieux si le point d'inactivation thermique (TIP) (la température la plus basse nécessaire pour l'inactivation complète d'un virus) n'est pas atteint pendant une durée critique d'exposition à déterminer, ce TIP est variable selon les virus[25],[24].

Ces observations avaient été faites sur le CTV (Citrus Triteza Virus) en 1974 par C. N. Roistacher et al.:

« les températures estivales très chaudes peuvent éliminer le virus de la tristeza des branches de mandarine pendant les mois d'été, mais le virus réapparaît pendant l'hiver et le printemps. Les symptômes de Tristeza peuvent être masqués si les températures sont suffisamment élevées. Lorsque les températures sont trop chaudes, des pièces climatisées ou spécialement refroidies sont souhaitables pour induire le développement rapide des symptômes de la tristeza »[26].

Thermothérapie par températures destructives

Les températures extrêmes appliquées brièvement détruisent les cellules plante-hôte à l'exception de quelques cellules indifférenciées, pauvres en eau[7]. Appliquées à la pulpe des graines ou du pistil des jeunes fleurs puis suivie d'une mise en culture in vitro des méristèmes survivants (embryogenèse somatique), cette seconde méthode présente de nombreux avantages[27],[28],[29].

Culture in vitro du stigmate de la fleur

A côté de ces méthodes l'embryogenèse somatique de style/stigmate de fleur est considérée comme l'une des méthodes les plus efficaces pour éradiquer les principaux virus des agrumes et les maladies apparentées. La régénération des plantes se fait par culture in vitro du style/stigmate de la fleur stérilisée soit par thermothérapie (méthode F. Carimi) soit par immersion dans des désinfectants (Tween 20, éthanol à 70 %, Clorox) avec un taux de réussite de 100% et permet d'obtenir rapidement des plantes saines [30].

enceinte climatique de culture entièrement programmable (durée du jour et de la nuit, CO2, etc.)

Régénération par micro-greffe: méthode complémentaire ou alternative

La micro-greffe est une méthode de régénération qui s'utilise à la suite d'une thermothérapie qui produit des jeunes pousses exemptes de virus soit seule à partir de jeunes pousses réputée naturellement sans virus directement greffés sur des porte-greffes cultivés en milieu sain, méthode utilisée et décrite par Hong-Ji Su à Taïwan en 2008 [31]. L'ensemble des opérations de micro-greffe se réalise en milieu aseptique [32]. Le CIHEAM écrit (2009) « Toutes les méthodes d’assainissement disponibles sont efficaces pour l’élimination du CTV, cependant, considérant leurs nombreux avantages, le greffage d'apex et l'embryogenèse somatique, à partir de stigma et stylet en culture in vitro, sont les techniques préférées » [33]. Et José Juárez, Pablo Aleza et Luis Navarro (2015) donnent une liste de 5 situations (dont les plantes difficiles à enraciner) où cette technique doit être préférée (En Espagne, environ 140 millions d'agrumes de pépinières certifiés et issus de plants microgreffés ont été plantés)[34].

La micro-greffe est une opération délicate avec des pourcentages de réussite faibles, souvent inférieurs à 35% [35].

La micro greffe d'apex in vivo sur des semis âgés de deux semaines donne (2021), chez C. maxima triploïde, 74% de plantes exemptes de CTV, l'élimination des 26 % de pousses positive permet après un an de produire des pieds mères débarrassés de virus CTV[36].

Protocole FAO

Dans son Manuel Technique Shoot-tip grafting in vitro (2012) la FAO indique les limites de la thermothérapie sur agrumes: les agrumes sensibles aux températures élevées et l'inefficience pour éliminer les virus yellow vein et dweet mottle virus, la bactérie Spiroplasma citri et les viroïdes. La FAO préconise d'utiliser les 2 méthodes [37].

Bibliographie

  • M. Meziane, D. Frasheri, Angela Carra, K. Djelouah, Francesco Carimi et A. M. d'Onghia, Citrus sanitation methods for the elimination of Citrus tristeza virus (CTV), Bari, CIHEAM, Options méditerranéennes : Série B, Études et Recherches, no 65, 2009, 5 p., lire en ligne
  • Shoot-Tip Grafting In Vitro to Obtain Citrus Planting Material Free of Graft-Transmissible Pathogens and for the Safe Movement of Citrus Budwood, FAO, 2014, 77 p. lire en ligne
  • Min-Rui Wang, Zhen-Hua Cui, Jing-Wei Li, Xin-Yi Hao, Lei Zhao et Qiao-Chun Wang, In vitro thermotherapy-based methods for plant virus eradication, Plant Methods, vol. 14, no 87, mars 2018 (accès libre) lire en ligne.

Liens externes

Laboratoires de thermothérapie des agrumes

  • Unité d’Assainissement viral des Agrumes de La Manouba (Tunisie), lire en ligne
  • Institut national de la recherche agronomique - Filière Agrumes (Maroc), lire en ligne
  • University of California Riverside Citrus Variety Collection est un des principaux spécialistes de la régénération des agrumes, lire en ligne
  • Institute of Biosciences and Bioresources IBBR UOS Palermo (anciennement Centro di Studio per il Miglioramento Genetico degli Agrumi (CMGA) (Italie) est le laboratoire de référence pour la régénération in vitro des agrumes[38].
  • page Valitest - projet de la Commission Européenne - visant à uniformiser et valider les tests de détection et de diagnostique des phytoravageurs .

Virus, températures, humidité, UV

  • Corrélation entre basse température et le faible indice UV et les épidémies de grippe en Europe du Nord de 2010 à 2018 [39]. Relation non linéaire de la température et de humidité avec le virus de la grippe [40].

Notes et références

  1. R. Vogel, M. Nicoli et Joseph M. Bové, « Le microgreffage de méristèmes in vitro. Son utilisation en Corse pour la régénération des agrumes », Fruits, vol. 43, no 3, , p. 167-173 (ISSN 0248-1294, lire en ligne, consulté le ).
  2. (ja) H. Ieki et S.-I. Yamada, « Inactivation du virus de la tristeza, du virus du nanisme satsuma et du citrus tatter leaf virus par thermothérapie », Bulletin of the Fruit Tree Research Station. Series B, no 11, , p. 71–87 (lire en ligne, consulté le ).
  3. Handaji N., Arsalane N. et Elyouri M., « Bilan de l'assainissement des variétés de Mandarinier et de tangelo de la collection d'El MenZeh », Al Awamia 105, , p. 9 (lire en ligne).
  4. « Google Scholar », sur scholar.google.com (consulté le ).
  5. Fabrizio Salonia, Angelo Ciacciulli, Lara Poles et Helena Domenica Pappalardo, « New Plant Breeding Techniques in Citrus for the Improvement of Important Agronomic Traits. A Review », Frontiers in Plant Science, vol. 11, (ISSN 1664-462X, PMID 32922420, PMCID 7456868, DOI 10.3389/fpls.2020.01234, lire en ligne, consulté le )
  6. (en) Priyanka Sharma, Bidhan Roy, Monish Roy et Gadge Sushant Sundarrao, « Citrus: A Need for its Conservation in Utilising its Medicinal Values through Biotechnological Tools », Internat. Journal Curr. Microbiol. App.Sci 9(6), , p. 3825 à 3834 (lire en ligne)
  7. Min-Rui Wang, Zhen-Hua Cui, Jing-Wei Li et Xin-Yi Hao, « In vitro thermotherapy-based methods for plant virus eradication », Plant Methods, vol. 14, (ISSN 1746-4811, PMID 30323856, PMCID 6173849, DOI 10.1186/s13007-018-0355-y, lire en ligne, consulté le ).
  8. (en) Scott J. Harper, « Citrus tristeza virus: Evolution of Complex and Varied Genotypic Groups », Frontiers in Microbiology, vol. 4, (ISSN 1664-302X, DOI 10.3389/fmicb.2013.00093, lire en ligne, consulté le ).
  9. (en) Chi Won Chae, Su Hyun Yun, Jae Ho Park, Jae Wook Hyun, Sang Wook Koh et Dong Hoon Lee, « Micrografting and Heat Treatment Combination for Eliminating Virus of CTV-infected Citrus », Journal of Life Science Vol. 23. No. 2., , p. 267 à 272 (lire en ligne)
  10. (en) Manuel Talon, Marco Caruso et Fred G. Gmitter jr, The Genus Citrus, Woodhead Publishing, , 538 p. (ISBN 978-0-12-812217-4, lire en ligne).
  11. (en) J Colhoun, « Effects of Environmental Factors on Plant Disease », Annual Review of Phytopathology, vol. 11, no 1, , p. 343–364 (ISSN 0066-4286 et 1545-2107, DOI 10.1146/annurev.py.11.090173.002015, lire en ligne, consulté le ).
  12. (en) George Nyland et A. C. Goheen, « Heat therapy of virus diseases of perennial plants », Annual Review of Phytopathology 7, , p. 331-354 (lire en ligne).
  13. (en) Roistacher, C. N, « Detection of Citrus Viruses by Graft Transmission: A Review », International Organization of Citrus Virologists Conference Proceedings, , p. 177 (ISSN 2313-5123, lire en ligne).
  14. (en) Rossetti, Victoria, Nakadaira, et Roessing, C., « Experiments on Heating Budwood to Eliminate Exocortis Virus », International Organization of Citrus Virologists Conference Proceedings, , p. 5 pages (ISSN 2313-5123, lire en ligne).
  15. (en-US) « Update on Thermotherapy Research », sur Citrus Industry Magazine, (consulté le ).
  16. (en) Chiou-Hsiung Huang, « Effect of hot-air treatment on likubin. tristeza virus and exocortis viroid diseases of citrus », Journal of Agricultural Research of China 27(2):, , p. 193 à198 (lire en ligne).
  17. Chi Won Chae, Su Hyun Yun, Jae Ho Park et Jae Wook Hyun, « Micrografting and Heat Treatment Combination for Eliminating Virus of CTV-infected Citrus », Journal of Life Science, vol. 23, no 2, , p. 267–272 (ISSN 1225-9918, DOI 10.5352/JLS.2013.23.2.267, lire en ligne, consulté le ).
  18. (en) B. Kassanis, « Some Effects of High Temperature on the Susceptibility of Plants to Infection with Viruses », Annals of Applied Biology, vol. 39, no 3, , p. 358–369 (ISSN 1744-7348, DOI 10.1111/j.1744-7348.1952.tb01018.x, lire en ligne, consulté le )
  19. ANSES, LABORATOIRE DE LA SANTÉ DES VÉGÉTAUX UNITÉ DE QUARANTAINE - Liste des méthodes et matrices pour la détection des organismes nuisibles, Paris, LABORATOIRE DE LA SANTÉ DES VÉGÉTAUX UNITÉ DE QUARANTAINE, , 12 p. (lire en ligne), p.8 QUARANTAINE CITRUS, FORTUNELLA, PONCIRUS ET LEURS HYBRIDES ET AUTRES RUTACÉES
  20. (en) Georgios Vidalakis, John V. da Graça et al., « Citrus quarantine, sanitary and certification programs in the USA. Prevention of introduction and distribution of citrus diseases », sur www.ars.usda.gov, mai-juin 2010 dans citrograph (consulté le ).
  21. (en) The Secretariat of the North American Plant Protection Organization, TP 01 THERMOTHERAPY OR THERMALTHERAPY, Ottawa, Ontario, Canada, K2B 0B9, NAPPO, (lire en ligne), p. 1-7.
  22. « Document card - FAO - Food and Agriculture Organization of the United Nations », sur fao.org (consulté le ).
  23. (en) Lamiaa M. Mahmoud, Jude W. Grosser et Manjul Dutt, « Silver compounds regulate leaf drop and improve in vitro regeneration from mature tissues of Australian finger lime (Citrus australasica) », Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC), vol. 141, no 3, , p. 455–464 (ISSN 1573-5044, DOI 10.1007/s11240-020-01803-8, lire en ligne, consulté le )
  24. (en) « Effects of Changing Temperature on Plant Virus Diseases », Advances in Virus Research, vol. 4, , p. 221–241 (ISSN 0065-3527, DOI 10.1016/S0065-3527(08)60600-4, lire en ligne, consulté le )
  25. (en) Jeanne Dijkstra et Cees P. de Jager, « Determination of the Thermal Inactivation Point », dans Practical Plant Virology: Protocols and Exercises, Springer, coll. « Springer Lab Manual », (ISBN 978-3-642-72030-7, DOI 10.1007/978-3-642-72030-7_19, lire en ligne), p. 102–104
  26. (en) The Plant Disease Reporter, U.S. Department of Agriculture, Agricultural Research Service., (lire en ligne)
  27. (en) F. Carimi, F. De Pasquale et F. G. Crescimanno, « Somatic embryogenesis and plant regeneration from pistil thin cell layers of Citrus », Plant Cell Reports, vol. 18, no 11, , p. 935–940 (ISSN 1432-203X, DOI 10.1007/s002990050687, lire en ligne, consulté le ).
  28. (en) Francisco Carimi, « Somatic embryogenesis and organogenesis in citrus for sanitatio and in vitro conservation », Improvement of the citrus sector by the setting up of the common conservation strategies for the free exchange of healthy citrus genetic resources. Bari : CIHEAM, , p. 115-128 (lire en ligne).
  29. « Options Méditerranéennes en ligne - Collection numérique - Citrus sanitation methods for the elimination of Citrus tristeza virus (CTV) », sur om.ciheam.org (consulté le ).
  30. (en-GB) Raheel Anwar, « Journal of Horticultural Science and Technology 3(1): 19-23 (2020) », sur Pakistan Society for Horticultural Science (consulté le )
  31. (en) Hong-Ji Su, PRODUCTION AND CULTIVATION OF VIRUS-FREE CITRUS SAPLINGS FOR CITRUS REHABILITATION IN TAIWAN, Taïwan, Asia-Pacific Consortium on Agricultural Biotechnology, , 64 pages (lire en ligne), p. 30 et seq. 4. ESTABLISHMENT OF VIRUS-FREE CITRUS NURSERY SYSTEM
  32. (en) G. Hussain, M. S. Wani, M. A. Mir et Z. A. Rather, « Micrografting for fruit crop improvement », African Journal of Biotechnology, vol. 13, no 25, (ISSN 1684-5315, DOI 10.4314/ajb.v13i25., lire en ligne, consulté le )
  33. (en) M Meziane, D Frasheri, A Carra, K Djelouah, Francesco Carimi, A-M d’Onghia, « Citrus s anitation methods for the elimination of Citrus tris teza virus (CTV) », Options Méditerranéennes : Série B. Etudes et Recherches; n. 65, , p. 177-180 (lire en ligne)
  34. « APPLICATIONS OF CITRUS SHOOT-TIP GRAFTING IN VITRO », sur www.actahort.org (consulté le )
  35. (en) Ali Ahmad Naz, Muhammad Jaskani, « In vitro studies on micrografting technique in two cultivars of citrus to produce virus free plants », Pakistan Journal of Botany, , p. 8 pages (lire en ligne)
  36. (ja) LE Minh–Ly, SAKAI Kaori, MIZUNOE Yuki, KAJIWARA Kohei, KAJIHARA Sayuri et WAKANA Akira, « Elimination of Citrus Tristeza Virus from Triploid Pummelo Cultivar [Citrus maxima (Burm.) Merr.] by In Vivo Micrografting on Seedlings of Three Citrus Cultivars - 九大コレクション - 九州大学附属図書館 », Bulletin de l'École supérieure d'agriculture, Université de Kyushu, (lire en ligne, consulté le ).
  37. « Detalles | FAO | Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura », sur www.fao.org (consulté le )
  38. « IBBR - UOS Palermo », sur IBBR/CNR - Istituto di Bioscienze e Biorisorse (consulté le ).
  39. (en) Aleksandr Ianevski, Eva Zusinaite, Nastassia Shtaida et Hannimari Kallio-Kokko, « Low Temperature and Low UV Indexes Correlated with Peaks of Influenza Virus Activity in Northern Europe during 2010–2018 », Viruses, vol. 11, no 3, , p. 207 (DOI 10.3390/v11030207, lire en ligne, consulté le )
  40. (en) « Effects of Absolute Humidity, Relative Humidity, Temperature, and Wind Speed on Influenza Activity in Toronto, Ontario, Canada », sur Applied and Environmental Microbiology (consulté le )
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