إطار القراءة المفتوح عكس الاتجاه

إطار القراءة المفتوح عكس الاتجاه واختصارا (يوأورف: uORF) هو إطار قراءة مفتوح يقع في المنطقة غير المترجمة 5' من الرنا الرسول الخاص بحقيقيات النوى (عكس الاتجاه بالنسبة لإطار القراءة المفتوح الرئيسي) ويقوم بتنظيم ترجمة إطار القراءة المفتوح الرئيسي للرنا الرسول، غالبا بتثبيط ترجمته.[1] توجد حالات قليلة (مثل جين Gcn4 لدى الخميرة) يقوم فيها اليوأورف بتعزيز ترجمة إطار القراة المفتوح الرئيسي.[2][3]

مخطط يوضح مغم 5' لرنا رسول ومن بينها إطار القراءة المفتوح عكس الاتجاه بين كودون البداية والنهاية بخط أحمر.

يُعرّف اليوأورف على أنه تسلسل يبدأ بكودون بدء في المنطقة غير المترجمة 5' وينتهي بكودون توقف في الإطار (في نفس إطار القراءة) قبل نهاية تسلسل إطار القراءة المفتوح الرئيسي ويبلغ طوله على الأقل 9 نوكليوتيدات بما في ذلك كودون التوقف.[4] حوالي 50% من الجينات البشرية تملك يوأورفا في المنطقة غير المترجمة 5' ومعظمها يثبط ترجمة إطار القراءة المفتوح الرئيسي، وتملك بعض الجينات أكثر من يوأورف واحد.[5] تخفض اليوأورفات التعبير عن البروتين بنسبة 30-80% مع تأثير صغير على مستويات الرنا الرسول، وهي متعددة الأشكال ^{[الإنجليزية]} ويسبب تطفرها أمراضا للإنسان ويُخفض بشكل كبير التعبير عن إطاراتها المفتوحة الرئيسية.[4]

تسمى نواتج ترجمة اليوأورفات بالميكروببتيدات ويمكن تميزها عن المحتوى الخلوي بواسطة مطيافية الكتلة،[6] ويشارك بعضها في تنظيم الترجمة أو الارتباط ببروتينات أخرى في الخلية والتأثير على مسارات أخرى.[5]

مراجع

Hinnebusch, Alan G. (29 أغسطس 1997)، "Translational Regulation of Yeast GCN4: A WINDOW ON FACTORS THAT CONTROL INITIATOR-tRNA BINDING TO THE RIBOSOME *"، Journal of Biological Chemistry (باللغة الإنجليزية)، 272 (35): 21661–21664، doi:10.1074/jbc.272.35.21661، ISSN 0021-9258، PMID 9268289.
Vilela C, McCarthy JE (أغسطس 2003)، "Regulation of fungal gene expression via short open reading frames in the mRNA 5'untranslated region"، Molecular Microbiology، 49 (4): 859–67، doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x، PMID 12890013.
Lovett PS, Rogers EJ (يونيو 1996)، "Ribosome regulation by the nascent peptide"، Microbiological Reviews، 60 (2): 366–85، doi:10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996، PMC 239448، PMID 8801438.
Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (2009)، "Upstream open reading frames cause widespread reduction of protein expression and are polymorphic among humans"، Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America، Proceedings of the National Academy of Sciences، 106 (18): 7507–12، Bibcode:2009PNAS..106.7507C، doi:10.1073/pnas.0810916106، PMC 2669787، PMID 19372376، مؤرشف من الأصل (PDF) في 20 يناير 2022.
Joana SilvaRafael FernandesLuísa Romão (2019)، "Translational Regulation by Upstream Open Reading Frames and Human Diseases"، The mRNA Metabolism in Human Disease، Springer, Cham، ص. 99-116، doi:10.1007/978-3-030-19966-1_5، ISBN 978-3-030-19965-4، مؤرشف من الأصل في 05 مارس 2022، اطلع عليه بتاريخ 02 ديسمبر 2021.
Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (2013)، "Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells"، Nature Chemical Biology، 9 (1): 59–64، doi:10.1038/nchembio.1120، PMC 3625679، PMID 23160002.

بوابة علم الوراثة
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Hinnebusch, Alan G. (29 أغسطس 1997)، "Translational Regulation of Yeast GCN4: A WINDOW ON FACTORS THAT CONTROL INITIATOR-tRNA BINDING TO THE RIBOSOME *"، Journal of Biological Chemistry (باللغة الإنجليزية)، 272 (35): 21661–21664، doi:10.1074/jbc.272.35.21661، ISSN 0021-9258، PMID 9268289.

[2] Vilela C, McCarthy JE (أغسطس 2003)، "Regulation of fungal gene expression via short open reading frames in the mRNA 5'untranslated region"، Molecular Microbiology، 49 (4): 859–67، doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x، PMID 12890013.

[3] Lovett PS, Rogers EJ (يونيو 1996)، "Ribosome regulation by the nascent peptide"، Microbiological Reviews، 60 (2): 366–85، doi:10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996، PMC 239448، PMID 8801438.

[Calvo_Pagliarini_Mootha_pp._7507–7512-4] Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (2009)، "Upstream open reading frames cause widespread reduction of protein expression and are polymorphic among humans"، Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America، Proceedings of the National Academy of Sciences، 106 (18): 7507–12، Bibcode:2009PNAS..106.7507C، doi:10.1073/pnas.0810916106، PMC 2669787، PMID 19372376، مؤرشف من الأصل (PDF) في 20 يناير 2022.

[Springer-5] Joana SilvaRafael FernandesLuísa Romão (2019)، "Translational Regulation by Upstream Open Reading Frames and Human Diseases"، The mRNA Metabolism in Human Disease، Springer, Cham، ص. 99-116، doi:10.1007/978-3-030-19966-1_5، ISBN 978-3-030-19965-4، مؤرشف من الأصل في 05 مارس 2022، اطلع عليه بتاريخ 02 ديسمبر 2021.

[6] Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (2013)، "Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells"، Nature Chemical Biology، 9 (1): 59–64، doi:10.1038/nchembio.1120، PMC 3625679، PMID 23160002.