ميكروببتيد

الميكروببتيد (بالإنجليزية: Micropeptide)‏ ويُعرف كذلك باسم الميكروبروتين، هو عديد ببتيد طوله أقل من 100-150 حمض أميني يُشفر من إطارات قراءة مفتوحة قصيرة (sORFs).[1][2][3] وفي هذا السياق، هو مختلف عن الكثير من الببتيدات الصغيرة النشطة الأخرى التي تنتج من قصٍ لبروتينات كبيرة أثناء تعديلات ما بعد الترجمة.[1][4] من حيث الطول، الميكروبيبتيدات أقصر من البروتينات «المعيارية» التي متوسط طولها 330 في بدائيات النوى و449 في حقيقيات النوى.[5] تسمى الميكروببتيدات أحيانا حسب موضعها الجينومي، على سبيل المثال: ناتج النسخ من إطار قراءة مفتوح عكس الاتجاه ^{[الإنجليزية]} (uORF) يمكن أن يُسمى: الببتيد المشفر من uORF ‏(uPEP).[6] لا تملك الميكروببتيدات تسلسلات تأشير في النهاية الأمينية، وهذا يوحي بأنها على الأرجح ستتموقع في السيتوبلازم.[1] لكن تم العثور على بعض الميكروببتيدات في أحياز خلوية أخرى، كما يوحي به تواجد ميكروببتيدات عبر غشائية.[7][8] وهي موجودة لدى كلٍ من حقيقيات وبدائيات النوى.[1][9][10]

يُمكن نسخ الميكروببتيدات من المناطق 5' غير المترجمة (5'UTRs)، الجينات الصغيرة، الرنا الرسول عديد السيسترون و الرنا غير المشفر الطويل المخطوء في توصيفه.

إطارات القراءة المفتوحة الصغيرة التي تُترجم منها الميكروببتيدات يمكن أن تتواجد في المناطق 5' غير المترجمة (5'UTRs)، الجينات الصغيرة، الرنا الرسول عديد السيسترون. بعض الجينات المشفرة للميكروببتيدات تم توصيفها خطأً في البداية على أنها رنا غير مشفر طويل (lncRNA).[11]

نظرا لطولها الصغير، تم تجاهل الـsORFs، لكن تم تحديد مئات الآلاف من الميكروببتيدات المفترضة عبر عدة تقنيات في العديد من الكائنات. جزء صغير فقط من إطارات القراءة الصغيرة هذه التي تملك قابلية للترجمة تم تأكيد التعبير عنها وعن امتلاك الميكروببتيدات الناتجة منها لوظيفة. الميكروببتيدات التي تم تحديد وظائفها، تقوم في العموم بأدوارٍ في التأشير الخلوي، تخلق الأعضاء والفيسيولوجيا الخلوية. مع اكتشاف المزيد من الميكروببتيدات يتم اكتشاف وظائفها كذلك. أحد وظائفها التنظيمية هي عملها كمفتاح ببتيدي يقوم بمنع التعبير عن التسلسلات المشفرة مع الاتجاه بتعطيل الريبوسومات عبر تنشيطها المباشر أو غير المباشر بواسطة جزيئات صغيرة.[11]

مراجع

"Little things make big things happen: A summary of micropeptide encoding genes"، EuPA Open Proteomics، 3: 128–137، 2014، doi:10.1016/j.euprot.2014.02.006.
"Mining for Micropeptides"، Trends in Cell Biology، 27 (9): 685–696، سبتمبر 2017، doi:10.1016/j.tcb.2017.04.006، PMC 5565689، PMID 28528987.
"Detailed analysis of putative genes encoding small proteins in legume genomes"، Frontiers in Plant Science، 4: 208، 2013، doi:10.3389/fpls.2013.00208، PMC 3687714، PMID 23802007.
"Lilliputians get into the limelight: novel class of small peptide genes in morphogenesis"، Development, Growth & Differentiation، 50 Suppl 1: S269–76، يونيو 2008، doi:10.1111/j.1440-169x.2008.00994.x، PMID 18459982.
"Protein-length distributions for the three domains of life"، Trends in Genetics، 16 (3): 107–9، مارس 2000، doi:10.1016/s0168-9525(99)01922-8، PMID 10689349.
"Short Open Reading Frames and Their Encoded Peptides"، Proteomics، 18 (10): e1700035، مايو 2018، doi:10.1002/pmic.201700035، PMID 29691985.
"A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance"، Cell، 160 (4): 595–606، فبراير 2015، doi:10.1016/j.cell.2015.01.009، PMC 4356254، PMID 25640239.
"Control of muscle formation by the fusogenic micropeptide myomixer"، Science، 356 (6335): 323–327، أبريل 2017، Bibcode:2017Sci...356..323B، doi:10.1126/science.aam9361، PMC 5502127، PMID 28386024.
"Peptide-assisted degradation of the Salmonella MgtC virulence factor"، The EMBO Journal، 27 (3): 546–57، فبراير 2008، doi:10.1038/sj.emboj.7601983، PMC 2241655، PMID 18200043.
"Replication initiation proteins regulate a developmental checkpoint in Bacillus subtilis"، Cell، 104 (2): 269–79، يناير 2001، doi:10.1016/s0092-8674(01)00211-2، hdl:1721.1/83916، PMID 11207367، S2CID 15048130.
"Emerging evidence for functional peptides encoded by short open reading frames"، Nature Reviews. Genetics، 15 (3): 193–204، مارس 2014، doi:10.1038/nrg3520، PMID 24514441، S2CID 22543778.

بوابة علم الوراثة
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[:0-1] "Little things make big things happen: A summary of micropeptide encoding genes"، EuPA Open Proteomics، 3: 128–137، 2014، doi:10.1016/j.euprot.2014.02.006.

[:1-2] "Mining for Micropeptides"، Trends in Cell Biology، 27 (9): 685–696، سبتمبر 2017، doi:10.1016/j.tcb.2017.04.006، PMC 5565689، PMID 28528987.

[3] "Detailed analysis of putative genes encoding small proteins in legume genomes"، Frontiers in Plant Science، 4: 208، 2013، doi:10.3389/fpls.2013.00208، PMC 3687714، PMID 23802007.

[4] "Lilliputians get into the limelight: novel class of small peptide genes in morphogenesis"، Development, Growth & Differentiation، 50 Suppl 1: S269–76، يونيو 2008، doi:10.1111/j.1440-169x.2008.00994.x، PMID 18459982.

[5] "Protein-length distributions for the three domains of life"، Trends in Genetics، 16 (3): 107–9، مارس 2000، doi:10.1016/s0168-9525(99)01922-8، PMID 10689349.

[6] "Short Open Reading Frames and Their Encoded Peptides"، Proteomics، 18 (10): e1700035، مايو 2018، doi:10.1002/pmic.201700035، PMID 29691985.

[:2-7] "A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance"، Cell، 160 (4): 595–606، فبراير 2015، doi:10.1016/j.cell.2015.01.009، PMC 4356254، PMID 25640239.

[:3-8] "Control of muscle formation by the fusogenic micropeptide myomixer"، Science، 356 (6335): 323–327، أبريل 2017، Bibcode:2017Sci...356..323B، doi:10.1126/science.aam9361، PMC 5502127، PMID 28386024.

[:4-9] "Peptide-assisted degradation of the Salmonella MgtC virulence factor"، The EMBO Journal، 27 (3): 546–57، فبراير 2008، doi:10.1038/sj.emboj.7601983، PMC 2241655، PMID 18200043.

[:5-10] "Replication initiation proteins regulate a developmental checkpoint in Bacillus subtilis"، Cell، 104 (2): 269–79، يناير 2001، doi:10.1016/s0092-8674(01)00211-2، hdl:1721.1/83916، PMID 11207367، S2CID 15048130.

[:6-11] "Emerging evidence for functional peptides encoded by short open reading frames"، Nature Reviews. Genetics، 15 (3): 193–204، مارس 2014، doi:10.1038/nrg3520، PMID 24514441، S2CID 22543778.