رنا ريبوسومي S5

الرنا الريبوسومي S5 (بالإنجليزية: ARN ribosomique 5S)‏ هو أحد جزيئات الرنا الريبوسومي الصغيرة ويتكون من 121 نوكليوتيد [2] ووزنه 40 كدا، وهو مكون هيكلي ووظيفي للوحدة الفرعية الكبيرة للريبوسوم في جميع نطاقات الحياة (بكتيريا، عتائق وحقيقيات النوى) باستثناء رنا المتقدرة لدى الفطريات والحيوانات.[3] تشير العلامة S5 إلى سرعة التثفل (الترسب) أثناء الطرد المركزي الفائق، والتي تقاس بوحدة سفيدبرغ.[4]

تمثيل ثلاثي الأبعاد لجزيء رنا ريبوسومي S5. مأخوذة من بنية الوحدة الريبوسومية الفرعية S50 للإشريكية القولونية، ومبنية على المجهر الإلكتروني النافذ.[1]

التخليق الحيوي

لدى حقيقيات النوى، يتواجد الرنا 5S عادة في مشغلات الرنا الريبوسومي مع الاتجاه من الرنا الريبوسومي الخاص بالوحدة الفرعية الكبيرة والصغيرة، ويترجمون معا إلى نسخة أولية عديدة السيسترون.[5] ميزة خاصة بجينوم حقيقيات النوى هي تواجدُ عدة جينات مشفِّرة للرنا 5S ‏ (5S rDNA) متجمعة في تكرارات ترادفية، مع كون عددها يختلف من جنس لآخر.[6][7] يُخلَّق الرنا 5S الخاص بحقيقيات النوى بواسطة بوليميراز الرنا 3 في حين أن بقية جزيئات الرنا الريبوسومي الأخرى تُقص من الرنا الأولي 45S المنسوخ بواسطة بوايميراز الرنا 1. في الخلية البيضية للقيطم، تبين أن الأصابع 4-7 من أصابع الزنك التسعة الخاصة بعامل النسخ TFIIIA يمكنها الارتباط بالموقع المركزي للرنا 5S.[8][9] الارتباط بين الرنا 5S وTFIIIA له وظيفتان: الأولى كبت ترجمة المزيد من جين الرنا 5S والثانية ضمان استقرار نسخة الرنا حتى تكون هنالك حاجة إليها عند تجميع الريبوسوم.[10]

البنية

تتكون البنية الثانوية للرنا 5S من خمسة لوالب (يرمز إليها من V-I بالأرقام الرومانية)، أربع حلقات (E-B) ومفصل واحد وتشكل جميع هذه الأنماط البنيوية بنية تشبه حرف Y. الحلقتان C وD هما حلقتان جذعيتان نهائيتان، والحلقتان B وE داخليتان.[6] تبعا لدراسات علم تطور السلالات من الأرجح أن اللولبين I وIII سلفيان (موروث من سلف مشترك).[11] يشمل اللولب III جزيئتي أدينوسين عاليتا الانحفاظ.[12] يُعتقد أن اللولب V -وهو بنية حلقة جذعية- يتآثر مع عامل النسخ TFIIIA.[6]

مراجع
  1. Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000)، "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 A resolution"، J Mol Biol، 298 (1): 35–59، doi:10.1006/jmbi.2000.3635، PMID 10756104.
  2. (بالإنجليزية) Homo sapiens RNA, 5S ribosomal 17 (RNA5S17), ribosomal RNA, sur le site du NCBI. نسخة محفوظة 2 فبراير 2018 على موقع واي باك مشين.
  3. (بالإنجليزية) Maciej Szymanski, Miroslawa Z. Barciszewska, Volker A. Erdmann et Jan Barciszewski, « 5S Ribosomal RNA Database », في Nucleic Acid Research, vol. 30, no 1, janvier 2002, ص.  176-178 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 22 août 2014)] نسخة محفوظة 22 مارس 2021 على موقع واي باك مشين.
  4. Szymanski M, Barciszewska MZ, Erdmann VA, Barciszewski J (يناير 2002)، "5S Ribosomal RNA Database"، Nucleic Acids Res.، 30 (1): 176–8، doi:10.1093/nar/30.1.176، PMC 99124، PMID 11752286.
  5. Kaczanowska, M؛ Rydén-Aulin, M (سبتمبر 2007)، "Ribosome biogenesis and the translation process in Escherichia coli"، Microbiology and Molecular Biology Reviews، 71 (3): 477–494، doi:10.1128/MMBR.00013-07، PMC 2168646، PMID 17804668.
  6. Ciganda, Martin؛ Williams, Noreen (يوليو 2011)، "Eukaryotic 5S rRNA biogenesis"، Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA، 2 (4): 523–533، doi:10.1002/wrna.74، PMC 3278907، PMID 21957041.
  7. Douet, J؛ Tourmente, S (يوليو 2007)، "Transcription of the 5S rRNA heterochromatic genes is epigenetically controlled in Arabidopsis thaliana and Xenopus laevis"، Heredity، 99 (1): 5–13، doi:10.1038/sj.hdy.6800964، PMID 17487217.
  8. McBryant, SJ؛ Veldhoen, N؛ Gedulin, B؛ Leresche, A؛ Foster, MP؛ Wright, PE؛ Romaniuk, PJ؛ Gottesfeld, JM (1995)، "Interaction of the RNA binding fingers of Xenopus transcription factor IIIA with specific regions of 5 S ribosomal RNA"، Journal of Molecular Biology، 248 (1): 44–57، doi:10.1006/jmbi.1995.0201، PMID 7731045.
  9. Searles, MA؛ Lu D؛ Klug A (2000)، "The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA"، J Mol Biol، 301 (1): 47–60، doi:10.1006/jmbi.2000.3946، PMID 10926492.
  10. Pelham, HRB؛ Brown DD (1980)، "A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA"، Proc. Natl. Acad. Sci. USA، 77 (7): 4170–4174، doi:10.1073/pnas.77.7.4170، PMC 349792، PMID 7001457.
  11. Sun, FJ؛ Caetano-Anollés, G (نوفمبر 2009)، "The evolutionary history of the structure of 5S ribosomal RNA"، Journal of Molecular Evolution، 69 (5): 430–43، doi:10.1007/s00239-009-9264-z، PMID 19639237.
  12. DiNitto, JP؛ Huber, PW (23 أكتوبر 2001)، "A role for aromatic amino acids in the binding of Xenopus ribosomal protein L5 to 5S rRNA"، Biochemistry، 40 (42): 12645–53، doi:10.1021/bi011439m، PMID 11601989.
  • بوابة الكيمياء الحيوية
  • بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.