Dominio PAS

El dominio PAS es un dominio estructural de proteínas que se encuentra presente en muchas proteínas de señalización donde son utilizados como sensores de señal.[2][3] Los dominios PAS se encuentran en una gran variedad de organismos desde bacterias a humanos. El dominio Pas debe su nombre a la letra inicial de tres proteínas en las que se encuentra:

Per – proteína del periodo circadiano.
Arnt – proteína translocadora del receptor nuclear Ah.
Sim – proteína single-minded que regula el desarrollo del sistema nervioso central de Drosophila.

Estructura cristalográfica de un dominio PAS de la proteína bacteriana sensora de oxígeno fixL.[1] La proteína está coloreada del siguiente modo: (N-terminal = azul, C-terminal = rojo. El ligando hemo es mostrado como varillas (carbono = blanco, nitrógeno = azul, oxígeno = rojo, hierro = naranja).

Muchas proteínas con dominios PAS detectan la señal a través de un cofactor asociado como el hemo.[4]

Referencias

Código PDB 1y28; Dunham CM, Dioum EM, Tuckerman JR, Gonzalez G, Scott WG, Gilles-Gonzalez MA (julio de 2003). «A distal arginine in oxygen-sensing heme-PAS domains is essential to ligand binding, signal transduction, and structure». Biochemistry 42 (25): 7701-8. PMID 12820879. doi:10.1021/bi0343370.
Ponting CP, Aravind L (noviembre de 1997). «PAS: a multifunctional domain family comes to light». Curr. Biol. 7 (11): R674-7. PMID 9382818.
Hefti MH, Françoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J (marzo de 2004). «The PAS fold. A redefinition of the PAS domain based upon structural prediction». Eur. J. Biochem. 271 (6): 1198-208. PMID 15009198.
Gilles-Gonzalez MA, Gonzalez G (febrero de 2004). «Signal transduction by heme-containing PAS-domain proteins». J. Appl. Physiol. 96 (2): 774-83. PMID 14715687. doi:10.1152/japplphysiol.00941.2003.

Datos: Q36626

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[pmid12820879-1] Código PDB 1y28; Dunham CM, Dioum EM, Tuckerman JR, Gonzalez G, Scott WG, Gilles-Gonzalez MA (julio de 2003). «A distal arginine in oxygen-sensing heme-PAS domains is essential to ligand binding, signal transduction, and structure». Biochemistry 42 (25): 7701-8. PMID 12820879. doi:10.1021/bi0343370.

[pmid9382818-2] Ponting CP, Aravind L (noviembre de 1997). «PAS: a multifunctional domain family comes to light». Curr. Biol. 7 (11): R674-7. PMID 9382818.

[pmid15009198-3] Hefti MH, Françoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J (marzo de 2004). «The PAS fold. A redefinition of the PAS domain based upon structural prediction». Eur. J. Biochem. 271 (6): 1198-208. PMID 15009198.

[pmid14715687-4] Gilles-Gonzalez MA, Gonzalez G (febrero de 2004). «Signal transduction by heme-containing PAS-domain proteins». J. Appl. Physiol. 96 (2): 774-83. PMID 14715687. doi:10.1152/japplphysiol.00941.2003.