Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales

Entre 1957 y 1974 la Flacso tuvo como sede única Santiago de Chile. Estuvo bajo patrocinio de la Universidad de Chile. Se crearon las siguientes escuelas de posgrado en sociología y ciencia política:

• Escuela Latinoamericana de Sociología (ELAS) (1957-1973)
• Con financiamiento del Banco Interamericano de Desarrollo (BID) se formó la Escuela Latinoamericana de Ciencia Política y Administración Pública (ELACP 1966-1973).

Posteriormente se creó el Instituto Coordinador de Investigaciones Sociales (ICIS 1969-1973). Durante la década de 1960 se transformó en un importante centro y polo de atracción de la investigación y docencia en ciencias sociales en América Latina. Importante fue el influjo de científicos sociales provenientes del Brasil después del golpe de 1964. Flacso colaboró con el Centro Latinoamericano de Investigaciones en Ciencias Sociales (Centro, en portugués Centro Latinoamericano de Pesquisas em Ciencias Sociais), de Río de Janeiro, Brasil, creado en 1957. El Centro funcionó con aportes de la UNESCO durante 1957-1968, desde 1969 lo hizo el gobierno brasileño, hasta su disolución a fines de la década de 1990.

Sin embargo, el golpe de Estado en Chile por parte de Augusto Pinochet durante 1973 y la persecución política posterior obligaron a cerrar el ELAS y el ELACP en Santiago. Asimismo, se decidió trasladar la secretaria general. El Estado chileno decidió terminar el convenio y quitar, en 1978, la personalidad jurídica otorgada a la Flacso. En 1991 se adheriría nuevamente al Acuerdo.

En 1975, en la Asamblea General de la Flacso, se estableció un modelo descentralizado de sedes en América Latina. Como resultado, se crearon:

• Sedes académicas - Para realizar actividades docentes de posgrado y especialización de nivel superior y de carácter permanente, conducentes a un magíster o un doctorado, junto con actividades de investigación social. La creación de una sede debe ser en un país que suscriba el convenio y aprobado por la Asamblea General.
• Programas Académicos - Tienen un conjunto de actividades de nivel superior, determinadas por los órganos directivos correspondientes en cualquier país latinoamericano y por acuerdo del Consejo Superior.
• Proyectos - Con actividades específicas de tiempo limitado en cualquier país y por acuerdo del Consejo Directivo.

Su primer director fue el sociólogo boliviano René Zavaleta Mercado.

La evolución de las unidades académicas de la Flacso en cada país se describe enseguida:

• Chile (sede central 1956, programa 1974, sede académica 1991)
• Argentina (programa 1974, sede académica 1994)
• Ecuador (sede académica 1975)
• México (sede académica 1975)
• Guatemala (proyecto 1987, programa 1989, sede académica 1987)
• Brasil (proyecto 1981, programa 1984, sede académica 1989)
• Bolivia (programa 1984-1994)
• Costa Rica (programa 1992, sede académica 1997)
• Cuba (programa 1988)
• República Dominicana (programa 1988)
• El Salvador (programa 1992)
• Paraguay (sede académica 2007)
• Uruguay Programa 2007)
• Panamá (Programa 2009)
• Honduras Programa 2014)

Se realizaron actividades temporales en Uruguay y Paraguay en calidad de proyectos. Las diferentes sedes de Flacso tienen niveles muy diversos de desarrollo y orientación. Así en Cuba el Centro Flacso Programa - Cuba, tiene como Misión: Desarrollar la investigación y docencia de postgrado sobre la sociedad cubana y en particular sobre su desarrollo social. Visión: Organización promotora de las investigaciones y la docencia en postgrado, en el Área de Desarrollo Social en Latinoamérica y Cuba, conocida, nacional e internacionalmente, que alcanza la condición de Sede Flacso - Cuba otorgada por la Flacso Regional. Las sedes de Argentina, Costa Rica, Brasil y Ecuador son importantes centros de investigación y docencia superior.

Flacso, Quito Ecuador

Se estableció en el año 1974, a través de la firma de acuerdo entre Ecuador y el sistema internacional de educación FLACSO; sin embargo, posee autonomía administrativa.[5] Logró ser reconocida en la Ley de Educación Superior de ese país en el año 2000.[6] Su director para el período de julio de 2020 a julio de 2024. es Felipe Burbano de Lara.

Flacso México

Biblioteca René Zavaleta Mercado, Ciudad de México, México

Se estableció en 1975 mediante un acuerdo entre el Gobierno Mexicano y la Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales (Flacso), e inició sus actividades académicas en 1976. Cuenta con programas de posgrado a nivel maestría y doctorado inscritos en el Programa Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC) del CONACYT, así como especialidades. La actual Directora es la Dra. Gloria Del Castillo Alemán[7] habiendo sigo elegida para ejercer este cargo en el período 2018 - 2022. Por primera vez desde su fundación en 1975, la Flacso México es dirigida por una egresada de la sede.

Flacso Costa Rica

Se estableció como Programa en 1992 y pasó a ser Sede en 1997. La naturaleza, propósitos y actividades que rigen a FLACSO COSTA RICA, se encuentran estipuladas en el Convenio Internacional aprobado por Ley de la República de COSTA RICA n.º 6556, lo mismo que en la aprobación del addéndum al Convenio, aprobado mediante Ley n.º 8085 de 14 de febrero de 2001, publicada en la Gaceta n.º 44 del viernes 2 de marzo del año 2001. Cuenta con programas de formación cortos y posgrados, así como con distintas áreas de investigación académica y aplicada. Su Directora actualmente es la Dra. Ilka Treminio Sánchez elegida en la Vigésima Primera Asamblea General de la Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales, por resolución AGO Vigésima Primera/ uno cero.