HNRPU

La ribonucleoproteína nuclear heterogénea U (hnRPU) es una proteína que es codificada en humanos por el gen hnrpu.[1][2]

Ribonucleoproteína nuclear heterogénea U
Estructuras disponibles
PDB Buscar ortólogos: PDBe, RCSB
Identificadores
Símbolos hnRPU (HGNC: 5048) hnRNPU, SAF-A, U21.1
Identificadores
externos
Locus Cr. 1 q44
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
3192
UniProt
Q00839 n/a
RefSeq
(ARNm)
NP_004492 n/a

Este gen pertenece a la subfamilia de ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas expresadas ubicuamente (hnRNPs). Las hnRNPs son proteínas de unión a ARN que pueden formar complejos con el ARN nuclear heterogéneo (hnRNA). Estas proteínas son asociadas con moléculas de pre-ARNm en el núcleo, y parecen influenciar en el procesamiento de las moléculas de pre-ARNm y en otros aspectos del metabolismo y el transporte del ARNm. Mientras todas las hnRNPs están presentes en el núcleo parece que algo enlaza el núcleo y el citoplasma. Las proteínas hnRNPs presentan distintas propiedades de unión a los ácidos nucleicos. La proteína HNRPU contiene un dominio de unión a ARN y una región asociada a estructura específica para la unión de ADN. Además, parece que esta proteína está implicada en el empaquetamiento del hnRNA en grandes complejos de ribonucleoproteína. Durante la apoptosis, esta proteína es clave en la ruta dependiente de caspasas. El corte se produce en el sitio SALD, dando lugar a una pérdida de la capacidad de unión a ADN y al despegue de los sitios estructurales nucleares. No obstante, este corte no afecta a la función de la proteína codificada en el metabolismo del ARN. Se han descrito al menos dos transcritos alternativos de este gen.[3]

Interacciones

La proteína hnRPU ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias

  1. Fackelmayer FO, Richter A (Mar de 1994). «hnRNP-U/SAF-A is encoded by two differentially polyadenylated mRNAs in human cells». Biochim Biophys Acta 1217 (2): 232-4. PMID 7509195.
  2. Fackelmayer FO, Richter A (Sep de 1994). «Purification of two isoforms of hnRNP-U and characterization of their nucleic acid binding activity». Biochemistry 33 (34): 10416-22. PMID 8068679.
  3. «Entrez Gene: HNRNPU heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A)».
  4. Taniura, Hideo; Yoshikawa Kazuaki (2002). «Necdin interacts with the ribonucleoprotein hnRNP U in the nuclear matrix». J. Cell. Biochem. (United States) 84 (3): 545-55. ISSN 0730-2312. PMID 11813259.
  5. Martens, Joost H A; Verlaan Matty, Kalkhoven Eric, Dorsman Josephine C, Zantema Alt (Apr. de 2002). «Scaffold/matrix attachment region elements interact with a p300-scaffold attachment factor A complex and are bound by acetylated nucleosomes». Mol. Cell. Biol. (United States) 22 (8): 2598-606. ISSN 0270-7306. PMID 11909954.
  6. Eggert, M; Michel J, Schneider S, Bornfleth H, Baniahmad A, Fackelmayer F O, Schmidt S, Renkawitz R (Nov. de 1997). «The glucocorticoid receptor is associated with the RNA-binding nuclear matrix protein hnRNP U». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (45): 28471-8. ISSN 0021-9258. PMID 9353307.
  7. Kim, M K; Nikodem V M (Oct. de 1999). «hnRNP U inhibits carboxy-terminal domain phosphorylation by TFIIH and represses RNA polymerase II elongation». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 19 (10): 6833-44. ISSN 0270-7306. PMID 10490622.

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