Pithoviridae

Pithoviridae es una familia de virus gigantes morfológicamente similares que infectan protistas.[1][2] Contiene 7 géneros. La primera especie descrita fue Pithovirus sibericum en el 2014 después de que un espécimen fuera revivido del permafrost siberiano de 30 000 años de antigüedad.[3] Más adelante nuevos pitovirus han ido apareciendo llegando a describirse 6 géneros adicionales.[2][4]

Pithoviridae

Estructura de Pithovirus virion.
Taxonomía
Dominio: Varidnaviria
Reino: Bamfordvirae
Filo: Nucleocytoviricota
Clase: Megaviricetes
Orden: Pimascovirales
Familia: Pithoviridae
Clasificación de Baltimore
Grupo: I (Virus ADN bicatenario)

Descripción

El nombre de la familia Pithoviridae, hace referencia a los grandes contenedores de almacenamiento de la antigua Grecia conocidos como pithoi, fue elegido para describir la nueva familia y el género Pithovirus. Los pitovirus miden aproximadamente 1,5 μm (1500 nm) de longitud y 0,5 μm (500 nm) de diámetro, lo que lo convierte en el virus más grande encontrado hasta ahora. Son un 50% más grande en tamaño que Pandoravirus, los virus anteriores más grandes conocidos, son más grande que Ostreococcus, la célula eucariota más pequeña, aunque Pandoravirus tiene el genoma viral más grande, que contiene de 1,9 a 2,5 megabases de ADN.[3]

Los pitovirus tienen una pared gruesa y ovalada con una abertura en un extremo. Internamente, su estructura se asemeja a un panal de abejas. El genoma de los pitovirus contiene 500 genes distintos, más que un virus típico pero mucho menos que las 2556 supuestas secuencias de codificación de proteínas que se encuentran en Pandoravirus. Por lo tanto, su genoma está mucho menos denso que cualquier otro virus conocido. Dos tercios de sus proteínas son diferentes a las de otros virus.[5] A pesar de la similitud física con Pandoravirus, la secuencia del genoma de los pitovirus revela que no está relacionado con ese virus, sino con las familias Marseilleviridae, Iridoviridae y Ascoviridae. Todas estas familias contienen grandes virus icosaédricos con genomas de ADN. El genoma de los pitovirus tiene un contenido de GC del 36 % , similar al de Megavirus, en contraste con más del 61 % de Pandoravirus. [6] El genoma de los pitovirus es circular de ADN bicatenario de aproximadamente 610,000 pares de bases (pb), que codifica aproximadamente 467 marcos de lectura abiertos (ORF), que se traducen en 467 proteínas diferentes. El genoma codifica todas las proteínas necesarias para producir ARNm; estas proteínas están presentes en los viriones purificados de los pitovirus, por lo tanto, se somete a todo su ciclo de replicación en el citoplasma de su huésped, en lugar del método más típico de apoderarse del núcleo celular del huésped.[5]

Se ha estimado que la tasa de mutación del genoma es de sustituciones/sitio/año. Los autores han sugerido que estos virus evolucionaron hace al menos cientos de miles de años.[7]

Géneros

Se han descrito los siguientes géneros:[1][4]

  • Cedratvirus
  • Orpheovirus
  • Pithovirus
  • Solivirus
  • Solumvirus
  • Sissivirus
  • Misannotadedvirus

Referencias

  1. Pithoviridae. NCBI.
  2. Claire Bertelli, Linda Mueller, Vincent Thomas, Trestan Pillonel, Nicolas Jacquier, Gilbert Greub (2017). Cedratvirus lausannensis – digging into Pithoviridae diversity. Online Library.
  3. Ed Yong (3 de marzo de 2014). «Giant virus resurrected from 30,000-year-old ice : Nature News & Comment». Nature. Consultado el 3 de marzo de 2014.
  4. Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Cherif Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Santos Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fábio Dornas, Jacques Yaacoub Bou Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jônatas Abrahão, Bernard La Scola: Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere. NCBI.
  5. Levasseur A, Andreani J, Delerce J, Bou Khalil J, Robert C, La Scola B, Raoult D (July 2016). «Comparison of a modern and fossil Pithovirus reveals its genetic conservation and evolution». Genome Biol Evol 8 (8): 2333-9. PMC 5010891. PMID 27389688. doi:10.1093/gbe/evw153.
  6. Guglielmini, Julien; Woo, Anthony C.; Krupovic, Mart; Forterre, Patrick; Gaia, Morgan (10 de septiembre de 2019). «Diversification of giant and large eukaryotic dsDNA viruses predated the origin of modern eukaryotes». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 116 (39): 19585-19592. ISSN 0027-8424. PMC 6765235. PMID 31506349. doi:10.1073/pnas.1912006116.
  7. Duchêne, S; Holmes, EC (2018). «Estimating evolutionary rates in giant viruses using ancient genomes». Virus Evol 4 (1): vey006. PMC 5829572. PMID 29511572. doi:10.1093/ve/vey006.

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