Apicomplexa (classification phylogénétique)

Le cladogramme présenté ici se veut cohérent avec les dernières analyses publiées et accessibles. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie indiquée au bas de l'article.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.

Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

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  Plasmodium sp. (Plasmodiidae), agent du paludisme
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  Plasmodium vivax (Plasmodiidae), l'agent d'une des formes de paludisme
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  Toxoplasma gondii (Conoida, Sarcocystidae), agent de la toxoplasmose
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  Haemoproteus syrnii, parasite d'oiseaux

La répartition entre Coccidies et Grégarines pourrait s'atténuer : les Cryptosporidies, qui étaient classées parmi les premières, semblent bien être le groupe-frère des secondes, si tant est que la distinction des deux groupes doive être maintenue. De futures analyses phylogénétiques le diront.

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