Bacteroidetes

Bacteroidetes est un phylum composé de trois grandes classes de bactéries qui sont largement répandues dans l'environnement, notamment dans le sol, dans les sédiments, l'eau de mer et dans les intestins d'animaux.

Bacteroidetes

Classification
Règne	Bacteria

Embranchement

Bacteroidetes
Krieg et al., 2012

Classes de rang inférieur

Flavobacteriaceae
Flexibacteraceae
Rhodothermus
Sphingobacterium
Incertae sedis

Classification phylogénétique

Position :

Eubactéries
- Protéobactéries
- groupe :
  - Firmicutes
    - groupe Bacillus / Clostridium
    - Actinobactéries
  - groupe :
    - Cyanobactéries
    - groupe Thermus / Deinococcus
- groupe :
  - Bactéries vertes sulfureuses
  - groupe :
    - Flavobactéries
    - Bactéroïdes
- groupe :
  - Spirochètes
  - Chlamydiales
- Planctomycétales
- Bactéries vertes non sulfureuses
- Aquificales
- Thermotogales

De loin, la classe des Bacteroidales est l'une des plus étudiées, notamment les genres Bacteroides (organismes abondants dans les selles des animaux à sang chaud, dont les humains) et Porphyromonas (un groupe d'organismes vivant dans la cavité buccale de l'Homme).

Les membres du genre Bacteroides sont des agents pathogènes opportunistes, rarement membres des deux autres classes de pathogènes pour l'Homme.

Le chercheur Jeffrey Gordon et ses collègues ont constaté que la flore intestinale des humains obèses possède un pourcentage plus faible de bactéries du phylum Bacteroidetes. Toutefois, ils ne savent pas si les Bacteroidetes peuvent prévenir l'obésité ou si cette flore intestinale n'est pas simplement préférée par l'intestin chez les personnes non obèses[1]^,[2]^,[3].

Liste des classes

Selon Catalogue of Life (10 juin 2020)[4] :

classe Bacteroidia
classe Cytophagia
classe Flavobacteriia
classe Sphingobacteriia
classe Incertae sedis

Notes et références

(en) Ley R, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone C, Knight R, Gordon J, « Obesity alters gut microbial ecology », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102, n^o 31,‎ 2005, p. 11070–5 (PMID 16033867, DOI 10.1073/pnas.0504978102)
(en) Ley R, Turnbaugh P, Klein S, Gordon J, « Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity », Nature, vol. 444, n^o 7122,‎ 2006, p. 1022–3 (PMID 17183309, DOI 10.1038/4441022a)
(en) Turnbaugh P, Ley R, Mahowald M, Magrini V, Mardis E, Gordon J, « An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest », Nature, vol. 444, n^o 7122,‎ 2006, p. 1027–31 (PMID 17183312, DOI 10.1038/nature05414)
Catalogue of Life Checklist, consulté le 10 juin 2020

Liens externes

(en) Référence Catalogue of Life : Bacteroidetes Krieg et al., 2012 (consulté le 11 décembre 2020)
(fr+en) Référence ITIS : Bacteroidetes Krieg & al., 2012 (consulté le 24 novembre 2017)
(en) Référence Tree of Life Web Project : Bacteroidetes (consulté le 24 novembre 2017)
(en) Référence NCBI : Bacteroidetes (taxons inclus)

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[Gordon_2005-1] (en) Ley R, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone C, Knight R, Gordon J, « Obesity alters gut microbial ecology », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 102, n^o 31,‎ 2005, p. 11070–5 (PMID 16033867, DOI 10.1073/pnas.0504978102)

[Ley_2006-2] (en) Ley R, Turnbaugh P, Klein S, Gordon J, « Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity », Nature, vol. 444, n^o 7122,‎ 2006, p. 1022–3 (PMID 17183309, DOI 10.1038/4441022a)

[Turnbaugh_2006-3] (en) Turnbaugh P, Ley R, Mahowald M, Magrini V, Mardis E, Gordon J, « An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest », Nature, vol. 444, n^o 7122,‎ 2006, p. 1027–31 (PMID 17183312, DOI 10.1038/nature05414)

[CatalogueofLife10_juin_2020-4] Catalogue of Life Checklist, consulté le 10 juin 2020