Agent chaotropique

Un chaotrope, ou agent chaotropique par anglicisme, est une molécule qui détruit la structure spatiale (tridimensionnelle) des macromolécules biologiques telles que les protéines et les acides nucléiquesADN et ARN — et les dénature. Les chaotropes interfèrent avec les interactions intramoléculaires faibles (non covalentes), comme les liaisons hydrogène, les forces de van der Waals et l'effet hydrophobe.

Parmi les chaotropes, on trouve :

L'effet chaotrope de ces substances est obtenu à des concentrations élevées, de l'ordre de plusieurs moles par litre.

Utilisation

Les chaotropes sont utilisés en biochimie dans plusieurs cas :

  • dans les séparations d'acides nucléiques par électrophorèse, afin de détruire les appariements de bases ; ceci permet de séparer les deux brins de l'ADN et d'empêcher la formation de structures secondaires dans l'ARN ;
  • pour dénaturer les protéines et bloquer en particulier leur activité enzymatique ;
  • pour solubiliser des protéines agrégées ou précipitées.
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