Chlorobacteria

Les chlorobactéries (ou Chlorobacteria) forment un embranchement du règne Bacteria[1]. Il est possible que ce soit l'embranchement bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle[2] : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.

Chlorobacteria
Classification
Règne Bacteria
Sous-règne Negibacteria
Infra-règne Glidobacteria

Embranchement

Chlorobacteria
Cavalier-Smith, 1992

Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a lui-même donné son nom à la classe des Chloroflexi. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes.

Controverse sur leur structure

Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée[3], ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.

Position phylogénétique supposée


 phyl. Chlorobacteria

 phyl. Hadobacteria

 phyl. Cyanobacteria
 infrareg. Gracilicutes

 phyl. Spirochaetae

 phyl. Sphingobacteria

 phyl. Proteobacteria

 phyl. Planctobacteria

 phyl. Eurybacteria (paraphylétique)


 clade unimembrana

 subphyl. Endobacteria

 subphyl. Actinobacteria


 clade neomura

 phyl. Archaebacteria

 imp. Eukaryota










Classification

‘Candidatus Chlorothrix’♠

  • ‘Candidatus Chlorothrix halophila’♠

Classe Anaerolineae

  • Anaerolineales
    • Anaerolineaceae
      • Anaerolinea
        • A. thermolimosa
        • A. thermophila
      • Bellilinea
        • Bellilinea caldifistulae
      • Leptolinea
        • Leptolinea tardivitalis
      • Levilinea
        • Levilinea saccharolytica
      • Longilinea
        • Longilinea arvoryzae
  • Caldilineales
    • Caldilineaceae
      • Caldilinea
        • C. aerophila
        • C. tarbellica♠

Classe Chloroflexi

  • Kouleothrix♠
    • Kouleothrix aurantiaca♠
  • Chloroflexales
    • Dehalobium♠
      • Dehalobium chlorocoercia♠
    • Chloroflexaceae
      • Chloroflexus
        • C. aggregans
        • C. aurantiacus
      • Chloronema
        • Chloronema giganteum
      • Heliothrix
        • Heliothrix oregonensis
      • Roseiflexus
        • Roseiflexus castenholzii
    • Oscillochloridaceae
      • Oscillochloris
        • O. chrysea
        • O. trichoides
  • Herpetosiphonales
    • Herpetosiphonaceae
      • Herpetosiphon
        • H. aurantiacus
        • H. geysericola

Classe Dehalococcoidetes

  • Dehalococcoides♠
    • Dehalococcoides ethenogenes♠
  • Dehalogenimonas♠
    • Dehalogenimonas lykanthroporepellens ♠

Classe Ktedonobacteria

  • Ktedonobacterales
    • Ktedonobacteraceae
      • Ktedonobacter
        • Ktedonobacter racemifer
    • Thermosporotrichaceae
      • Thermosporothrix
        • Thermosporothrix hazakensis
  • Thermogemmatisporales
    • Thermogemmatisporaceae
      • Thermogemmatispora
        • T. foliorum♠
        • T. onikobensis♠

Classe Thermomicrobia

  • Thermobaculum♠
    • Thermobaculum terrenum♠
  • Thermomicrobiales
    • Thermomicrobiaceae
      • Thermomicrobium
        • Thermomicrobium roseum
  • Sphaerobacterales
    • Sphaerobacteraceae
      • Sphaerobacter
        • Sphaerobacter thermophilus

Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

Références
  1. Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266.
  2. Thomas Cavalier-Smith, 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol Direct. ; 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19
  3. DOI:10.1016/j.tim.2010.06.005
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