Pinophyta (classification phylogénétique)

Le cladogramme présenté ici se veut cohérent avec les dernières analyses publiées et accessibles. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie indiquée au bas de l'article.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.

Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

• 
  Vue automnale du glacier Lyman (Chiwawa Mountain, État de Washington, États-Unis).
  Conifères Pinaceae : Larix lyallii (en jaune), Abies lasiocarpa (en vert, avant-plan au centre), Pinus albicaulis (en vert, avant-plan à droite)
• 
  Podocarpus matudae (Podocarpaceae)
• 
  Taxus Cuspidata (Taxaceae)
• 
  If commun (Taxus baccata, Taxaceae). Fruit mature (à gauche) et immature (à droite)
• 
  Picea mariana (Pinaceae)
• 
  Araucaria araucana (Araucariaceae)
• 
  Cupressus macrocarpa (Cupressaceae), Monterey (Californie)
• 
  Sequoia sempervirens (Cupressaceae), Redwood National Park (Californie)

La principale incertitude à l'heure actuelle concerne la place des Gnétophytes, autrefois estimées plus proches des Angiospermes (au sein des Anthophytes) que des autres Gymnospermes. Elles semblent être le groupe-frère des Pinales, et même vraisemblablement des Pinacées au sein de celles-ci.