ARN polymérase ARN-dépendante

L'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp, RDR), parfois appelée ARN réplicase, est une nucléotidyltransférase qui catalyse la réaction :

nucléoside triphosphate + ARN_n  ${\displaystyle \rightleftharpoons }$  PPi + ARN_n+1.

ARN polymérase ARN-dépendante

ARN réplicase du virus de la fièvre Congo-Crimée (PDB 3PHU[1])

Données clés

N° EC	EC 2.7.7.48
N° CAS	9026-28-2

Activité enzymatique

IUBMB	Entrée IUBMB
IntEnz	Vue IntEnz
BRENDA	Entrée BRENDA
KEGG	Entrée KEGG
MetaCyc	Voie métabolique
PRIAM	Profil
PDB	RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
GO	AmiGO / EGO

Cette enzyme catalyse la réplication de l'ARN, contrairement à une ARN polymérase typique qui catalyse la biosynthèse d'un brin d'ARN à partir d'une matrice d'ADN. Elle catalyse donc la synthèse d'un brin d'ARN complémentaire à partir d'un brin d'ARN servant de matrice. Elle est indispensable à la réplication des virus à ARN à polarité négative et positive sans étape à ADN[2]^,[3], c'est-à-dire aux groupes III à V de la classification Baltimore :

• virus à ARN double brin (groupe III) tels que les familles Cystoviridae (en), Reoviridae, Hypoviridae, Partitiviridae, Totiviridae (en), ou encore les Birnaviridae ;
• virus à ARN monocaténaire à polarité positive (groupe IV) tels que les familles Nidovirales (dont Coronavirus), Picornavirales ou encore Tymovirales (en) ;
• virus à ARN monocaténaire à polarité négative (groupe V) et à génome non segmenté — Mononegavirales — ou segmenté : Arenavirus, Bunyavirus, Hantavirus, Nairovirus, Phlebovirus, Tenuivirus, Tospovirus et Orthomyxovirus — comprenant le virus de la grippe A, le virus de la grippe B, le virus de la grippe C et le virus de la grippe D ainsi que les genres Thogotovirus et Isavirus (virus de l'anémie infectieuse du saumon).

L'amorçage de la réaction a lieu à proximité de l'extrémité 3' du brin d'ARN modèle. Il peut s'agir d'un amorçage de novo (sans amorce) ou à l'aide d'une protéine virale liée au génome utilisée comme amorce. L'amorçage de novo consiste en l'addition d'un nucléoside triphosphate au 3'–OH du premier nucléoside triphosphate d'amorçage ; cette réaction est répétée par la suite au cours de la phase d'élongation avec d'autres nucléotides triphosphates afin de produire un brin d'ARN qui soit complémentaire du brin d'ARN modèle[4].