Variant Gamma du SARS-CoV-2

Le variant P.1, proche du variant B.1.1.248[4] - détecté au Japon mais provenant également du Brésil, comporte de nombreuses mutations problématiques, plus que le variant VOC-202012/01 britannique (ou anglais). La mutation N501Y le rendrait plus contagieux, à l'instar du VOC-202012/01 et du variant 501.V2 sud-africain. Il présente aussi la mutation E484K, tout comme le variant B.1.1.28 et le variant 501.V2, ce qui pourrait le rendre plus résistant aux anticorps issus d'une infection passée (cette hypothèse semblant être confirmée par le cas de la deuxième vague de Manaus), mais pourrait aussi altérer, et au pire, inactiver, l'efficacité des vaccins à ARN actuellement développés sur les modèles d'autres souches[5].

La mutation E484K, également présente chez le variant Bêta, est sans doute liée avec un échappement immunitaire[6].

Au total, le variant Gamma présente 21 mutations, dont 17 mutations faux-sens remplaçant certains acides aminés, 3 délétions (suppression de certaines nucléotides) et même une insertion[5].

En dehors du Brésil, en avril 2021, le principal foyer d'infection est lié à la station de ski canadienne de Whistler en Colombie-Britannique du Canada[7].

Santé publique France note, le 8 avril 2021, que ce variant P1-V3 est "majoritaire parmi les souches circulant en Guyane". Du 29 mars au 4 avril, le variant brésilien est "à l'origine de plus de 76 % des contaminations dans la région"[8].

Lors d'un test RT-PCR, le variant Gamma peut être distingué notamment par la mutation E484K, également présente chez le variant Bêta[6].