Yersinia
Les Yersinia sont un genre de bactéries appartenant à la famille des Enterobacteriaceae. En 2018, 18 espèces de Yersinia ont été décrites dont certaines sont pathogènes pour l'Homme.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Division | Proteobacteria |
| Classe | Gamma Proteobacteria |
| Ordre | Enterobacteriales |
| Famille | Enterobacteriaceae |
Espèces de rang inférieur
Yersinia pestis est l'agent de la peste, nommé ainsi en hommage à son découvreur Alexandre Yersin. Les autres Yersinia provoquent des maladies plus bénignes, les yersinioses entériques. La pathogénicité, pour l'homme, de l'espèce Yersinia wautersii nécessite d'autres investigations. Deux autres espèces sont pathogènes pour des animaux: Y. ruckeri (pathogène de poisson) et Yersinia entomophaga (pathogène d'insecte).
Écologie
Habitat
Ce sont des bactéries de l'environnement, présentes dans l'eau, les sols et sur les végétaux. Elles se retrouvent également sur les animaux malades ou porteurs sains mais également chez l'homme.
Rôle pathogène
Ce genre comporte plusieurs espèces responsables de yersinioses parmi lesquelles Yersinia pestis, Yersinia pseudotuberculosis et Yersinia enterocolitica
L'espèce Yersinia pestis
C'est la bactérie responsable de la peste, bien connue dans l'histoire par ses pandémies meurtrières et considérée par l'OMS comme une maladie réémergente. La dernière épidémie en France date de 1920 (peste des chiffonniers à Paris). Le dernier cas de peste en France a été enregistré en 1945. La peste reste à ce jour endémique en Asie, Afrique et Amérique. La maladie humaine présente trois principaux aspects cliniques :
La peste bubonique est transmise par une piqure de puce infectée par la bacille.
Il y a 2 types de peste pulmonaire: la peste pulmonaire secondaire qui évolue à partir d'une peste bubonique. La bactérie va migrer à partir du bubon dans différents organes dont les poumons et causer une infection pulmonaire. La peste pulmonaire primaire qui s'attrape par les gouttelettes de salives expulsées par un malade de peste pulmonaire.
Dans la peste septicémique, la bactérie va migrer dans le sang et causer une septicémie.
Sans antibiothérapie, la peste pulmonaire ou septicémique évolue inéluctablement vers la mort du malade. Pour la peste bubonique, environ 50% des malades guérissent sans traitement antibiotique.
L'espèce Yersinia enterocolitica
Toutes les souches ne sont pas pathogènes pour l'homme. La caractérisation biochimique des souches permet de les classer en différents biotypes: les souches du biotype 1A ne sont pas pathogènes, celles du biotype 1B sont très pathogènes et celles des biotypes 2, 3, 4 et 5 sont faiblement pathogènes. Les souches du biotype 4 sont les plus fréquemment isolées en France.
Elle est responsable d'infections intestinales qui se rencontrent à tout âge et dans toutes les conditions physiques mais qui prédominent chez les enfants de moins de 10 ans.
Les infections intestinales se caractérisent par des diarrhées et/ou douleurs abdominales et/ou fièvre. C'est la troisième cause de diarrhée d'origine bactérienne dans les pays tempérés et froids.
La contamination se fait par l'ingestion d'aliments contaminés ou moins souvent par contact direct avec un animal infecté.
Elles peuvent être responsables d'infections systémiques (septicémies) chez des personnes âgées présentant un terrain sous-jacent (diabète, cirrhose, cancer, surcharge en fer, etc.).
L'espèce Yersinia pseudotuberculosis
Elle est aussi responsable d'infections intestinales caractérisées par des diarrhées et/ou douleurs abdominales et/ou fièvre. Le mode de contamination est le même que pour Yersinia enterocolitica.
Elle est plus souvent associée à des infections systémiques chez les personnes âgées présentant un terrain sous-jacent.
Caractères bactériologiques
Morphologie miscroscopique
Aspect : Les Yersinia sont des bacilles Gram négatifs, immobiles, dépourvus de spores et de capsules.
Groupement : Variable, Ils se présentent isolés, en diplobacilles et en chainette.
Caractères de culture
Sur gélose ordinaire après 24 heures d'incubation à 37 °C, l'espèce présente des colonies de petites tailles (moins de 1 mm de diamètre) régulières, lisses et brillantes, de type Smooth ; transparentes ou translucides. Elles n'évoquent des colonies d'entérobactéries qu'après 36 à 48 heures d'incubation.
Condition de culture
Elles possèdent une température optimale de croissance entre 28 et 37 °C. Leur isolement dans un échantillon polymicrobien est facilité à 28 °C car les autres entérobactéries ont une température optimale de croissance de 37 °C. Ce sont des bactéries psychrotrophe, elles peuvent donc se multiplier à 4 °C. Elles peuvent donc être à l'origine de toxi-infections alimentaires à partir de denrées réfrigérées.
Milieux de cultures utilisés
Milieux non sélectifs :
Milieux sélectifs :
Caractères biochimiques
Le genre Yersinia se caractérise par un ensemble de caractères négatifs :
- Absence de fermentation de lactose, absence de gaz lors de la fermentation du glucose.
- Absence d'utilisation du citrate comme seule source de carbone sur milieu citrate-Simmons
- Absence de désaminase (sauf Yesinia massiliensis), de lysine-décarboxylase et de production de H2S
En revanche il y a fermentation constante du mannitol avec un test ONPG positif.
Certaines espèces se caractérisent par une uréase très active comme Yersinia entérocolitica et Yersinia pseudotuberculosis et d'autres par l'absence de cette enzyme comme Yersinia pestis.
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