تنبؤ بتآثر بروتين-بروتين

التنبؤ بتآثر بروتين-بروتين (بالإنجليزية: Protein–protein interaction prediction)‏ هو مجال يجمع بين المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء البنيوي في محاولةٍ لتحديد وفهرسة التآثرات الفيزيائية بين أزواج أو مجموعات البروتينات. فهم تآثرات البروتين-بروتين مهم في سبيل تقصي مسارات التأشير داخل الخلوية، نمذجة وتحديد بنُى المركبات البروتينية وللحصول على رؤىً وأفكارٍ حول مختلف العمليات البيوكيميائية.

برفلة تطور السلالات [الإنجليزية]: بروفايلات فيلوجينية لأربع جينات (C ،B ،A وD) مبينة يمينا. الرقم 1 يرمز لتواجد الجين في الجينوم و0 إلى غيابه. البروفايلان المتماثلان A وB موضحان بالأصفر.[1]

تجريبيا، يمكن استنتاج التآثرات الفيزيائية بين أزواج البروتينات من خلال العديد من التقنيات منها: أنظمة الهجينين الخميري، مقايسة تتام القطعة البروتينية [الإنجليزية] (PCA)، التنقية حسب الألفة/ مطيافية الكتلة، مصفوفات البروتين الدقيقة، انتقال طاقة رنين فورستر [الإنجليزية] (FRET) والرحلان الحراري ميكروي النطاق [الإنجليزية] (MST). هنالك مجهودات جارية لتحديد التآثروم الخاص بالعديد من الأجناس. عادة ما توفر التآثرات المحدَّدَة تجريبيا الأساس للتقنيات الحاسوبية للتنبؤ بالتآثرات المماثلة والشبيهة، على سبيل المثال: استخدام تسلسل بروتيني متماثل بين عدة أجناس. مع ذلك توجد طرق تتنبؤ بتآثرات جديدة من دون وجود معلومات سابقة حول تآثرات مماثلة.

مراجع
  1. Raman, Karthik (15 فبراير 2010)، "Construction and analysis of protein–protein interaction networks"، Automated Experimentation، 2 (1): 2، doi:10.1186/1759-4499-2-2، ISSN 1759-4499، PMC 2834675، PMID 20334628.
  • بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • بوابة تقانة حيوية
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.