دنا ز

الدنـا ز (بالإنجليزية: Z-DNA)‏ أو الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ز هو أحد الأشكال التي يتخذها اللولب المزدوج للدنا وهو يساري الإتجاه (عكس الدنا ب الأكثر شيوعا) حيث تلتف سلسلتا لولبه المزدوج حول المحور بنمط متعرج، ويعتقد أن الدنا ز أحد ثلاثة أكثر هياكل اللولب المزدوج نشاطا رفقة الدنا أ والدنا ب.

بنية الدنــا ز.

البنية

تختلف بنية الدنا ز عن البنيات اليمينية، في الواقع عادة ما تتم مقارنتها مع الدنا ب لتوضيح الاختلافات الكبيرة. الدنا ز يساري الاتجاه ولديه بنية تتكرر كل 2 من القواعد الزوجية. عكس الدنا أ وب الثلمان الكبير والصغير في الدنا ز يظهران اختلافا صغيرا في العرض. تَشكُلُ هذه البنية في الغالب غير ملائم إلا أن بعض الظروف قد تؤدي إلى ذلك مثل: تناوب التسلسل بيورين-بيريميدين (خاصة متعدد ₂(dGC))، لف الدنا الفائق السلبي أو الوسط العالي الملوحة أو الكاتيونات (جميعها في درجة الحرارة 37 °C، وpH 7.3-7.4). يمكن للدنا ز تكوين نقاط اتصال مع الدنا ب في بنية يتم فيها دفع أزواج قاعدية للخارج.[1]

هيئة الدنا ز صعبة الدراسة لأنها لا توجد كأحد الهيئات المستقرة للولب المزدوج وإنما هي بنية انتقالية تظهر أحيانا نتيجة وظيفة بيولوجية ما ثم تختفي بسرعة.[2]

مقارنة بين الأشكال الرئيسية الثلاث

من اليسار إلى اليمين: هيئة الدنا أ، هيئة الدنا ب وهيئة الدنا ز.

الخصائص الهيكلية لأشكال الدنا الرئيسية الثلاث للولب المزدوج[3] · [4] · [5]
خصائص	دنا أ	دنا ب	دنا ز
اتجاه اللولب المزدوج	يمين	يمين	يسار
تكرار الوحدة	1 bp	1 bp	2 bp
زاوية دوران اللولب المزدوج لكل زوج قاعدي	32,7°	34,3°	60°/2
عدد الأزواج القاعدية لكل دورة للولب المزدوج	11	10,5	12
السن اللولبي للولب المزدوج لكل دورة	2.82 نانومتر	3.32 نانومتر	4.56 نانومتر
البعد بين القواعد داخل اللولب المزدوج	0.26 نانومتر	0.34 نانومتر	0.37 نانومتر
القطر	2.3 نانومتر	2.0 نانومتر	1.8 نانومتر
انحناء الأزواج القاعدية بالنسبة لمحور اللولب المزدوج	+19°	−1,2°	−9°
متوسط الالتواء (propeller twist)	+18°	+16°	0°
اتجاه القواعد بالنسبة للسكر	عكس	عكس	بيريميدين : عكس بيورين : مع
انحناء روابط ذرات السكر (Sugar pucker)	'C3-إندو	'C2 - إندو	سايتوسين : 'C2 - إندو غوانين : 'C2 - إكسو

مراجع

de Rosa M, de Sanctis D, Rosario AL, Archer M, Rich A, Athanasiadis A, Carrondo MA (18 مايو 2010)، "Crystal structure of a junction between two Z-DNA helices"، Proc Natl Acad Sci USA، 107 (20): 9088–9092، Bibcode:2010PNAS..107.9088D، doi:10.1073/pnas.1003182107، PMC 2889044، PMID 20439751.
Zhang H, Yu H, Ren J, Qu X (2006)، "Reversible B/Z-DNA transition under the low salt condition and non-B-form polydApolydT selectivity by a cubane-like europium-L-aspartic acid complex"، Biophysical Journal، 90 (9): 3203–3207، Bibcode:2006BpJ....90.3203Z، doi:10.1529/biophysj.105.078402، PMC 1432110، PMID 16473901، مؤرشف من الأصل في 12 أكتوبر 2008.
DNA structure and function، Academic Press، ISBN 0-12-645750-6. {{استشهاد بكتاب}}: يحتوي الاستشهاد على وسيط غير معروف وفارغ: |month= (مساعدة)
Rich A, Norheim A, Wang AHJ، "The chemistry and biology of left-handed Z-DNA"، Annual Review of Biochemistry، 53: 791–846، doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043، PMID 6383204.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفون (link)
Ho PS (27 سبتمبر 1994)، "The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA"، Proc Natl Acad Sci USA، 91 (20): 9549–9553، Bibcode:1994PNAS...91.9549H، doi:10.1073/pnas.91.20.9549، PMC 44850، PMID 7937803.

بوابة علم الأحياء
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[deRosaM2010-1] Rosa M, de Sanctis D, Rosario AL, Archer M, Rich A, Athanasiadis A, Carrondo MA (18 مايو 2010)، "Crystal structure of a junction between two Z-DNA helices"، Proc Natl Acad Sci USA، 107 (20): 9088–9092، Bibcode:2010PNAS..107.9088D، doi:10.1073/pnas.1003182107، PMC 2889044، PMID 20439751.

[ZhangH2006-2] Zhang H, Yu H, Ren J, Qu X (2006)، "Reversible B/Z-DNA transition under the low salt condition and non-B-form polydApolydT selectivity by a cubane-like europium-L-aspartic acid complex"، Biophysical Journal، 90 (9): 3203–3207، Bibcode:2006BpJ....90.3203Z، doi:10.1529/biophysj.105.078402، PMC 1432110، PMID 16473901، مؤرشف من الأصل في 12 أكتوبر 2008.

[Sinden1994-3] DNA structure and function، Academic Press، ISBN 0-12-645750-6. {{استشهاد بكتاب}}: يحتوي الاستشهاد على وسيط غير معروف وفارغ: |month= (مساعدة)

[Rich1984-4] Rich A, Norheim A, Wang AHJ، "The chemistry and biology of left-handed Z-DNA"، Annual Review of Biochemistry، 53: 791–846، doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043، PMID 6383204.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة CS1: أسماء متعددة: قائمة المؤلفون (link)

[pmid7937803-5] Ho PS (27 سبتمبر 1994)، "The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA"، Proc Natl Acad Sci USA، 91 (20): 9549–9553، Bibcode:1994PNAS...91.9549H، doi:10.1073/pnas.91.20.9549، PMC 44850، PMID 7937803.