يونيبروت

يونيبروت (بالإنجليزية: UniProt)‏ هي قاعدة بيانات شاملة ذات جودة عالية مجانية لتسلسل البروتين والمعلومات الوظيفية، استمدت الكثير من المدخلات من مشاريع الجينوم. تحتوي قاعدة البيانات على كمية كبيرة من المعلومات المستخلصة من البحوث حول الوظيفة البيولوجية للبروتينات.

يونيبروت
المحتويات
الوصفUniProt is the Universal Protein resource, a central repository of بروتين data created by combining the Swiss-Prot, TrEMBL and PIR-PSD قاعدة بياناتs.
نوع البياناتProtein annotation
الكائناتAll
العناوين
مركز الأبحاثمعهد المعلوماتية الحيوية الأوروبي, UK; المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية, Switzerland; PIR, US.
الوصول
صيغة الملفCustom flat file, فاستا, GFF, إطار توصيف الموارد, لغة الترميز القابلة للامتداد.
الموقعwww.uniprot.org
www.uniprot.org/news/
رابط التحميلwww.uniprot.org/downloads & for downloading complete data sets ftp.uniprot.org
خدمة ويب URL نعم – جافا (لغة برمجة) واجهة برمجة التطبيقات see info here & رست see info here
الأدوات
ويببحث متقدم , بلاست, كلوستال ظهور جديد/تنزيل ID, تخطيط
متنوعات
الرخصةالمشاع الإبداعي
الإصدار نعم
تكرار إطلاق البيانات4 أسابيع
Curation policy نعم – manual and automatic. Rules for automatic annotation generated by database curators and computational algorithms.
الكيانات المرجعية نعم – both individual protein entries and searches

تاريخ الموقع

تم إنشاء سويس بروت في عام 1986 من قبل آموس بايروش خلال درجة الدكتوراه التي وضعها المعهد السويسري للمعلوماتية الحيوية ثم وضعت من قبل رولف أبويلر في المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية. تهدف سويس-بروت إلى توفير متواليات بروتينية موثوقة مرتبطة بمستوى عال من التعليقات التوضيحية (مثل وصف وظيفة البروتين، وهيكل النطاق، والتعديلات اللاحقة للترجمة، والمتغيرات، وما إلى ذلك)، والحد الأدنى من التكرار وارتفاع ومستوى التكامل مع قواعد البيانات الأخرى. وإدراكا منها بأن بيانات التسلسل قد تم توليدها بوتيرة تتجاوز قدرة سويس بروت على مواكبة، تم إنشاء تريمبل (مترجمة إمبل النيوكليوتيدات تسلسل مكتبة البيانات) لتوفير الشروح الآلي لتلك البروتينات ليس في السويسرية بروت. وفي الوقت نفسه، حافظت شرطة التدخل السريع على بير-بسد وقواعد البيانات ذات الصلة، بما في ذلك إبروكلاس، قاعدة بيانات من تسلسل البروتين والأسر المنسقة.

اقرأ أيضاً

روابط خارجية

مراجع
    • بوابة تقنية المعلومات
    • بوابة علم الأحياء
    • بوابة علم الحاسوب
    This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.