Cofactor de BRCA1

El cofactor de BRCA1, también conocido como COBRA1, es un gen humano[1] que codifica la proteína NELF-B. NELF-B es una de las subunidades del factor de elongación negativo (NELF), que también incluye NELF-A (WHSC2; MIM 606026), NELF-C o NELF-D (TH1L; MIM 605297) y NELF-E (RDBP; MIM 154040). NELF actúa junto con el factor de inducción de sensibilidad a DRB (DSIF), un heterodímero de SPT4 (SUPT4H1; MIM 603555) y SPT5 (SUPT5H; MIM 602102), para dar lugar a una pausa transcripcional de la ARN polimerasa II (véase MIM 180660).[2][3] COBRA1 fue identificado inicialmente en experimento de doble híbrido en levadura utilizando el dominio BRCT1 de la proteína BRCA1 como cebo.[4]

Cofactor de BRCA1
Estructuras disponibles
PDB Buscar ortólogos: PDBe, RCSB
Identificadores
Identificadores
externos
Locus Cr. 9 q34.3
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
25920
UniProt
Q8WX92 n/a
RefSeq
(ARNm)
XP_001133009 n/a

Interacciones

El cofactor de BRCA1 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias
  1. «Entrez Gene: COBRA1 cofactor of BRCA1».
  2. Narita, Takashi; Yamaguchi, Yuki; Yano, Keiichi; Sugimoto, Seiji; Chanarat, Sittinan; Wada, Tadashi; Kim, Dong-ki; Hasegawa, Jun et al. (Marzo de 2003). «Human transcription elongation factor NELF: identification of novel subunits and reconstitution of the functionally active complex». Molecular and Cellular Biology 23 (6): 1863-1873. ISSN 0270-7306. PMID 12612062. doi:10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  3. Yamaguchi, Y.; Takagi, T.; Wada, T.; Yano, K.; Furuya, A.; Sugimoto, S.; Hasegawa, J.; Handa, H. (2 de abril de 1999). «NELF, a multisubunit complex containing RD, cooperates with DSIF to repress RNA polymerase II elongation». Cell 97 (1): 41-51. ISSN 0092-8674. PMID 10199401. doi:10.1016/s0092-8674(00)80713-8. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  4. Ye, Q.; Hu, Y. F.; Zhong, H.; Nye, A. C.; Belmont, A. S.; Li, R. (10 de diciembre de 2001). «BRCA1-induced large-scale chromatin unfolding and allele-specific effects of cancer-predisposing mutations». The Journal of Cell Biology 155 (6): 911-921. ISSN 0021-9525. PMC 2150890. PMID 11739404. doi:10.1083/jcb.200108049. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  5. Aiyar, Sarah E.; Sun, Jian-long; Blair, Ashley L.; Moskaluk, Christopher A.; Lu, Yun-zhe; Ye, Qi-Nong; Yamaguchi, Yuki; Mukherjee, Amitava et al. (1 de septiembre de 2004). «Attenuation of estrogen receptor alpha-mediated transcription through estrogen-stimulated recruitment of a negative elongation factor». Genes & Development 18 (17): 2134-2146. ISSN 0890-9369. PMID 15342491. doi:10.1101/gad.1214104. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  6. Ewing, Rob M.; Chu, Peter; Elisma, Fred; Li, Hongyan; Taylor, Paul; Climie, Shane; McBroom-Cerajewski, Linda; Robinson, Mark D. et al. (2007). «Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry». Molecular Systems Biology 3: 89. ISSN 1744-4292. PMC 1847948. PMID 17353931. doi:10.1038/msb4100134. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  7. Narita, Takashi; Yamaguchi, Yuki; Yano, Keiichi; Sugimoto, Seiji; Chanarat, Sittinan; Wada, Tadashi; Kim, Dong-ki; Hasegawa, Jun et al. (Marzo de 2003). «Human transcription elongation factor NELF: identification of novel subunits and reconstitution of the functionally active complex». Molecular and Cellular Biology 23 (6): 1863-1873. ISSN 0270-7306. PMID 12612062. doi:10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  8. Lehner, Ben; Semple, Jennifer I.; Brown, Stephanie E.; Counsell, Damian; Campbell, R. Duncan; Sanderson, Christopher M. (Enero de 2004). «Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region». Genomics 83 (1): 153-167. ISSN 0888-7543. PMID 14667819. doi:10.1016/s0888-7543(03)00235-0. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  9. Zhong, Hongjun; Zhu, Jianhua; Zhang, Hao; Ding, Lihua; Sun, Yan; Huang, Cuifen; Ye, Qinong (10 de diciembre de 2004). «COBRA1 inhibits AP-1 transcriptional activity in transfected cells». Biochemical and Biophysical Research Communications 325 (2): 568-573. ISSN 0006-291X. PMID 15530430. doi:10.1016/j.bbrc.2004.10.079. Consultado el 28 de mayo de 2023.
  10. Ye, Q.; Hu, Y. F.; Zhong, H.; Nye, A. C.; Belmont, A. S.; Li, R. (10 de diciembre de 2001). «BRCA1-induced large-scale chromatin unfolding and allele-specific effects of cancer-predisposing mutations». The Journal of Cell Biology 155 (6): 911-921. ISSN 0021-9525. PMC 2150890. PMID 11739404. doi:10.1083/jcb.200108049. Consultado el 28 de mayo de 2023.
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