TRIM28

Motivo tripartito 28 (TRIM28), también conocida como factor intermediario transcripcional 1β (TIF1β), es una proteína codificada en humanos por el gen trim28.[1][2]

Motivo tripartito 28
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

 Lista de códigos PDB
Identificadores
Símbolos TRIM28 (HGNC: 16384) KAP1, FLJ29029, RNF96, TF1B, TIF1B
Identificadores
externos
Locus Cr. 19 q13.43
Patrón de expresión de ARNm
ancho=250px
Más información
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
10155 21849
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
Q13263 Q62318
RefSeq
(ARNm)
NM_005762 NM_011588
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_005753 NP_035718
Ubicación (UCSC)
Cr. 19:
59.06 – 59.06 Mb
Cr. 7:
13.02 – 13.03 Mb
PubMed (Búsqueda)


Función

TRIM28 está implicado en el control transcripcional por interacción con el dominio de represión asociado a la caja Krüppel presente en multitud de factores de transcripción. La proteína se localiza en el núcleo celular y parece encontrarse asociada con regiones específicas de la cromatina. Esta proteína pertenece a la familia de motivos tripartitos. Este motivo tripartito incluye tres dominios de unión a zinc, un dominio de dedos RING, una B-box tipo 1, una B-box tipo 2 y una región de hélice superenrollada.[3]

Interacciones

La proteína TRIM28 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Véase también

Referencias

  1. Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, Merla G, Cairo S, Luzi L, Riganelli D, Zanaria E, Messali S, Cainarca S, Guffanti A, Minucci S, Pelicci PG, Ballabio A (mayo de 2001). «The tripartite motif family identifies cell compartments». Embo J. 20 (9): 2140-51. PMC 125245. PMID 11331580. doi:10.1093/emboj/20.9.2140.
  2. Capili AD, Schultz DC, RauscherIII FJ, Borden KL (enero de 2001). «Solution structure of the PHD domain from the KAP-1 corepressor: structural determinants for PHD, RING and LIM zinc-binding domains». Embo J. 20 (1-2): 165-77. PMC 140198. PMID 11226167. doi:10.1093/emboj/20.1.165.
  3. «Entrez Gene: TRIM28 tripartite motif-containing 28».
  4. Nielsen, Anders Lade; Sanchez Cecilia, Ichinose Hiroshi, Cerviño Margarita, Lerouge Thierry, Chambon Pierre, Losson Régine (Nov. de 2002). «Selective interaction between the chromatin-remodeling factor BRG1 and the heterochromatin-associated protein HP1alpha». EMBO J. (England) 21 (21): 5797-806. ISSN 0261-4189. PMID 12411497.
  5. Cammas, Florence; Oulad-Abdelghani Mustapha, Vonesch Jean-Luc, Huss-Garcia Yolande, Chambon Pierre, Losson Régine (Sep. de 2002). «Cell differentiation induces TIF1beta association with centromeric heterochromatin via an HP1 interaction». J. Cell. Sci. (England) 115 (Pt 17): 3439-48. ISSN 0021-9533. PMID 12154074.
  6. Nielsen, A L; Oulad-Abdelghani M, Ortiz J A, Remboutsika E, Chambon P, Losson R (Apr. de 2001). «Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins». Mol. Cell (United States) 7 (4): 729-39. ISSN 1097-2765. PMID 11336697.
  7. Lechner, M S; Begg G E, Speicher D W, Rauscher F J (Sep. de 2000). «Molecular determinants for targeting heterochromatin protein 1-mediated gene silencing: direct chromoshadow domain-KAP-1 corepressor interaction is essential». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 20 (17): 6449-65. ISSN 0270-7306. PMID 10938122.
  8. Moosmann, P; Georgiev O, Le Douarin B, Bourquin J P, Schaffner W (Dec. de 1996). «Transcriptional repression by RING finger protein TIF1 beta that interacts with the KRAB repressor domain of KOX1». Nucleic Acids Res. (ENGLAND) 24 (24): 4859-67. ISSN 0305-1048. PMID 9016654.
  9. Peng, H; Begg G E, Harper S L, Friedman J R, Speicher D W, Rauscher F J (Jun. de 2000). «Biochemical analysis of the Kruppel-associated box (KRAB) transcriptional repression domain». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 275 (24): 18000-10. ISSN 0021-9258. PMID 10748030. doi:10.1074/jbc.M001499200.
  10. Rooney, J W; Calame K L (Nov. de 2001). «TIF1beta functions as a coactivator for C/EBPbeta and is required for induced differentiation in the myelomonocytic cell line U937». Genes Dev. (United States) 15 (22): 3023-38. ISSN 0890-9369. PMID 12269264. doi:10.1101/gad.937201.
  11. Chang, C J; Chen Y L, Lee S C (Oct. de 1998). «Coactivator TIF1beta interacts with transcription factor C/EBPbeta and glucocorticoid receptor to induce alpha1-acid glycoprotein gene expression». Mol. Cell. Biol. (UNITED STATES) 18 (10): 5880-7. ISSN 0270-7306. PMID 9742105.
  12. Schultz, David C; Ayyanathan Kasirajan, Negorev Dmitri, Maul Gerd G, Rauscher Frank J (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (United States) 16 (8): 919-32. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302.

Enlaces externos

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