Répétition ankyrine

Une répétition ankyrine est une configuration particulière des protéines consistant en 33 résidus d'acides aminés formant deux hélices α séparées par des boucles. Ces domaines sont très répandus, un peu chez les bactéries et les archées, mais surtout chez les eucaryotes. Ils sont absents de la plupart des virus, à l'exception des Poxviridae. Ils sont définis par leur structure et non par leur séquence dans la mesure où aucune séquence particulière n'a été associée aux répétitions ankyrine. La plupart des protéines qui contiennent ce type de structures possèdent de quatre à six répétitions ankyrine, l'ankyrine elle-même en ayant 24, le record étant probablement les 34 répétitions d'une protéine exprimée par Giardia lamblia[2].

Répétition ankyrine

Région D34 d'une ankyrine humaine (PDB 1N11[1])

Domaine protéique

Pfam	PF00023
InterPro	IPR002110
SMART	SM00248
PROSITE	PDOC50088
SCOP	1awc
SUPERFAMILY	1awc

Les répétitions ankyrine se replient généralement ensemble pour former une structure unique en forme de solénoïde linéaire appelée domaine de répétitions ankyrine. Ces domaines constituent l'une des plateformes les plus courantes assurant les interactions protéine-protéine. Elles interviennent dans un grand nombre de protéines aux fonctions diverses, principalement chez les eucaryotes. Les exemples provenant de procaryotes et de virus résultent peut-être de transferts horizontaux de gènes[3].

Cette structure a été observée dans des protéines assurant des fonctions très diverses, comme l'initiation de la transcription, la régulation du cycle cellulaire, le transport d'ions, la transduction de signal et les protéines du cytosquelette.