Haplogrupo L2 (ADNmt)

En genética humana, el Haplogrupo L2 es un haplogrupo de ADN mitocondrial humano típico de África y está definido por los marcadores genéticos 146, 150, 152, 2416, 8206, 9221, 10115, 13590, 16311 y 16390.[1]

Origen

L2 proviene con mayor probabilidad del África Occidental, ya que allí se encuentra la mayor diversidad. Al 2002 se mencionaba un origen probable en África Occidental o Central.[2] L2 tiene gran antigüedad, se estima un origen entre 87.000 y 107.000 años.[3]

Distribución

Se encuentra especialmente en el África Subsahariana, donde está aproximadamente en un tercio de la población. Las frecuencias más importantes son:

África Central: La más alta frecuencia en los pigmeos mbuti de la selva de Ituri en el Congo donde alcanza 64%.[4]
África Occidental: En Senegal 43-54%, Guinea-Bisáu 43% y Cabo Verde 41%.[5] En Ghana 40%.[6]
África Oriental: En la población nativa no-bantú del África Oriental está en un 44%.[7] Presencia importante en Sudán.
África Sudoriental: En Mozambique 36%.[5]

Subdivisiones

L2 tiene cinco subgrupos: L2a, L2b, L2c, L2d y L2e dispuestos según el siguiente árbol filogenético:[1]

Haplogrupo L2

L2a

	L2b

	L2c

L2d

L2e

Distribución

L2a-d
- L2a: Muy extendido en toda África, conforma el 52% del total de L2.[8] Alta frecuencia en la población nativa no-bantú del África Oriental 38% y en bantúes 15%,[7] pero a pesar de ello se le ha considerado una señal de la expansión bantú.[9] Importante en Mozambique con 33% y en África Occidental, destacando Cabo Verde 20%, Níger/Nigeria 20%, Guinea-Bisáu 17% y en árabes de Argelia 14%.[2] En Ghana 32%.[6] Extendido en el Norte de África, en los tuareg 20%. En Sudán 23%.
  - L2a1: Es el subgrupo más común del haplogrupo L2, también es el más común entre los afroamericanos. Extendido en toda el África y Cercano Oriente, especialmente en Israel, Burkina Faso, Egipto, Etiopía, Marruecos, Guinea-Bisáu, Kenia, Chad, Mozambique, Sudán, etc.[10]
    - L2a1a: En África nor-occidental, en Yemen, y Mozambique.
    - L2a1b: En Mozambique.
    - L2a1c: África Oriental, África Occidental, África del Norte, África sud-oriental y Cercano Oriente.
    - L2a1d: En los Emiratos Árabes Unidos[11] y Kuwait.
      - L2a1d1: En Somalia[12] y Sudán.[13]
      - L2a1d2: Asociado con los pueblos en África del Sur en países que incluyen Mozambique[14] y Zambia[15] y se e encuentra entre los joisán.[16]
    - L2a1g: Típico de los pueblos bantúes en África del Sur[17], incluidos los de Zambia, Madagascar y Sudáfrica.
    - L2a1k (con los marcadores genéticos G6722A y T12903C): Sólo se encuentra en Europa, incluido en checos, eslovacos, y serbios.[18] Anteriormente estaban clasificados como L2a1a.[19]
    - L2a1l: Argelia, los mende en Sierra Leona, la etnia wólof en Gambia, y en la España antigua.[20]
      - L2a1l1: Se encuentra entre las nunas[21] y los mossi[22] en Burkina Faso.
      - L2a1l2: Varios grupos étnicos en África Occidental, África del Norte y Europa Occidental, incluidos los mandinga en Guinea-Bisáu, los fulanis en Gambia y los pana en Burkina Faso.[20]
        L2a1l2a: Típico de los asquenazi de Europa Central y Europa Oriental y polacos que descienden de ellas.[23] Esto incluía uno judío del siglo 14 en Érfurt en Alemania.[24]
      - L2a1l3: Argelia y los yorubas de Nigeria.
    - L2a1n: Los yorubas de Nigeria, los mossi de Burkina Faso, Camerún, Portugal.
    - L2a1p: Nigeria, Burkina Faso, y los judíos de Marruecos.
  - L2a2: Mayoritario en los pigmeos mbuti.[4] Presente en los sara (Chad), San (Sudáfrica) y nuba (Sudán).
- L2b'c'd
  - L2b'c
    - L2b: Común en África Occidental y Nubia. Destaca Senegal, también en Guinea-Bisáu, Sudáfrica, Mozambique, Tanzania, Etiopía, Egipto, Argelia, Arabia Saudita y beduinos de Israel.[10]
    - L2c: Típico de África Occidental; destaca Senegal con 39%, Cabo Verde 16% y Guinea-Bisáu 16%.[5] Encontrado en Mauritania, Marruecos, Burkina Faso, Mozambique, Sudáfrica, Líbano y Países Bajos.
  - L2d: Bajas frecuencias. Especialmente en África Occidental, encontrándose en el Sahara Occidental, Nigeria, en los Wolof, mandingas y en Chad.[8] Encontrado en Yemen, Mozambique, Sudán,[25] También en Etiopía, Argelia y República dominicana.
L2e (antes L2d2): Típico de África Occidental.[2] Encontrado en Túnez,[26] en mandingas (Guinea-Bisáu) y afroamericanos.[10]

Véase también

Haplogrupos de ADN mitocondrial humano

L1–6

G

I

O

W

R2'JT

Enlaces externos

Dispersión del haplogrupo L2, del National Geographic
Árbol filogenético de L* PhyloTree.org de van Oven & Kayser M. 2009.

Referencias

van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. www.phylotree.org Archivado el 27 de julio de 2011 en Wayback Machine., mtDNA tree Build 2 (14 Oct 2008)
Salas, Antonio et al. 2002, The Making of the African mtDNA Landscape. Am J Hum Genet. 2002 November; 71(5): 1082–1111.
Tishkoff et al., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007
Quintana-Murci et al. 2008. Maternal traces of deep common ancestry and asymmetric gene flow between Pygmy hunter–gatherers and Bantu-speaking farmers 'Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'. 105(5): 1599
Rosa, Alexandra et al. 2004, MtDNA Profile of West Africa Guineans: Towards a Better Understanding of the Senegambia Region.
Veeramah, Krishna R et al 2010, Little genetic differentiation as assessed by uniparental markers in the presence of substantial language variation in peoples of the Cross River region of Nigeria
Sadie Anderson-Mann 2006, Phylogenetic and phylogeographic analysis of African mitochondrial DNA variation.
Torroni, Antonio et al 2001, Do the Four Clades of the mtDNA Haplogroup L2 Evolve at Different Rates?
Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002
Behar et al 2008b, The Dawn of Human Matrilineal Diversity Am J Hum Genet. 2008 May 9; 82(5): 1130–1140
Homo sapiens isolate 116 mitochondrion, complete genome GenBank: MF437155.1.
Homo sapiens isolate SOM1 haplogroup L2a1d1 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135841.1.
Homo sapiens isolate SUD54 haplogroup L2a1d1 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135855.1.
Homo sapiens isolate MOZ342 haplogroup L2a1d2 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135884.1
Homo sapiens isolate ZAM256 mitochondrion, complete genome GenBank: KJ185590.1
Homo sapiens isolate BOT6_274 mitochondrion, complete genome GenBank: KC622248.1.
Silva, Farida; Alshamali; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Trovoada, Maria Jesus; Černý, Viktor; Pereira, Luísa et al. (27 de julio de 2015). «60,000 years of interactions between Central and Eastern Africa documented by major African mitochondrial haplogroup L». Scientific Reports (en inglés) 5. PMC 4515592. PMID 26211407. doi:10.1038/srep12526.
Davidovic, Boris; Malyarchuk; Aleksic, Jelena M.; Derenko, Miroslava; Topalovic, Vladanka; Litvinov, Andrey; Stevanovic, Milena; Kovacevic-Grujicic, Natasa (marzo de 2015). «Mitochondrial DNA perspective of Serbian genetic diversity». American Journal of Biological Anthropology (en inglés) 156 (3): 449-465. PMID 25418795. doi:10.1002/ajpa.22670.
Malyarchuk, Boris A.; Miroslava Derenko; Maria Perkova; Tomasz Grzybowski; Tomas Vanecek; Jan Lazur (September 2008). «Reconstructing the phylogeny of African mitochondrial DNA lineages in Slavs». European Journal of Human Genetics (en inglés) 16 (9): 1091-1096. PMID 18398433. doi:10.1038/ejhg.2008.70.
Brook, Kevin (2022). The Maternal Genetic Lineages of Ashkenazic Jews (en inglés) (primera edición). Boston: Academic Studies Press. p. 78. ISBN 978-1-64469-984-3. doi:10.2307/j.ctv33mgbcn.
Homo sapiens isolate BF257 mitochondrion, complete genome GenBank: JQ044956.1.
Homo sapiens isolate BF271 mitochondrion, complete genome GenBank: JQ044919.1.
Brook, Kevin (2022). The Maternal Genetic Lineages of Ashkenazic Jews (en inglés) (primera edición). Boston: Academic Studies Press. pp. 77-78. ISBN 978-1-64469-984-3. doi:10.2307/j.ctv33mgbcn.
Waldman, Shamam; Backenroth, Daniel; Harney, Éadaoin; Flohr, Stefan; Neff, Nadia C.; Buckley, Gina M.; Fridman, Hila; Akbari, Ali; Rohland, Nadin; Mallick, Swapan; Olalde, Iñigo; Cooper, Leo; Lomes, Ariel; Lipson, Joshua; Cano Nistal, Jorge; Yu, Jin; Barzilai, Nir; Peter, Inga; Atzmon, Gil; Ostrer, Harry; Lencz, Todd; Maruvka, Yosef E.; Lämmerhirt, Maike; Beider, Alexander; Rutgers, Leonard V.; Renson, Virginie; Prufer, Keith M.; Schiffels, Stephan; Ringbauer, Harald; Sczech, Karin; Carmi, Shai; Reich, David (8 de diciembre de 2022). «Genome-wide data from medieval German Jews show that the Ashkenazi founder event pre-dated the 14th century». Cell (en inglés) 185 (25): Data S2, Table 1, numero de muestra I13865. ISSN 0092-8674. PMC 9793425. doi:10.1016/j.cell.2022.11.002.
Kivisild, Toomas et al 2004. Ethiopian Mitochondrial DNA Heritage: Tracking Gene Flow Across and Around the Gate of Tears. Am J Hum Genet. 2004 November; 75(5): 752–770.
Costa MD et al 2009, Data from complete mtDNA sequencing of Tunisian centenarians: testing haplogroup association and the "golden mean" to longevity.

Datos: Q3629931
Multimedia: Haplogroup L2 (mtDNA) / Q3629931

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[vanOven-1] van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. www.phylotree.org Archivado el 27 de julio de 2011 en Wayback Machine., mtDNA tree Build 2 (14 Oct 2008)

[Salas-2] Salas, Antonio et al. 2002, The Making of the African mtDNA Landscape. Am J Hum Genet. 2002 November; 71(5): 1082–1111.

[3] Tishkoff et al., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007

[Quintana08-4] Quintana-Murci et al. 2008. Maternal traces of deep common ancestry and asymmetric gene flow between Pygmy hunter–gatherers and Bantu-speaking farmers 'Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'. 105(5): 1599

[Rosa-5] Rosa, Alexandra et al. 2004, MtDNA Profile of West Africa Guineans: Towards a Better Understanding of the Senegambia Region.

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[Anderson-7] Sadie Anderson-Mann 2006, Phylogenetic and phylogeographic analysis of African mitochondrial DNA variation.

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[9] Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002

[Behar-10] Behar et al 2008b, The Dawn of Human Matrilineal Diversity Am J Hum Genet. 2008 May 9; 82(5): 1130–1140

[11] Homo sapiens isolate 116 mitochondrion, complete genome GenBank: MF437155.1.

[12] Homo sapiens isolate SOM1 haplogroup L2a1d1 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135841.1.

[13] Homo sapiens isolate SUD54 haplogroup L2a1d1 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135855.1.

[14] Homo sapiens isolate MOZ342 haplogroup L2a1d2 mitochondrion, complete genome GenBank: KR135884.1

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[16] Homo sapiens isolate BOT6_274 mitochondrion, complete genome GenBank: KC622248.1.

[Silva2015-17] Silva, Farida; Alshamali; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Trovoada, Maria Jesus; Černý, Viktor; Pereira, Luísa et al. (27 de julio de 2015). «60,000 years of interactions between Central and Eastern Africa documented by major African mitochondrial haplogroup L». Scientific Reports (en inglés) 5. PMC 4515592. PMID 26211407. doi:10.1038/srep12526.

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[Malyarchuk2008-19] Malyarchuk, Boris A.; Miroslava Derenko; Maria Perkova; Tomasz Grzybowski; Tomas Vanecek; Jan Lazur (September 2008). «Reconstructing the phylogeny of African mitochondrial DNA lineages in Slavs». European Journal of Human Genetics (en inglés) 16 (9): 1091-1096. PMID 18398433. doi:10.1038/ejhg.2008.70.

[Sin_nombre-1_5Tn-1-20] Brook, Kevin (2022). The Maternal Genetic Lineages of Ashkenazic Jews (en inglés) (primera edición). Boston: Academic Studies Press. p. 78. ISBN 978-1-64469-984-3. doi:10.2307/j.ctv33mgbcn.

[21] Homo sapiens isolate BF257 mitochondrion, complete genome GenBank: JQ044956.1.

[22] Homo sapiens isolate BF271 mitochondrion, complete genome GenBank: JQ044919.1.

[23] Brook, Kevin (2022). The Maternal Genetic Lineages of Ashkenazic Jews (en inglés) (primera edición). Boston: Academic Studies Press. pp. 77-78. ISBN 978-1-64469-984-3. doi:10.2307/j.ctv33mgbcn.

[24] Waldman, Shamam; Backenroth, Daniel; Harney, Éadaoin; Flohr, Stefan; Neff, Nadia C.; Buckley, Gina M.; Fridman, Hila; Akbari, Ali; Rohland, Nadin; Mallick, Swapan; Olalde, Iñigo; Cooper, Leo; Lomes, Ariel; Lipson, Joshua; Cano Nistal, Jorge; Yu, Jin; Barzilai, Nir; Peter, Inga; Atzmon, Gil; Ostrer, Harry; Lencz, Todd; Maruvka, Yosef E.; Lämmerhirt, Maike; Beider, Alexander; Rutgers, Leonard V.; Renson, Virginie; Prufer, Keith M.; Schiffels, Stephan; Ringbauer, Harald; Sczech, Karin; Carmi, Shai; Reich, David (8 de diciembre de 2022). «Genome-wide data from medieval German Jews show that the Ashkenazi founder event pre-dated the 14th century». Cell (en inglés) 185 (25): Data S2, Table 1, numero de muestra I13865. ISSN 0092-8674. PMC 9793425. doi:10.1016/j.cell.2022.11.002.

[25] Kivisild, Toomas et al 2004. Ethiopian Mitochondrial DNA Heritage: Tracking Gene Flow Across and Around the Gate of Tears. Am J Hum Genet. 2004 November; 75(5): 752–770.

[26] Costa MD et al 2009, Data from complete mtDNA sequencing of Tunisian centenarians: testing haplogroup association and the "golden mean" to longevity.