Variante preocupante

Variante preocupante (o VOC, por sus siglas en inglés) para el SARS-CoV-2 (que causa el COVID-19) es una categoría utilizada para las variantes del virus donde las mutaciones en su receptor RBD (Receptor Binding Domain) de la proteína de la espícula aumentan sustancialmente la afinidad de unión en el complejo RBD-hACE2, y que se relacionan con una rápida propagación de los contagios entre humanos.[1]

SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19

Antes de esto, una variante emergente puede haber sido etiquetada como "variante de interés".[2] Durante o después de una evaluación más completa como una "variante de interés", la variante generalmente se asigna a un linaje en el sistema de nomenclatura PANGOLIN[3] y a clados en los sistemas Nextstrain[4] y GISAID.[5]

Durante la pandemia de COVID-19, se ha observado que el virus SARS-CoV-2 muta, con ciertas combinaciones de mutaciones puntuales específicas demostrando ser más preocupantes que otras.[6] Esto se debió principalmente a razones de transmisibilidad y virulencia, y también con respecto a la posible aparición de mutaciones de escape.

Criterios

Varias organizaciones de salud nacionales e internacionales (por ejemplo, los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades) utilizan algunos o todos los siguientes criterios para evaluar las variantes:[7][8]

  • Mayor transmisibilidad
  • Mayor morbilidad
  • Aumento de la mortalidad
  • Mayor riesgo de COVID-19 persistente
  • Capacidad para evadir la detección mediante pruebas de diagnóstico.
  • Disminución de la susceptibilidad a los medicamentos antivirales (siempre y cuando dichos medicamentos estén disponibles)
  • Disminución de la susceptibilidad a los anticuerpos neutralizantes, ya sea terapéuticos (p. ej., plasma convaleciente o anticuerpos monoclonales) o en experimentos de laboratorio
  • Capacidad para evadir la inmunidad natural (p. ej., provocando reinfecciones)
  • Capacidad de infectar a individuos vacunados
  • Mayor riesgo de afecciones particulares, como el síndrome de respuesta inflamatoria sistémica o COVID de larga distancia.
  • Mayor afinidad por grupos demográficos o clínicos particulares, como niños o personas inmunodeprimidas.

Las variantes que parecen cumplir con uno o más de estos criterios pueden etiquetarse como variantes de interés o variantes bajo investigación (VUI, por sus siglas en inglés) en espera de la verificación y validación de estas propiedades. Una vez validadas, las organizaciones de monitoreo, como los CDC, pueden pasar de VUI a VOC.[2][6][9] Una categoría relacionada es "variante de alta consecuencia", utilizada por los CDC si hay evidencia clara de que la efectividad de las medidas de prevención o intervención para una variante en particular se reduce sustancialmente.[10]

Clasificaciones por país

Organización Mundial de la Salud

La OMS mantiene una lista mundial de variantes preocupantes.[11] El 26 de noviembre de 2021, la OMS agregó una quinta variante preocupante, la omicron, anteriormente conocida como B.1.1.529.[12] Omicron se une a las variantes alfa, beta, gamma y delta.

África

El NICD en Sudáfrica mantiene una lista de variantes e instalaciones de prueba localmente en colaboración con KRISP.[13][14]

Europa

A fines de noviembre de 2021, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades había declarado cuatro variantes como "variantes preocupantes": beta, gamma, delta y B.1.1.529 (llamadas "omicron" después de que se actualizó la referencia); Mu, Lambda y AY.4.2 se nombraron Variantes de interés (VOI), mientras que había 9 Variantes bajo supervisión. 25 variantes se describieron como "desescaladas".[15]

Reino Unido

A fines de noviembre de 2021, el Reino Unido tiene quince variantes en su lista de vigilancia, 4 con estado VOC y 11 calificadas como VUI. Los designados como VOC fueron alfa, beta, gamma y delta. A principios de diciembre de 2021, se agregó omicron a los VOC. Entre las Variantes bajo investigación se encuentra VUI-21OCT-01/ AY 4.2.[16]

Norteamérica

Canadá (a través de health-infobase.canada.ca)[17] y Estados Unidos (a través de CDC)[18] también mantienen listas de variantes preocupantes. A principios de diciembre, Canadá estaba monitoreando cinco variantes preocupantes: alfa, beta, gamma, delta y omicron, mientras que Estados Unidos estaba monitoreando dos: delta y omicron.[19]

Referencias
  1. Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). «Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern». Microorganisms (en inglés) 9 (5): 926. PMC 8146828. PMID 33925854. doi:10.3390/microorganisms9050926.
  2. «Variants: distribution of cases data». GOV.UK. 28 de enero de 2021. At "Differences between a Variant of Concern and Variant Under Investigation". Consultado el 19 de febrero de 2021. «Las variantes del SARS-CoV-2, si se considera que tienen propiedades epidemiológicas, inmunológicas o patogénicas preocupantes, se plantean para una investigación formal. En este punto, se designan Variante Bajo Investigación (en inglés, VUI) con un año, mes y número. Después de una evaluación de riesgos con el comité de expertos correspondiente, pueden ser designados Variante de Preocupación (VOC) ».
  3. Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á. (2020). «A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology». Nature Microbiology 5 (11): 1403-1407. PMC 7610519. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5.
  4. Bedford, Trevor (6 de enero de 2021). «Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy». nextstrain.org/blog. Consultado el 19 de enero de 2021.
  5. «clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')». www.gisaid.org. 4 de julio de 2020. Consultado el 7 de enero de 2021.
  6. Griffiths, Emma (15 de enero de 2021). «CanCOGeN Interim Recommendations for Naming, Identifying, and Reporting SARS-CoV-2 Variants of Concern». CanCOGeN (nccid.ca). Consultado el 25 de febrero de 2021.
  7. Contributor, IDSA (2 de febrero de 2021). «COVID "Mega-variant" and eight criteria for a template to assess all variants». Science Speaks: Global ID News (en inglés estadounidense). Consultado el 20 de febrero de 2021.
  8. CDC. «Emerging SARS-CoV-2 Variants» (en inglés estadounidense). Centers for Disease Control and Prevention. Consultado el 4 de enero de 2021.  Este artículo incorpora texto de esta fuente, la cual está en el dominio público.
  9. Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in EnglandTechnical briefing 6 13 February 2021 (See section: Nomenclature of variants in the UK, P.3) assets.publishing.service.gov.uk, accessed 27 February 2021
  10. CDC (11 de febrero de 2020). «Cases, Data, and Surveillance». Centers for Disease Control and Prevention (en inglés estadounidense). Consultado el 16 de marzo de 2021.
  11. «Tracking SARS-CoV-2 variants». www.who.int (en inglés). Consultado el 28 de noviembre de 2021.
  12. «Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern». World Health Organization. Consultado el 28 de noviembre de 2021.
  13. «New COVID-19 variant detected in South Africa». NICD (en inglés estadounidense). 25 de noviembre de 2021. Consultado el 29 de noviembre de 2021.
  14. «Kwazulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform». www.krisp.org.za. Consultado el 29 de noviembre de 2021.
  15. SARS-CoV-2 variants of concern 26 November 2021 www.ecdc.europa.eu accessed 27 November 2021
  16. Variants of concern or under investigation: data up to 24 November 2021 Updated 26 November 2021, www.gov.uk, accessed 27 November 2021
  17. COVID-19 daily epidemiology update 12 May 2021 health-infobase.canada.ca accessed 13 May 2021
  18. «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». Centers for Disease Control and Prevention (en inglés estadounidense). 11 de febrero de 2020. Consultado el 30 de abril de 2021.
  19. SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions Dec. 1, 2021 www.cdc.gov, accessed December 7, 2021
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