Récepteur nucléaire

De nombreux récepteurs nucléaires fonctionnent avant tout comme des facteurs de transcription inductibles par un ligand (comme une hormone stéroïde, mais aussi par exemple certains lipides intracellulaires). Cependant beaucoup n'ont pas de ligand identifié, ils sont dits récepteurs nucléaires orphelins. De plus, certains récepteurs nucléaires ont des effets autrement que par leur qualité de facteurs de transcription. Ils peuvent par exemple agir sur d'autres voies de signalisation intracellulaire.

Structure protéique des récepteurs nucléaires

Les récepteurs nucléaires sont des protéines dont la taille varie classiquement entre 40 et 100 kilodaltons (kDa). Ils ont été subdivisés arbitrairement en 5 (ou 6) domaines (A, B, C, D, E (F)).

• A/B : Longueur Variable, Facteur de régulation
• C : Domaine en doigt de Zinc, domaine de fixation, sur la séquence HRE (=Hormone Responsive Element), de l'ADN
• D : Charnière, permet le changement de conformation du récepteur et sa dimérisation , c'est le plus petit
• E : Domaine de fixation au ligand (hormone ..)
• F : Signalisation de localisation nucléaire (SLN)

Le domaine C, qui est le plus conservé au sein du groupe, est considéré comme la "signature" de la super-famille des récepteurs nucléaires. Il représente le domaine de liaison à l'ADN (ou DBD). Le domaine de liaison du ligand (ou LBD), se trouve au niveau du domaine E pour les ligands identifiés. On trouve également, surtout au niveau des domaines B et E, des surfaces d'interaction avec des régulateurs transcriptionnels que l'on appelle fonctions de transactivation (ou AFs pour activation functions')

Par nécessité un grand nombre de récepteurs ne peuvent avoir qu'une appellation anglophone

• Sous-famille 1: de la famille des hormones thyroïdiennes
  • Groupe A: Récepteur des hormones thyroïdiennes (Hormone thyroïdienne)
    • 1: Récepteur des hormones thyroïdiennes-α (TRα; NR1A1)
    • 2: Récepteur des hormones thyroïdiennes-β (TRβ; NR1A2)
  • Groupe B: Récepteur de l'acide rétinoïque (Vitamine A et composants associés)
    • 1: Récepteur de l'acide rétinoïque-α (RARα; NR1B1)
    • 2: Récepteur de l'acide rétinoïque-β (RARβ; NR1B2)
    • 3: Récepteur de l'acide rétinoïque-γ (RARγ; NR1B3)
  • Groupe C: Peroxisome proliferator-activated receptor
    • 1: Peroxisome proliferator-activated receptor-α (PPARα; NR1C1)
    • 2: Peroxisome proliferator-activated receptor-β (PPARβ; NR1C2)
    • 3: Peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPARγ: NR1C3)
  • Groupe D: Rev-erb
    • 1: Rev-erbα (Rev-erbα; NR1D1)
    • 2: Rev-erbβ (Rev-erbβ; NR1D2)
    • 3: E75 (E75; NR1D3)
  • Groupe E: Récepteur de la drosophile
    • 1: E78 (E78; NR1E1)
  • Groupe F: Retinoid-related orphan receptor
    • 1: Retinoid-related orphan receptor-α (RORα; NR1F1)
    • 2: Retinoid-related orphan receptor-β (RORβ; NR1F2)
    • 3: Retinoid-related orphan receptor-γ (RORγ; NR1F3)
    • 4: HR3 et CNR3 (NR1F4)
  • Groupe G: Récepteur de Caenorhabditis elegans
    • 1: CNR14 (CNR14; NR1G1)
  • Groupe H: Liver X receptor-like
    • 1: Récepteur de l'ecdysone (EcR; NR1H1)
    • 2: Liver X receptor-β ou Récepteur β à l'oxystérol (LXRβ; NR1H2)
    • 3: Liver X receptor-α ou Récepteur α à l'oxystérol (LXRα; NR1H3)
    • 4: Farnesoid X receptor (FXR; NR1H4)
  • Groupe I: Récepteur de la famille vitamine D
    • 1: Récepteur de la vitamine D (VDR; NR1I1) (vitamine D)
    • 2: Pregnane X receptor (PXR; NR1I2)
    • 3: Constitutive androstane receptor (CAR; NR1I3)
  • Groupe J: Récepteur de la drosophile
    • 1: DHR96 (DHR96; NR1J1)

• Sous famille 2: Retinoid X Receptor-like
  • Groupe A: Hepatocyte nuclear factor-4 (HNF4)
    • 1: Hepatocyte nuclear factor-4-α (HNF4α; NR2A1)
    • 2: Hepatocyte nuclear factor-4-γ (HNF4γ; NR2A2)
  • Groupe B: Retinoid X receptor (RXRα)
    • 1: Retinoid X receptor-α (RXRα; NR2B1)
    • 2: Retinoid X receptor-β (RXRβ; NR2B2)
    • 3: Retinoid X receptor-γ (RXRγ; NR2B3)
    • 4: Ultraspiracle (Usp; NR2B4)
  • Groupe C: Récepteur testiculaire
    • 1: Récepteur testiculaire 2 (TR2; NR2C1)
    • 2: Récepteur testiculaire 4 (TR4; NR2C2)
  • Groupe E: TLX/PNR
    • 1: Homologue humain du gène de Drosophile tailless (TLX; NR2E1)
    • 2: Gène de drosophile tailless (TLL; NR2E2)
    • 3: Photoreceptor-Specific Nuclear Receptor (PNR; NR2E3)
  • Groupe F: COUP/EAR
    • 1: Chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor I (COUP-TFI; NR2F1)
    • 2: Chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor II (COUP-TFII; NR2F2)
    • 6: ERBA-related 2 (EAR2; NR2F6)

• Sous Famille 3: Récepteur des hormones stéroïdes
  • Groupe A: Récepteur des œstrogènes (hormone sexuelle: Œstrogènes)
    • 1: Récepteur des œstrogènes-α (ERα; NR3A1)
    • 2: Récepteur des œstrogènes-β (ERβ; NR3A2)
  • Groupe B: Estrogen related receptor
    • 1: Estrogen related receptor-α (ERRα; NR3B1)
    • 2: Estrogen related receptor-β (ERRβ; NR3B2)
    • 3: Estrogen related receptor-γ (ERRγ; NR3B3)
  • Groupe C: Récepteurs des 3-ketostéroïdes
    • 1: Récepteur des glucocorticoïdes (GR; NR3C1) (Cortisol)
    • 2: Récepteur des minéralocorticoïdes (MR; NR3C2) (Aldostérone)
    • 3: Récepteur de la progestérone (PR; NR3C3) (hormone sexuelle: Progestérone)
    • 4: Récepteur des androgènes (AR; NR3C4) (hormone sexuelle: Testostérone)

• Sous Famille 4: Nerve Growth Factor IB-like
  • Groupe A: NGFIB/NURR1/NOR1
    • 1: Nerve Growth factor IB (NGFIB; NR4A1)
    • 2: Nuclear receptor related 1 (NURR1; NR4A2)
    • 3: Neuron-derived orphan receptor 1 (NOR1; NR4A3)

• Sous Famille 5: Steroidogenic Factor-like
  • Groupe A: SF1/LRH1
    • 1: Steroidogenic factor 1 (SF1; NR5A1)
    • 2: Liver receptor homolog 1 (LRH1; NR5A2)
  • Groupe B: Récepteur de la drosophile
    • 1: DHR39 (DHR39; NR5B1)

• Sous Famille 6: Germ Cell Nuclear Factor-like
  • Groupe A: GCN1
    • 1: Germ cell nuclear factor (GCN1; NR6A1)

• Sous Famille 0: Miscellanées
  • Groupe B: DAX/SHP
    • 1: DAX-1 (NR0B1)
    • 2: Short heterodimer partner (SHP; NR0B2)