ARID1A

ARID1A
	; Estructura tridimensional de la proteína ARID1A.
Estructuras disponibles
PDB	Buscar ortólogos: PDBe, RCSB Lista de códigos PDB 1RYU
Identificadores
Símbolos	ARID1A (HGNC: 11110) ; B120; BAF250; BAF250a; BM029; C1orf4; ELD; MRD14; OSA1; P270; SMARCF1; hELD; hOSA1
Identificadores; externos	OMIM: 603024 ; MGI: 1935147 ; HomoloGene: 21216 ; EBI: ARID1A; GeneCards: Gen ARID1A; UniProt: ARID1A;
Locus	Cr. 1 p35.3
	Referencias: AmiGO / QuickGO
Patrón de expresión de ARNm
	Más información
Ortólogos
Humano	Ratón
8289	93760
Véase HS	Véase MM
O14497	A2BH40
NM_006015	NM_001080819
NP_006006	NP_001074288
Cr. 1:; 27.02 – 27.11 Mb	Cr. 4:; 133.68 – 133.76 Mb
;

La proteína ARID1A ("dominio de interacción rico en AT de la proteína A1", del inglés "AT-rich interactive domain-containing protein 1A") es una proteína humana codificada por el gen arid1A.[1][2][3] Este gen codifica una proteína de la familia SWI/SNF, cuyos miembros tienen actividades de tipo helicasa y ATPasa, y están implicados en la regulación de la transcripción de determinados genes por medio de alteraciones en la estructura de la cromatina en la región que alberga dichos genes. La proteína codificada forma parte del complejo SNF/SWI de remodelación de la cromatina dependiente de ATP, el cual es necesario para la activación transcripcional de genes normalmente reprimidos por la estructura de la cromatina. ARID1A posee al menos dos dominios conservados que podrían ser cruciales para esta función. El primero de ellos, es un dominio de unión a ADN que puede unirse específicamente a regiones del ADN ricas en AT. El segundo de ellos, es el dominio C-terminal de la proteína el cual es capaz de estimular la activación de la transcripción de glucocorticoides dependientes de receptor. Parece ser que esta proteína confiere especificidad al complejo SNF/SWI y podría ser la responsable de reclutar y dirigir el complejo a sus dianas correspondientes por medio de interacciones proteína-ADN o proteína-proteína. Cabe destacar que han sido descritos dos transcritos diferentes provenientes del mismo gen, que dan lugar a dos isoformas de la proteína.[3]

Interacciones

La proteína ARID1A ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

SMARCB1[4][5]
SMARCA4[5][6]

Referencias

Takeuchi, T.; Furihata, M.; Heng, H. H.; Sonobe, H.; Ohtsuki, Y. (Agosto de 1998). «Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene». Gene 213 (1-2): 189-93. PMID 9630625. doi:10.1016/s0378-1119(98)00194-2.
Takeuchi, T; Chen, B. K.; Qiu, Y.; Sonobe, H.; Ohtsuki, Y. (Febrero de 1998). «Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats». Gene 204 (1-2): 71-7. PMID 9434167. doi:10.1016/s0378-1119(97)00525-8.
«Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)». Consultado el 3 de marzo de 2023.
Kato, H.; Tjernberg, A.; Zhang, W.; Krutchinsky, A. N.; An, W.; Takeuchi, T.; Ohtsuki, Y.; Sugano, S. et al. (Febrero de 2002). «SYT associates with human SNF/SWI complexes and the C-terminal region of its fusion partner SSX1 targets histones». J. Biol. Chem. (Estados Unidos) 277 (7): 5498-505. ISSN 0021-9258. PMID 11734557. doi:10.1074/jbc.M108702200.
Wang, W.; Côté, J.; Xue, Y.; Zhou, S.; Khavari, P. A.; Biggar, S. R.; Muchardt, C.; Kalpana, G. V. et al. (Octubre de 1996). «Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex». EMBO J. (Inglaterra) 15 (19): 5370-82. ISSN 0261-4189. PMC 452280. PMID 8895581.
Zhao, K.; Wang, W.; Rando, O. J.; Xue, Y.; Swiderek, K.; Kuo, A.; Crabtree, G. R. (Noviembre de 1998). «Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling». Cell (Estados Unidos) 95 (5): 625-36. ISSN 0092-8674. PMID 9845365. doi:10.1016/s0092-8674(00)81633-5.

Enlaces externos

MeSH: ARID1A+protein,+human (en inglés)

Datos: Q18032797

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[pmid9630625-1] Takeuchi, T.; Furihata, M.; Heng, H. H.; Sonobe, H.; Ohtsuki, Y. (Agosto de 1998). «Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene». Gene 213 (1-2): 189-93. PMID 9630625. doi:10.1016/s0378-1119(98)00194-2.

[pmid9434167-2] Takeuchi, T; Chen, B. K.; Qiu, Y.; Sonobe, H.; Ohtsuki, Y. (Febrero de 1998). «Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats». Gene 204 (1-2): 71-7. PMID 9434167. doi:10.1016/s0378-1119(97)00525-8.

[entrez-3] «Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)». Consultado el 3 de marzo de 2023.

[pmid11734557-4] Kato, H.; Tjernberg, A.; Zhang, W.; Krutchinsky, A. N.; An, W.; Takeuchi, T.; Ohtsuki, Y.; Sugano, S. et al. (Febrero de 2002). «SYT associates with human SNF/SWI complexes and the C-terminal region of its fusion partner SSX1 targets histones». J. Biol. Chem. (Estados Unidos) 277 (7): 5498-505. ISSN 0021-9258. PMID 11734557. doi:10.1074/jbc.M108702200.

[pmid8895581-5] Wang, W.; Côté, J.; Xue, Y.; Zhou, S.; Khavari, P. A.; Biggar, S. R.; Muchardt, C.; Kalpana, G. V. et al. (Octubre de 1996). «Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex». EMBO J. (Inglaterra) 15 (19): 5370-82. ISSN 0261-4189. PMC 452280. PMID 8895581.

[pmid9845365-6] Zhao, K.; Wang, W.; Rando, O. J.; Xue, Y.; Swiderek, K.; Kuo, A.; Crabtree, G. R. (Noviembre de 1998). «Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling». Cell (Estados Unidos) 95 (5): 625-36. ISSN 0092-8674. PMID 9845365. doi:10.1016/s0092-8674(00)81633-5.