APOBEC3F

APOBEC3F
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Human UniProt search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	3WUS, 4IOU, 4J4J, 5HX5, 5HX4
المعرفات
الأسماء المستعارة	APOBEC3F, A3F, ARP8, BK150C2.4.MRNA, KA6, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 608993 HomoloGene: 105867 GeneCards: 200316
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• cytidine deaminase activity; • ربط أيون الزنك; • ربط أيون فلزي; • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • نشاط تحفيزي; • RNA binding; • نشاط هيدرولاز; • identical protein binding;
المكونات الخلوية	• سيتوبلازم; • أجسام P; • apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex; • نواة; • ribonucleoprotein complex;
العمليات الحيوية	• negative regulation of transposition; • negative regulation of viral process; • immune system process; • base conversion or substitution editing; • negative regulation of viral genome replication; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination; • DNA demethylation; • مناعة فطرية; • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • positive regulation of defense response to virus by host; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing;
	المصادر:Amigo / QuickGO
أورثولوج
	Q8IUX4
	n/a
	‏NM_145298، ‏XM_017028642، ‏XM_047441184، ‏XM_047441185 NM_001006666، ‏NM_145298، ‏XM_017028642، ‏XM_047441184، ‏XM_047441185
	n/a
	‏NP_660341، ‏XP_016884131، ‏XP_016884132، ‏XP_024307946، ‏XP_024307947 NP_001006667، ‏NP_660341، ‏XP_016884131، ‏XP_016884132، ‏XP_024307946، ‏XP_024307947
	n/a
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان

APOBEC3F‏ (Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين APOBEC3F في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

المراجع

"APOBEC3F can inhibit the accumulation of HIV-1 reverse transcription products in the absence of hypermutation. Comparisons with APOBEC3G"، J Biol Chem، 282 (4): 2587–95، يناير 2007، doi:10.1074/jbc.M607298200، PMID 17121840.
"Entrez Gene: APOBEC3F apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F"، مؤرشف من الأصل في 05 ديسمبر 2010.
"An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22"، Genomics، 79 (3): 285–96، فبراير 2002، doi:10.1006/geno.2002.6718، PMID 11863358.

قراءة متعمقة

"Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business."، Trends Genet.، 19 (4): 207–16، 2003، doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4، PMID 12683974.
"APOBEC deaminases as cellular antiviral factors: a novel natural host defense mechanism."، Med. Sci. Monit.، 12 (5): RA92–8، 2006، PMID 16641889.
"Analysis of differential gene expression by display of 3' end restriction fragments of cDNAs."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 93 (2): 659–63، 1996، doi:10.1073/pnas.93.2.659، PMC 40108، PMID 8570611.
"Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery."، Genome Res.، 6 (9): 791–806، 1997، doi:10.1101/gr.6.9.791، PMID 8889548.
"The DNA sequence of human chromosome 22."، Nature، 402 (6761): 489–95، 1999، doi:10.1038/990031، PMID 10591208.
"Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 99 (26): 16899–903، 2003، doi:10.1073/pnas.242603899، PMC 139241، PMID 12477932.
"Human APOBEC3F is another host factor that blocks human immunodeficiency virus type 1 replication."، J. Virol.، 78 (11): 6073–6، 2004، doi:10.1128/JVI.78.11.6073-6076.2004، PMC 415831، PMID 15141007.
"A second human antiretroviral factor, APOBEC3F, is suppressed by the HIV-1 and HIV-2 Vif proteins."، EMBO J.، 23 (12): 2451–8، 2004، doi:10.1038/sj.emboj.7600246، PMC 423288، PMID 15152192.
"APOBEC3F properties and hypermutation preferences indicate activity against HIV-1 in vivo."، Curr. Biol.، 14 (15): 1385–91، 2004، doi:10.1016/j.cub.2004.06.050، PMID 15296757.
"A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome."، Genome Biol.، 5 (10): R84، 2005، doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84، PMC 545604، PMID 15461802.
"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."، Genome Res.، 14 (10B): 2121–7، 2004، doi:10.1101/gr.2596504، PMC 528928، PMID 15489334.
"The retroviral hypermutation specificity of APOBEC3F and APOBEC3G is governed by the C-terminal DNA cytosine deaminase domain."، J. Biol. Chem.، 280 (12): 10920–4، 2005، doi:10.1074/jbc.M500382200، PMID 15647250.
"Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes."، Genome Res.، 16 (1): 55–65، 2006، doi:10.1101/gr.4039406، PMC 1356129، PMID 16344560.
"Comparative analysis of the antiretroviral activity of APOBEC3G and APOBEC3F from primates."، Virology، 349 (1): 31–40، 2006، doi:10.1016/j.virol.2005.12.035، PMID 16460778.
"Differential requirement for conserved tryptophans in human immunodeficiency virus type 1 Vif for the selective suppression of APOBEC3G and APOBEC3F."، J. Virol.، 80 (6): 3112–5، 2006، doi:10.1128/JVI.80.6.3112-3115.2006، PMC 1395459، PMID 16501124.
"APOBEC3B and APOBEC3F inhibit L1 retrotransposition by a DNA deamination-independent mechanism."، J. Biol. Chem.، 281 (25): 16837–41، 2006، doi:10.1074/jbc.M602367200، PMID 16648136.
"Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies."، PLoS Pathog.، 2 (5): e41، 2006، doi:10.1371/journal.ppat.0020041، PMC 1458959، PMID 16699599.

بوابة الكيمياء الحيوية
بوابة طب
بوابة علم الأحياء
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] "APOBEC3F can inhibit the accumulation of HIV-1 reverse transcription products in the absence of hypermutation. Comparisons with APOBEC3G"، J Biol Chem، 282 (4): 2587–95، يناير 2007، doi:10.1074/jbc.M607298200، PMID 17121840.

[2] "Entrez Gene: APOBEC3F apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F"، مؤرشف من الأصل في 05 ديسمبر 2010.

[3] "An anthropoid-specific locus of orphan C to U RNA-editing enzymes on chromosome 22"، Genomics، 79 (3): 285–96، فبراير 2002، doi:10.1006/geno.2002.6718، PMID 11863358.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 608993
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000491387, ENST00000308521, ENST00000381565, ENST00000476513