HNRPU

HNRNPU
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1ZRJ
المعرفات
الأسماء المستعارة	HNRNPU, HNRPU, SAF-A, U21.1, hnRNP U, SAFA, -AS1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A), heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, antisense RNA 1, C1orf199, NCRNA00201, EIEE54, pp120, GRIP120, DEE54
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602869 MGI: MGI:1858195 HomoloGene: 22991 GeneCards: 3192
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• nucleotide binding; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • telomerase RNA binding; • RNA binding; • RNA polymerase II complex binding; • TFIIH-class transcription factor complex binding; • ربط دي إن إي; • chromatin binding; • double-stranded DNA binding; • single-stranded DNA binding; • ‏GO:0001106 transcription corepressor activity; • double-stranded RNA binding; • single-stranded RNA binding; • mRNA 3'-UTR binding; • actin binding; • poly(A) binding; • snRNA binding; • poly(C) RNA binding; • chromatin DNA binding; • poly(G) binding; • pre-mRNA binding; • ribonucleoprotein complex binding; • ‏GO:0032403 protein-containing complex binding; • sequence-specific double-stranded DNA binding; • ATP binding; • identical protein binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II C-terminal domain binding; • promoter-specific chromatin binding; • ‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
المكونات الخلوية	• CRD-mediated mRNA stability complex; • سيتوبلازم; • catalytic step 2 spliceosome; • غشاء; • بلازم نووي; • telomerase holoenzyme complex; • حبيبة رنا; • spliceosomal complex; • نواة; • ‏GO:0005578 نسيج خارج الخلية; • nuclear chromosome; • cell surface; • مصفوفة نووية; • nuclear speck; • ‏GO:0009327 protein-containing complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • inactive sex chromosome; • ribonucleoprotein complex; • حيز حركي; • جسيم مركزي; • midbody; • mitotic spindle; • mitotic spindle midzone; • mitotic spindle microtubule; • السنترومير; • spindle pole; • كروموسومات; • microtubule organizing center; • جهاز مغزلي; • هيكل خلوي; • dendrite cytoplasm;
العمليات الحيوية	• CRD-mediated mRNA stabilization; • mRNA splicing, via spliceosome; • ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • rhythmic process; • mRNA processing; • osteoblast differentiation; • تضفير الآر أن إيه; • RNA metabolic process; • ‏GO:1901313 positive regulation of gene expression; • circadian regulation of gene expression; • cardiac muscle cell development; • cellular response to dexamethasone stimulus; • ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • negative regulation of kinase activity; • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • mRNA stabilization; • maintenance of protein location in nucleus; • cellular response to glucocorticoid stimulus; • RNA localization to chromatin; • positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity; • positive regulation of stem cell proliferation; • regulation of mitotic cell cycle; • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني; • regulation of mitotic spindle assembly; • ‏GO:1903308، ‏GO:0001672، ‏GO:0010848، ‏GO:1902649 regulation of chromatin organization; • positive regulation of attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore; • protein localization to spindle microtubule; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • negative regulation of stem cell differentiation; • ‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization; • دورة الخلية; • نمو متعدد الخلايا; • تمايز خلوي; • انقسام خلوي; • positive regulation of brown fat cell differentiation; • dendritic transport of messenger ribonucleoprotein complex; • adaptive thermogenesis;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ; ; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q00839; Q5RI18
	Q8VEK3
	‏NM_004501، ‏NM_031844 NR_026778، ‏NM_004501، ‏NM_031844
	‏XM_017321672، ‏XM_017321673، ‏XM_017321674 NM_016805، ‏XM_017321672، ‏XM_017321673، ‏XM_017321674
	‏NP_114032 NP_004492، ‏NP_114032
	‏XP_036008205، ‏XP_036008206، ‏XP_036008208، ‏XP_036008210 NP_058085، ‏XP_036008205، ‏XP_036008206، ‏XP_036008208، ‏XP_036008210
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

HNRPU‏ (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين HNRPU في الإنسان.[1][2]

المراجع

"Purification of two isoforms of hnRNP-U and characterization of their nucleic acid binding activity"، Biochemistry، 33 (34): 10416–22، سبتمبر 1994، doi:10.1021/bi00200a024، PMID 8068679.
"hnRNP-U/SAF-A is encoded by two differentially polyadenylated mRNAs in human cells"، Biochim Biophys Acta، 1217 (2): 232–4، مارس 1994، doi:10.1016/0167-4781(94)90044-2، PMID 7509195.

قراءة متعمقة

"Primary structure and binding activity of the hnRNP U protein: binding RNA through RGG box."، EMBO J.، 11 (7): 2655–64، 1992، PMC 556741، PMID 1628625.
"Binding sites of the Epstein-Barr virus and C3d receptor (CR2, CD21) for its three intracellular ligands, the p53 anti-oncoprotein, the p68 calcium binding protein and the nuclear p120 ribonucleoprotein."، Mol. Immunol.، 32 (6): 389–97، 1995، doi:10.1016/0161-5890(95)00005-Y، PMID 7753047.
"Human spleen tyrosine kinase p72Syk associates with the Src-family kinase p53/56Lyn and a 120-kDa phosphoprotein."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 92 (2): 359–63، 1995، doi:10.1073/pnas.92.2.359، PMC 42739، PMID 7831290.
"Major cell surface-located protein substrates of an ecto-protein kinase are homologs of known nuclear proteins."، Biochemistry، 33 (49): 14696–706، 1995، doi:10.1021/bi00253a007، PMID 7993898.
"A novel nuclear structure containing the survival of motor neurons protein."، EMBO J.، 15 (14): 3555–65، 1996، PMC 451956، PMID 8670859.
"A novel membrane glycoprotein, SHPS-1, that binds the SH2-domain-containing protein tyrosine phosphatase SHP-2 in response to mitogens and cell adhesion."، Mol. Cell. Biol.، 16 (12): 6887–99، 1997، PMC 231692، PMID 8943344.
"Thymocyte activation induces the association of phosphatidylinositol 3-kinase and pp120 with CD5."، Eur. J. Immunol.، 27 (3): 679–86، 1997، doi:10.1002/eji.1830270316، PMID 9079809.
"The class III POU factor Brn-4 interacts with other class III POU factors and the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U."، Brain Res. Mol. Brain Res.، 45 (1): 99–107، 1997، doi:10.1016/S0169-328X(96)00238-0، PMID 9105675.
"The glucocorticoid receptor is associated with the RNA-binding nuclear matrix protein hnRNP U."، J. Biol. Chem.، 272 (45): 28471–8، 1997، doi:10.1074/jbc.272.45.28471، PMID 9353307.
"The novel SAR-binding domain of scaffold attachment factor A (SAF-A) is a target in apoptotic nuclear breakdown."، EMBO J.، 16 (24): 7361–71، 1998، doi:10.1093/emboj/16.24.7361، PMC 1170336، PMID 9405365.
"Polypyrimidine tract-binding protein interacts with HnRNP L."، FEBS Lett.، 425 (3): 401–6، 1998، doi:10.1016/S0014-5793(98)00269-5، PMID 9563502.
"Retrovirus integration site Mintb encoding the mouse homolog of hnRNP U."، J. Biochem.، 125 (6): 1104–14، 1999، doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022392، PMID 10348913.
"hnRNP U inhibits carboxy-terminal domain phosphorylation by TFIIH and represses RNA polymerase II elongation."، Mol. Cell. Biol.، 19 (10): 6833–44، 2000، PMC 84680، PMID 10490622.
"Apoptotic cleavage of scaffold attachment factor A (SAF-A) by caspase-3 occurs at a noncanonical cleavage site."، J. Biol. Chem.، 275 (7): 5031–6، 2000، doi:10.1074/jbc.275.7.5031، PMID 10671544.
"Proteomic analysis of NMDA receptor-adhesion protein signaling complexes."، Nat. Neurosci.، 3 (7): 661–9، 2000، doi:10.1038/76615، PMID 10862698.
"Necdin interacts with the ribonucleoprotein hnRNP U in the nuclear matrix."، J. Cell. Biochem.، 84 (3): 545–55، 2002، doi:10.1002/jcb.10047، PMID 11813259.
"PABP1 identified as an arginine methyltransferase substrate using high-density protein arrays."، EMBO Rep.، 3 (3): 268–73، 2002، doi:10.1093/embo-reports/kvf052، PMC 1084016، PMID 11850402.
"Pseudosubstrate regulation of the SCF(beta-TrCP) ubiquitin ligase by hnRNP-U."، Genes Dev.، 16 (4): 439–51، 2002، doi:10.1101/gad.218702، PMC 155337، PMID 11850407.

بوابة طب
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة الكيمياء الحيوية

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[pmid8068679-1] "Purification of two isoforms of hnRNP-U and characterization of their nucleic acid binding activity"، Biochemistry، 33 (34): 10416–22، سبتمبر 1994، doi:10.1021/bi00200a024، PMID 8068679.

[pmid7509195-2] "hnRNP-U/SAF-A is encoded by two differentially polyadenylated mRNAs in human cells"، Biochim Biophys Acta، 1217 (2): 232–4، مارس 1994، doi:10.1016/0167-4781(94)90044-2، PMID 7509195.