SYNCRIP

SYNCRIP
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2DGU, 2MXT, 2NBB
المعرفات
الأسماء المستعارة	SYNCRIP, GRY-RBP, GRYRBP, HNRNPQ, HNRPQ1, NSAP1, PP68, hnRNP-Q, synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 616686 MGI: MGI:1891690 HomoloGene: 4648 GeneCards: 10492
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• poly(A) binding; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • ربط حمض نووي; • RNA binding; • mRNA binding; • mRNA 5'-UTR binding;
المكونات الخلوية	• CRD-mediated mRNA stability complex; • سيتوبلازم; • catalytic step 2 spliceosome; • histone pre-mRNA 3'end processing complex; • intracellular membrane-bounded organelle; • بلازم نووي; • شبكة إندوبلازمية; • GAIT complex; • spliceosomal complex; • نواة; • غشاء; • ribonucleoprotein complex;
العمليات الحيوية	• CRD-mediated mRNA stabilization; • mRNA splicing, via spliceosome; • ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة; • negative regulation of translation; • mRNA processing; • osteoblast differentiation; • تضفير الآر أن إيه; • cellular response to interferon-gamma; • ‏GO:0022415 viral process; • regulation of translation;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ; ; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	O60506
	Q7TMK9
	‏NM_001159673، ‏NM_001159674، ‏NM_001159675، ‏NM_001159676، ‏NM_001159677، ‏NM_001253771، ‏NM_006372، ‏XM_005248635، ‏XM_005248636، ‏XM_017010176، ‏XM_017010177، ‏XM_017010178، ‏XM_017010179، ‏XM_047418081، ‏XM_047418082، ‏XM_047418083 XM_005248637، ‏NM_001159673، ‏NM_001159674، ‏NM_001159675، ‏NM_001159676، ‏NM_001159677، ‏NM_001253771، ‏NM_006372، ‏XM_005248635، ‏XM_005248636، ‏XM_017010176، ‏XM_017010177، ‏XM_017010178، ‏XM_017010179، ‏XM_047418081، ‏XM_047418082، ‏XM_047418083
	‏NM_019666، ‏NM_019796، ‏XM_006511293، ‏XM_006511294، ‏NM_001311113 NM_001284328، ‏NM_019666، ‏NM_019796، ‏XM_006511293، ‏XM_006511294، ‏NM_001311113
	‏NP_001153146، ‏NP_001153147، ‏NP_001153148، ‏NP_001153149، ‏NP_001240700، ‏NP_006363، ‏XP_005248692، ‏XP_005248693، ‏XP_005248694، ‏XP_016865665، ‏XP_016865666، ‏XP_016865667، ‏XP_016865668، ‏XP_016865669 NP_001153145، ‏NP_001153146، ‏NP_001153147، ‏NP_001153148، ‏NP_001153149، ‏NP_001240700، ‏NP_006363، ‏XP_005248692، ‏XP_005248693، ‏XP_005248694، ‏XP_016865665، ‏XP_016865666، ‏XP_016865667، ‏XP_016865668، ‏XP_016865669
	‏NP_001298042، ‏NP_062640، ‏NP_062770، ‏XP_006511356، ‏XP_006511357 NP_001271257، ‏NP_001298042، ‏NP_062640، ‏NP_062770، ‏XP_006511356، ‏XP_006511357
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

SYNCRIP‏ (Synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SYNCRIP في الإنسان.[1][2][3]

المراجع

"Entrez Gene: SYNCRIP synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein"، مؤرشف من الأصل في 07 ديسمبر 2019.
"Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome"، Biochemical and Biophysical Research Communications، 282 (4): 977–83، أبريل 2001، doi:10.1006/bbrc.2001.4679، PMID 11352648.
"A novel heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-like protein interacts with NS1 of the minute virus of mice"، Journal of Virology، 73 (1): 72–80، يناير 1999، PMC 103810، PMID 9847309.

قراءة متعمقة

"Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides"، Gene، 138 (1–2): 171–4، يناير 1994، doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8، PMID 8125298.
"Identification of two tyrosine phosphoproteins, pp70 and pp68, which interact with phospholipase Cgamma, Grb2, and Vav after B cell antigen receptor activation"، The Journal of Biological Chemistry، 272 (43): 27362–8، أكتوبر 1997، doi:10.1074/jbc.272.43.27362، PMID 9341187.
"Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library"، Gene، 200 (1–2): 149–56، أكتوبر 1997، doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3، PMID 9373149.
"Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex"، Nature Genetics، 20 (1): 46–50، سبتمبر 1998، doi:10.1038/1700، PMID 9731529.
"SYNCRIP, a cytoplasmic counterpart of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, interacts with ubiquitous synaptotagmin isoforms"، The Journal of Biological Chemistry، 275 (13): 9823–31، مارس 2000، doi:10.1074/jbc.275.13.9823، PMID 10734137.
"A mechanism for translationally coupled mRNA turnover: interaction between the poly(A) tail and a c-fos RNA coding determinant via a protein complex"، Cell، 103 (1): 29–40، سبتمبر 2000، doi:10.1016/S0092-8674(00)00102-1، PMID 11051545.
"Identification of GRY-RBP as an apolipoprotein B RNA-binding protein that interacts with both apobec-1 and apobec-1 complementation factor to modulate C to U editing"، The Journal of Biological Chemistry، 276 (13): 10272–83، مارس 2001، doi:10.1074/jbc.M006435200، PMID 11134005.
"SMN interacts with a novel family of hnRNP and spliceosomal proteins"، The EMBO Journal، 20 (19): 5443–52، أكتوبر 2001، doi:10.1093/emboj/20.19.5443، PMC 125643، PMID 11574476.
"Specific interaction of Smn, the spinal muscular atrophy determining gene product, with hnRNP-R and gry-rbp/hnRNP-Q: a role for Smn in RNA processing in motor axons?"، Human Molecular Genetics، 11 (1): 93–105، يناير 2002، doi:10.1093/hmg/11.1.93، PMID 11773003.
"Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis"، Rna، 8 (4): 426–39، أبريل 2002، doi:10.1017/S1355838202021088، PMC 1370266، PMID 11991638.
"Identification of pp68 as the Tyrosine-phosphorylated Form of SYNCRIP/NSAP1. A cytoplasmic RNA-binding protein"، The Journal of Biological Chemistry، 277 (28): 25233–8، يوليو 2002، doi:10.1074/jbc.M202556200، PMID 11994298.
"Hyperphosphorylated C-terminal repeat domain-associating proteins in the nuclear proteome link transcription to DNA/chromatin modification and RNA processing"، Molecular & Cellular Proteomics، 1 (8): 598–610، أغسطس 2002، doi:10.1074/mcp.M200029-MCP200، PMID 12376575.
"A receptor for activated C kinase is part of messenger ribonucleoprotein complexes associated with polyA-mRNAs in neurons"، The Journal of Neuroscience، 22 (20): 8827–37، أكتوبر 2002، PMID 12388589.
"Signaling initiated by overexpression of the fibroblast growth factor receptor-1 investigated by mass spectrometry"، Molecular & Cellular Proteomics، 2 (1): 29–36، يناير 2003، doi:10.1074/mcp.M200075-MCP200، PMID 12601080.
"Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D)"، Biological Chemistry، 384 (1): 25–37، يناير 2003، doi:10.1515/BC.2003.004، PMID 12674497.
"A cellular RNA-binding protein enhances internal ribosomal entry site-dependent translation through an interaction downstream of the hepatitis C virus polyprotein initiation codon"، Molecular and Cellular Biology، 24 (18): 7878–90، سبتمبر 2004، doi:10.1128/MCB.24.18.7878-7890.2004، PMC 515056، PMID 15340051.
"Human hnRNP Q re-localizes to cytoplasmic granules upon PMA, thapsigargin, arsenite and heat-shock treatments"، Experimental Cell Research، 315 (6): 968–80، أبريل 2009، doi:10.1016/j.yexcr.2009.01.012، PMID 19331829.
"Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D)"، Biological Chemistry، 384 (1): 25–37، يناير 2003، doi:10.1515/BC.2003.004، ISSN 1431-6730، PMID 12674497.

بوابة طب
بوابة الكيمياء الحيوية
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[entrez-1] "Entrez Gene: SYNCRIP synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein"، مؤرشف من الأصل في 07 ديسمبر 2019.

[pmid11352648-2] "Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome"، Biochemical and Biophysical Research Communications، 282 (4): 977–83، أبريل 2001، doi:10.1006/bbrc.2001.4679، PMID 11352648.

[pmid9847309-3] "A novel heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-like protein interacts with NS1 of the minute virus of mice"، Journal of Virology، 73 (1): 72–80، يناير 1999، PMC 103810، PMID 9847309.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 616686
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000616122, ENST00000355238, ENST00000369622, ENST00000444272, ENST00000677481, ENST00000678816, ENST00000678618, ENST00000676630, ENST00000678528, ENST00000678355, ENST00000678899, ENST00000676542, ENST00000677771, ENST00000678930, ENST00000677646, ENST00000676688, ENST00000678589, ENST00000677514, ENST00000676637, ENST00000677059, ENST00000678878