PRPF19

PRPF19
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	4LG8
المعرفات
الأسماء المستعارة	PRPF19, NMP200, PRP19, PSO4, SNEV, UBOX4, hPSO4, pre-mRNA processing factor 19
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 608330 MGI: MGI:106247 HomoloGene: 6421 GeneCards: 27339
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• ‏GO:1904264، ‏GO:1904822، ‏GO:0090622، ‏GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • ‏GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin-ubiquitin ligase activity; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • identical protein binding; • نشاط انتقالي;
المكونات الخلوية	• site of double-strand break; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • غشاء; • lipid droplet; • جهاز مغزلي; • Prp19 complex; • DNA replication factor A complex; • spliceosomal complex; • هيكل خلوي; • نواة; • سيتوبلازم; • بلازم نووي; • U2-type catalytic step 1 spliceosome; • U2-type catalytic step 2 spliceosome;
العمليات الحيوية	• mRNA splicing, via spliceosome; • spliceosomal tri-snRNP complex assembly; • lipid biosynthetic process; • negative regulation of neuron differentiation; • positive regulation of astrocyte differentiation; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein K63-linked ubiquitination; • mRNA processing; • protein polyubiquitination; • inner cell mass cell proliferation; • cellular response to DNA damage stimulus; • spliceosomal complex assembly; • protein ubiquitination; • proteasomal protein catabolic process; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • ‏GO:0100026 ترميم الدنا; • تضفير الآر أن إيه; • generation of catalytic spliceosome for first transesterification step; • positive regulation of neuron differentiation;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q9UMS4; H0YGF3
	Q99KP6
	NM_014502
	‏NM_001253844، ‏NM_134129 NM_001253843، ‏NM_001253844، ‏NM_134129
	NP_055317
	‏NP_001240773، ‏NP_598890 NP_001240772، ‏NP_001240773، ‏NP_598890
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

PRPF19‏ (Pre-mRNA processing factor 19) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين PRPF19 في الإنسان.[1][1][2]

المراجع

"Entrez Gene: PRPF19 PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae)"، مؤرشف من الأصل في 05 ديسمبر 2010.
Mahajan KN, Mitchell BS (سبتمبر 2003)، "Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase"، Proc Natl Acad Sci U S A، 100 (19): 10746–51، Bibcode:2003PNAS..10010746M، doi:10.1073/pnas.1631060100، PMC 196874، PMID 12960389.

قراءة متعمقة

"Reassembling proteins and chaperones in human nuclear matrix protein fractions."، J. Cell. Biochem.، 74 (2): 145–51، 1999، doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19990801)74:2<145::AID-JCB1>3.0.CO;2-#، PMID 10404385.
"hNMP 200: a novel human common nuclear matrix protein combining structural and regulatory functions."، Exp. Cell Res.، 261 (1): 166–79، 2000، doi:10.1006/excr.2000.5025، PMID 11082287.
"Directed proteomic analysis of the human nucleolus."، Curr. Biol.، 12 (1): 1–11، 2002، doi:10.1016/S0960-9822(01)00650-9، PMID 11790298.
"Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis."، RNA، 8 (4): 426–39، 2002، doi:10.1017/S1355838202021088، PMC 1370266، PMID 11991638.
"Functional proteomic analysis of human nucleolus."، Mol. Biol. Cell، 13 (11): 4100–9، 2003، doi:10.1091/mbc.E02-05-0271، PMC 133617، PMID 12429849.
"Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 99 (26): 16899–903، 2003، Bibcode:2002PNAS...9916899M، doi:10.1073/pnas.242603899، PMC 139241، PMID 12477932.
"A subset of human 35S U5 proteins, including Prp19, function prior to catalytic step 1 of splicing."، EMBO J.، 23 (12): 2381–91، 2004، doi:10.1038/sj.emboj.7600241، PMC 423283، PMID 15175653.
"Proteomic, functional, and domain-based analysis of in vivo 14-3-3 binding proteins involved in cytoskeletal regulation and cellular organization."، Curr. Biol.، 14 (16): 1436–50، 2004، doi:10.1016/j.cub.2004.07.051، PMID 15324660.
"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."، Genome Res.، 14 (10B): 2121–7، 2004، doi:10.1101/gr.2596504، PMC 528928، PMID 15489334.
"Nucleolar proteome dynamics."، Nature، 433 (7021): 77–83، 2005، Bibcode:2005Natur.433...77A، doi:10.1038/nature03207، PMID 15635413.
"Interaction of U-box E3 ligase SNEV with PSMB4, the beta7 subunit of the 20 S proteasome."، Biochem. J.، 388 (Pt 2): 593–603، 2005، doi:10.1042/BJ20041517، PMC 1138967، PMID 15660529.
"Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network."، Nature، 437 (7062): 1173–8، 2005، Bibcode:2005Natur.437.1173R، doi:10.1038/nature04209، PMID 16189514.
"The Pso4 mRNA splicing and DNA repair complex interacts with WRN for processing of DNA interstrand cross-links."، J. Biol. Chem.، 280 (49): 40559–67، 2006، doi:10.1074/jbc.M508453200، PMID 16223718.
"SNEV is an evolutionarily conserved splicing factor whose oligomerization is necessary for spliceosome assembly."، Nucleic Acids Res.، 33 (21): 6868–83، 2005، doi:10.1093/nar/gki986، PMC 1310963، PMID 16332694.
"SNEV overexpression extends the life span of human endothelial cells."، Exp. Cell Res.، 312 (6): 746–59، 2006، doi:10.1016/j.yexcr.2005.11.025، PMID 16388800.
Lu X, Legerski RJ (2007)، "The Prp19/Pso4 core complex undergoes ubiquitylation and structural alterations in response to DNA damage."، Biochem. Biophys. Res. Commun.، 354 (4): 968–74، doi:10.1016/j.bbrc.2007.01.097، PMC 1810354، PMID 17276391.
"Early embryonic lethality of mice lacking the essential protein SNEV."، Mol. Cell. Biol.، 27 (8): 3123–30، 2007، doi:10.1128/MCB.01188-06، PMC 1899945، PMID 17283042.
"Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry."، Mol. Syst. Biol.، 3 (1): 89، 2007، doi:10.1038/msb4100134، PMC 1847948، PMID 17353931.

بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
بوابة طب

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[entrez-1] "Entrez Gene: PRPF19 PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae)"، مؤرشف من الأصل في 05 ديسمبر 2010.

[pmid12960389-2] Mahajan KN, Mitchell BS (سبتمبر 2003)، "Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase"، Proc Natl Acad Sci U S A، 100 (19): 10746–51، Bibcode:2003PNAS..10010746M، doi:10.1073/pnas.1631060100، PMC 196874، PMID 12960389.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 608330
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000546152, ENST00000227524, ENST00000535326, ENST00000539180, ENST00000539960, ENST00000540473, ENST00000541371