TDP1

TDP1
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1JY1, 1MU7, 1MU9, 1NOP, 1QZQ, 1RFF, 1RFI, 1RG1, 1RG2, 1RGT, 1RGU, 1RH0
المعرفات
الأسماء المستعارة	TDP1, tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607198 MGI: MGI:1920036 HomoloGene: 5424 GeneCards: 55775
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• phosphoric diester hydrolase activity; • single-stranded DNA binding; • nuclease activity; • double-stranded DNA binding; • 3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity; • exonuclease activity; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • نشاط هيدرولاز;
المكونات الخلوية	• سيتوبلازم; • غشاء خلوي; • intracellular membrane-bounded organelle; • نواة;
العمليات الحيوية	• single strand break repair; • double-strand break repair; • ‏GO:0100026 ترميم الدنا; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • cellular response to DNA damage stimulus;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q9NUW8
	Q8BJ37
	‏NM_001008744، ‏NM_018319، ‏XM_005267847، ‏XM_005267848، ‏XM_006720197، ‏XM_006720198، ‏XM_006720199، ‏XM_011536942، ‏XM_011536943، ‏XM_011536944، ‏XM_017021439، ‏XM_017021440، ‏XM_017021441، ‏XM_017021442، ‏XM_017021443، ‏XM_017021444، ‏XM_017021445، ‏XM_017021446، ‏XR_001750427، ‏NM_001330205 XR_943492، ‏NM_001008744، ‏NM_018319، ‏XM_005267847، ‏XM_005267848، ‏XM_006720197، ‏XM_006720198، ‏XM_006720199، ‏XM_011536942، ‏XM_011536943، ‏XM_011536944، ‏XM_017021439، ‏XM_017021440، ‏XM_017021441، ‏XM_017021442، ‏XM_017021443، ‏XM_017021444، ‏XM_017021445، ‏XM_017021446، ‏XR_001750427، ‏NM_001330205
	‏XM_006515364، ‏XM_030246506، ‏XM_030246507 NM_028354، ‏XM_006515364، ‏XM_030246506، ‏XM_030246507
	‏NP_001317134، ‏NP_060789، ‏XP_005267905، ‏XP_006720260، ‏XP_011535244، ‏XP_011535246، ‏XP_016876928، ‏XP_016876929، ‏XP_024305417، ‏XP_024305418، ‏XP_024305419، ‏XP_024305420، ‏XP_024305421، ‏XP_024305422، ‏XP_024305423، ‏XP_024305424، ‏XP_024305425، ‏XP_024305426، ‏XP_024305427 NP_001008744، ‏NP_001317134، ‏NP_060789، ‏XP_005267905، ‏XP_006720260، ‏XP_011535244، ‏XP_011535246، ‏XP_016876928، ‏XP_016876929، ‏XP_024305417، ‏XP_024305418، ‏XP_024305419، ‏XP_024305420، ‏XP_024305421، ‏XP_024305422، ‏XP_024305423، ‏XP_024305424، ‏XP_024305425، ‏XP_024305426، ‏XP_024305427
	n/a
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

TDP1‏ (Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين TDP1 في الإنسان.[1][2][3]

المراجع

"Entrez Gene: TDP1 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.
"Mutation of TDP1, encoding a topoisomerase I-dependent DNA damage repair enzyme, in spinocerebellar ataxia with محور عصبي اعتلال الأعصاب المحيطية"، Nat Genet، 32 (2): 267–72، سبتمبر 2002، doi:10.1038/ng987، PMID 12244316.
"The crystal structure of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase, Tdp1"، Structure، 10 (2): 237–48، فبراير 2002، doi:10.1016/S0969-2126(02)00707-4، PMID 11839309.

قراءة متعمقة

"TDP1-dependent DNA single-strand break repair and neurodegeneration."، Mutagenesis، 21 (4): 219–24، 2007، doi:10.1093/mutage/gel024، PMID 16775218.
"Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery."، Genome Res.، 6 (9): 791–806، 1997، doi:10.1101/gr.6.9.791، PMID 8889548.
"Yeast gene for a Tyr-DNA phosphodiesterase that repairs topoisomerase I complexes."، Science، 286 (5439): 552–5، 1999، doi:10.1126/science.286.5439.552، PMID 10521354.
"The tyrosyl-DNA phosphodiesterase Tdp1 is a member of the phospholipase D superfamily."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 98 (21): 12009–14، 2001، doi:10.1073/pnas.211429198، PMC 59758، PMID 11572945.
"Conversion of phosphoglycolate to phosphate termini on 3' overhangs of DNA double strand breaks by the human tyrosyl-DNA phosphodiesterase hTdp1."، J. Biol. Chem.، 277 (30): 27162–8، 2002، doi:10.1074/jbc.M204688200، PMID 12023295.
"Insights into substrate binding and catalytic mechanism of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase (Tdp1) from vanadate and tungstate-inhibited structures."، J. Mol. Biol.، 324 (5): 917–32، 2003، doi:10.1016/S0022-2836(02)01154-3، PMID 12470949.
"Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences."، Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.، 99 (26): 16899–903، 2003، doi:10.1073/pnas.242603899، PMC 139241، PMID 12477932.
"The DNA sequence and analysis of human chromosome 14."، Nature، 421 (6923): 601–7، 2003، doi:10.1038/nature01348، PMID 12508121.
"Crystal structure of a transition state mimic for Tdp1 assembled from vanadate, DNA, and a topoisomerase I-derived peptide."، Chem. Biol.، 10 (2): 139–47، 2003، doi:10.1016/S1074-5521(03)00021-8، PMID 12618186.
"Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs."، Nat. Genet.، 36 (1): 40–5، 2004، doi:10.1038/ng1285، PMID 14702039.
"Explorations of peptide and oligonucleotide binding sites of tyrosyl-DNA phosphodiesterase using vanadate complexes."، J. Med. Chem.، 47 (4): 829–37، 2004، doi:10.1021/jm030487x، PMID 14761185.
"Analysis of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase I catalytic residues."، J. Mol. Biol.، 338 (5): 895–906، 2004، doi:10.1016/j.jmb.2004.03.013، PMID 15111055.
"Site-directed mutagenesis of human soluble calcium-activated nucleotidase 1 (hSCAN-1): identification of residues essential for enzyme activity and the Ca(2+)-induced conformational change."، Biochemistry، 43 (28): 9185–94، 2004، doi:10.1021/bi049565o، PMID 15248776.
"The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)."، Genome Res.، 14 (10B): 2121–7، 2004، doi:10.1101/gr.2596504، PMC 528928، PMID 15489334.
"TDP1 overexpression in human cells counteracts DNA damage mediated by topoisomerases I and II."، J. Biol. Chem.، 279 (53): 55618–25، 2005، doi:10.1074/jbc.M405042200، PMID 15494395.
"Deficiency in 3'-phosphoglycolate processing in human cells with a hereditary mutation in tyrosyl-DNA phosphodiesterase (TDP1)."، Nucleic Acids Res.، 33 (1): 289–97، 2005، doi:10.1093/nar/gki170، PMC 546157، PMID 15647511.
"Defective DNA single-strand break repair in spinocerebellar ataxia with axonal neuropathy-1."، Nature، 434 (7029): 108–13، 2005، doi:10.1038/nature03314، PMID 15744309.
"Substrate specificity of tyrosyl-DNA phosphodiesterase I (Tdp1)."، J. Biol. Chem.، 280 (23): 22029–35، 2005، doi:10.1074/jbc.M502148200، PMID 15811850.

بوابة طب
بوابة الكيمياء الحيوية
بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] "Entrez Gene: TDP1 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1"، مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2010.

[2] "Mutation of TDP1, encoding a topoisomerase I-dependent DNA damage repair enzyme, in spinocerebellar ataxia with محور عصبي اعتلال الأعصاب المحيطية"، Nat Genet، 32 (2): 267–72، سبتمبر 2002، doi:10.1038/ng987، PMID 12244316.

[3] "The crystal structure of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase, Tdp1"، Structure، 10 (2): 237–48، فبراير 2002، doi:10.1016/S0969-2126(02)00707-4، PMID 11839309.

التصنيفات الطبية	OMIM ID: 607198
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000557782, ENST00000335725, ENST00000393452, ENST00000393454, ENST00000545686, ENST00000553527, ENST00000553569, ENST00000553617, ENST00000553989, ENST00000554180, ENST00000554976, ENST00000555178, ENST00000555565, ENST00000555880, ENST00000556063, ENST00000556498, ENST00000556867